Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs6g12670.1
CDS Infomation

gene=Cs6g12670
Sequence

ATGAACTCTTCCGCCACAGCAACGATTCTCCCTCAACCTTTTCTTCCGCATCAACAAAAC
CCCAACCAAAACCTCACAACTACACCCCAAATCTCTATACAAACTAACAACAGCAAATCC
ACTGTAAACCCTACAGTTCAATGGACCTCTTCTATATCTCGCCATTGCCGCAGCGGCCGC
ATAGCCGAAGCCGCTTTAGAGTTTACTCGCATGACACTCCACGGCACCAATCCGAATCAC
ATCACTTTCATCACCCTTCTTTCGGGTTGCGCTGATTTTCCATCGCAATGCTTGTTTTTA
GGTGCGATGATTCATGGGCTTGTTTGTAAACTGGGGTTGGATAGAAATAATGTGATGGTA
GGCACCGCACTTTTGGACATGTACGCCAAATTTGGTCGAATGGATTTGGCTACGGTGGTT
TTTGATGCGATGAGAGTTAAAAGTTCGTTTACTTGGAATGCAATGATTGATGGGTACATG
AGGCGTGGGGATATTGAATCTGCAGTTAGAATGTTTGATGAAATGCCTGTGAGGGATGCG
ATTTCCTGGACTGCTTTGCTTAATGGGTTTGTTAAGAGGGGTTATTTTGAGGAAGCACTG
GAGTGTTTTCGAGAAATGCAGATTTCTGGGGTGGAGCCAGATTATGTAACCATTATTTCA
GTTCTAAATGCGTGTGCCAATGTCGGGACGCTTGGTATAGGCTTGTGGATACATCGATAT
GTTCTAAAGCAAGACTTTAAAGACAATGTCAAGGTATGTAATACGTTAATTGATTTGTAT
TCTAGATGCGGCTGCATTGAATTTGCTCGTCAAGTGTTTCAAAGGATGCATAAGCGAACA
TTAGTGTCTTGGAACTCGATTATTGTGGGTTTTGCAGTTAACGGGTTCGTGGGGGAAGCT
TTGGAGTATTTCAATTCGATGCAGAAAGAAGGGTTCAAACCAGATGGAGTCAGTTTCACA
GGGGCACTAACTGCCTGTAGCCATGCTGGTTTAATTGAAGACGGACTTCGATATTTTGAC
ATTATGAAGAAAATTTATAGAGTCTCTCCTCGGATTGAGCATTATGGTTGCATAGTGGAT
CTTTATAGCCGTGCAGGGAGATTGGAGGATGCATTAAATGTCGTAGAAAATATGCCGATG
AAGCCAAATGAAGTTGTGTTGGGTTCATTGCTGGCAGCATGTAGGACTAAGGGTGATATC
ATCTTAGCAGAAAGATTAATGAAGTATCTAGTAGACTTGGATCCTGGCGTTGATTCCAAT
TATGTGCTTCTTGCGAATATGTATGCGGCTGTTGGAAAATGGGATGGTGCGGGTAAGATT
AGGAGAACAATGAAGGGTCGTGGTATACAGAAGAAGCCAGGACTTAGTTCAATTGAGATT
GGGAGTGGCATTCATGAATTTATGGCTGGCGATAGGTCGCATATAGAGTCAGAGCACATC
TATTCAATGTTAGAGCTTCTTTCTTTTGATTTGAAATTATGTGGTTATGTTCCAGAAACA
GTTGCCGGAGAATTATATGAAAATGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs6g12670.1
PEP Infomation
Sequence

MNSSATATILPQPFLPHQQNPNQNLTTTPQISIQTNNSKSTVNPTVQWTSSISRHCRSGR
IAEAALEFTRMTLHGTNPNHITFITLLSGCADFPSQCLFLGAMIHGLVCKLGLDRNNVMV
GTALLDMYAKFGRMDLATVVFDAMRVKSSFTWNAMIDGYMRRGDIESAVRMFDEMPVRDA
ISWTALLNGFVKRGYFEEALECFREMQISGVEPDYVTIISVLNACANVGTLGIGLWIHRY
VLKQDFKDNVKVCNTLIDLYSRCGCIEFARQVFQRMHKRTLVSWNSIIVGFAVNGFVGEA
LEYFNSMQKEGFKPDGVSFTGALTACSHAGLIEDGLRYFDIMKKIYRVSPRIEHYGCIVD
LYSRAGRLEDALNVVENMPMKPNEVVLGSLLAACRTKGDIILAERLMKYLVDLDPGVDSN
YVLLANMYAAVGKWDGAGKIRRTMKGRGIQKKPGLSSIEIGSGIHEFMAGDRSHIESEHI
YSMLELLSFDLKLCGYVPETVAGELYEND*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs6g12670.1
Transcript Infomation

gene=Cs6g12670 CDS=1-1530
Sequence

ATGAACTCTTCCGCCACAGCAACGATTCTCCCTCAACCTTTTCTTCCGCATCAACAAAAC
CCCAACCAAAACCTCACAACTACACCCCAAATCTCTATACAAACTAACAACAGCAAATCC
ACTGTAAACCCTACAGTTCAATGGACCTCTTCTATATCTCGCCATTGCCGCAGCGGCCGC
ATAGCCGAAGCCGCTTTAGAGTTTACTCGCATGACACTCCACGGCACCAATCCGAATCAC
ATCACTTTCATCACCCTTCTTTCGGGTTGCGCTGATTTTCCATCGCAATGCTTGTTTTTA
GGTGCGATGATTCATGGGCTTGTTTGTAAACTGGGGTTGGATAGAAATAATGTGATGGTA
GGCACCGCACTTTTGGACATGTACGCCAAATTTGGTCGAATGGATTTGGCTACGGTGGTT
TTTGATGCGATGAGAGTTAAAAGTTCGTTTACTTGGAATGCAATGATTGATGGGTACATG
AGGCGTGGGGATATTGAATCTGCAGTTAGAATGTTTGATGAAATGCCTGTGAGGGATGCG
ATTTCCTGGACTGCTTTGCTTAATGGGTTTGTTAAGAGGGGTTATTTTGAGGAAGCACTG
GAGTGTTTTCGAGAAATGCAGATTTCTGGGGTGGAGCCAGATTATGTAACCATTATTTCA
GTTCTAAATGCGTGTGCCAATGTCGGGACGCTTGGTATAGGCTTGTGGATACATCGATAT
GTTCTAAAGCAAGACTTTAAAGACAATGTCAAGGTATGTAATACGTTAATTGATTTGTAT
TCTAGATGCGGCTGCATTGAATTTGCTCGTCAAGTGTTTCAAAGGATGCATAAGCGAACA
TTAGTGTCTTGGAACTCGATTATTGTGGGTTTTGCAGTTAACGGGTTCGTGGGGGAAGCT
TTGGAGTATTTCAATTCGATGCAGAAAGAAGGGTTCAAACCAGATGGAGTCAGTTTCACA
GGGGCACTAACTGCCTGTAGCCATGCTGGTTTAATTGAAGACGGACTTCGATATTTTGAC
ATTATGAAGAAAATTTATAGAGTCTCTCCTCGGATTGAGCATTATGGTTGCATAGTGGAT
CTTTATAGCCGTGCAGGGAGATTGGAGGATGCATTAAATGTCGTAGAAAATATGCCGATG
AAGCCAAATGAAGTTGTGTTGGGTTCATTGCTGGCAGCATGTAGGACTAAGGGTGATATC
ATCTTAGCAGAAAGATTAATGAAGTATCTAGTAGACTTGGATCCTGGCGTTGATTCCAAT
TATGTGCTTCTTGCGAATATGTATGCGGCTGTTGGAAAATGGGATGGTGCGGGTAAGATT
AGGAGAACAATGAAGGGTCGTGGTATACAGAAGAAGCCAGGACTTAGTTCAATTGAGATT
GGGAGTGGCATTCATGAATTTATGGCTGGCGATAGGTCGCATATAGAGTCAGAGCACATC
TATTCAATGTTAGAGCTTCTTTCTTTTGATTTGAAATTATGTGGTTATGTTCCAGAAACA
GTTGCCGGAGAATTATATGAAAATGATTGAGTTTTGG