Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs6g08950.1
CDS Infomation

gene=Cs6g08950
Sequence

ATGGCTACTCCTCCAATTCCAATAGCTTACCAACAGGAGCTGCCGGCAGTCCCCGACTGG
CTCAACAAAGGTGACAGTGCATGGCAGATGACGGCATCGACACTCGTCGGAATCCAAAGC
ATGCCGGGTCTCCTTATCATATACGCCAGCATCGTCAAGAAAAAGTGGGCAGTCAACTCA
GCCTTCATGGTGCTCTATGCCTTTGCTGCCGTGCTCATTTGCTGGGTCCTTGTATGCTAT
CGCATGGCTTTTGGTGACCAACTGCTCCCTTTCTGGGGCAAGGGCGCCCCTGCTCTAGGC
CAAAAGTACCTTGTTGGTCGAGCCAGAGTCCCAGAAAGCACCCACGAAGTTGATGGCAAA
ACTGTGACCACTGAACCTTTCTATGCTATGGCTACACTTGTGTATTTTCAGTTCACTTTT
GCTGCGATCACGGTTATTTTGCTAGCCGGCTCCGTTCTTGGTCGAATGAATATCAGGGCC
TGGATGGCCTTTGTGCCGTTATGGCTCATGTTTTCTTACACTGTAGGTGCTTTTAGTCTT
TGGGGTGGTGGCTTCCTTTATCAGTGGGGTGTCATTGATTATTCTGGTGGCTATGTTATT
CACGTCTCCTCAGGAATTGCCGGTCTCACTGCCGCCTATTGGGTTGGACCCAGGCTAAAG
AGCGACAAAGAGAGGTTTCCTCCGAATAATGTGCTGCTCATGCTTGCGGGAGCCGGGCTG
CTGTGGATGGGATGGTCGGGTTTCAACGGTGGGGCTCCTTATGCTGCTCATATCGCCTCT
TCGATCGCTATTCTAAACACAAATGTAGCGGCGGCCACGAGCCTTCTTGTTTGGACATGT
CTTGATGTTATCTTCTTTGGGAAGCCTTCAGTTATCGGAGCTGTTCAGGGCATGATGACT
GGCCTTGTTTGCATCACCCCAGGAGCTGGGCTGGTACAATCATGGGCGGCTATTGTAATG
GGCATTCTTTCTGGTAGCATTCCATGGGTAACTATGATGATTCTTCACAAGAAGTGTAGT
CTTCTTCAACAGGTGGATGACACACTGGCTGTGTTTCACACGCACGCGGTGACTGGGCTG
TTGGGCGGGCTACTGACCGGGCTATTTGCGGAGCCACAACTGTGCAAGCTCACACTACCA
GAGCCCACAAGAGGAGCATTCTACGGGGGGAAAGGCGGGGTGCAATTTCTGAAGCAGATT
GTTGGGGCTCTGTTTGTTATCGCCTGGAATTTAGTTTCCACAACAATCATTCTCCTGGCA
ATAAGGATATTCATTCCATTGAGAATGCCTGAGGAGCAGCTCGCGATCGGAGATGACGCC
GTTCACGGAGAAGAAGCTTACGCTCTCTGGGGCGACGGAGAGAAGTATGACCCGAGAAAG
CACGGCTGGCATGGGTCTTCCTACTCGGAGGACATTGCACCGTCGCCCTATGTTAATGGT
GCACGAGGGGTTACCATTAACCTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs6g08950.1
PEP Infomation
Sequence

MATPPIPIAYQQELPAVPDWLNKGDSAWQMTASTLVGIQSMPGLLIIYASIVKKKWAVNS
AFMVLYAFAAVLICWVLVCYRMAFGDQLLPFWGKGAPALGQKYLVGRARVPESTHEVDGK
TVTTEPFYAMATLVYFQFTFAAITVILLAGSVLGRMNIRAWMAFVPLWLMFSYTVGAFSL
WGGGFLYQWGVIDYSGGYVIHVSSGIAGLTAAYWVGPRLKSDKERFPPNNVLLMLAGAGL
LWMGWSGFNGGAPYAAHIASSIAILNTNVAAATSLLVWTCLDVIFFGKPSVIGAVQGMMT
GLVCITPGAGLVQSWAAIVMGILSGSIPWVTMMILHKKCSLLQQVDDTLAVFHTHAVTGL
LGGLLTGLFAEPQLCKLTLPEPTRGAFYGGKGGVQFLKQIVGALFVIAWNLVSTTIILLA
IRIFIPLRMPEEQLAIGDDAVHGEEAYALWGDGEKYDPRKHGWHGSSYSEDIAPSPYVNG
ARGVTINL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs6g08950.1
Transcript Infomation

gene=Cs6g08950 CDS=215-1681
Sequence

CATCACTTAAGTCGGAAAAAGTAGCTGAAAATCCTTTGAATTTTCACACGAACTTTCAAA
GACATTTCCAAATTAGCATGCTAAACAAACAATTGATGGTCCCCAAAGCTTTGATCCAGT
TCCGTATATACATACAAATAATACAACAAGTCTATGATAAACACAACTGCTAACAAAATT
ATATTTTCACAGAGTTGAGCTTCAGCCTTGAGCCATGGCTACTCCTCCAATTCCAATAGC
TTACCAACAGGAGCTGCCGGCAGTCCCCGACTGGCTCAACAAAGGTGACAGTGCATGGCA
GATGACGGCATCGACACTCGTCGGAATCCAAAGCATGCCGGGTCTCCTTATCATATACGC
CAGCATCGTCAAGAAAAAGTGGGCAGTCAACTCAGCCTTCATGGTGCTCTATGCCTTTGC
TGCCGTGCTCATTTGCTGGGTCCTTGTATGCTATCGCATGGCTTTTGGTGACCAACTGCT
CCCTTTCTGGGGCAAGGGCGCCCCTGCTCTAGGCCAAAAGTACCTTGTTGGTCGAGCCAG
AGTCCCAGAAAGCACCCACGAAGTTGATGGCAAAACTGTGACCACTGAACCTTTCTATGC
TATGGCTACACTTGTGTATTTTCAGTTCACTTTTGCTGCGATCACGGTTATTTTGCTAGC
CGGCTCCGTTCTTGGTCGAATGAATATCAGGGCCTGGATGGCCTTTGTGCCGTTATGGCT
CATGTTTTCTTACACTGTAGGTGCTTTTAGTCTTTGGGGTGGTGGCTTCCTTTATCAGTG
GGGTGTCATTGATTATTCTGGTGGCTATGTTATTCACGTCTCCTCAGGAATTGCCGGTCT
CACTGCCGCCTATTGGGTTGGACCCAGGCTAAAGAGCGACAAAGAGAGGTTTCCTCCGAA
TAATGTGCTGCTCATGCTTGCGGGAGCCGGGCTGCTGTGGATGGGATGGTCGGGTTTCAA
CGGTGGGGCTCCTTATGCTGCTCATATCGCCTCTTCGATCGCTATTCTAAACACAAATGT
AGCGGCGGCCACGAGCCTTCTTGTTTGGACATGTCTTGATGTTATCTTCTTTGGGAAGCC
TTCAGTTATCGGAGCTGTTCAGGGCATGATGACTGGCCTTGTTTGCATCACCCCAGGAGC
TGGGCTGGTACAATCATGGGCGGCTATTGTAATGGGCATTCTTTCTGGTAGCATTCCATG
GGTAACTATGATGATTCTTCACAAGAAGTGTAGTCTTCTTCAACAGGTGGATGACACACT
GGCTGTGTTTCACACGCACGCGGTGACTGGGCTGTTGGGCGGGCTACTGACCGGGCTATT
TGCGGAGCCACAACTGTGCAAGCTCACACTACCAGAGCCCACAAGAGGAGCATTCTACGG
GGGGAAAGGCGGGGTGCAATTTCTGAAGCAGATTGTTGGGGCTCTGTTTGTTATCGCCTG
GAATTTAGTTTCCACAACAATCATTCTCCTGGCAATAAGGATATTCATTCCATTGAGAAT
GCCTGAGGAGCAGCTCGCGATCGGAGATGACGCCGTTCACGGAGAAGAAGCTTACGCTCT
CTGGGGCGACGGAGAGAAGTATGACCCGAGAAAGCACGGCTGGCATGGGTCTTCCTACTC
GGAGGACATTGCACCGTCGCCCTATGTTAATGGTGCACGAGGGGTTACCATTAACCTTTG
AGTATTCTGGATTGTGTTAGTTTCTGTAAGCTTACTGTAAATACAGTTTTGTAAGTTGAA
TGATTTGAATGATTAACCGAATGTTGATTTTCCTTTATCATCTCCAAACCTGTTGGTGAA
AATCAGATGCCATCTTGTTGCTTTCGTGAGTCAAGAACAAAAGTCAAAGATCCGTTTGTA
GCTATTGTACTTCATCTCAATTTTACTTAACATAACAGTGAA