Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs6g05090.2
CDS Infomation	gene=Cs6g05090
Sequence	ATGGAATCGGAGGACGAATTCGATATGCAAGACGCGAACGCATCGGCGGAGGAAGACGAT TTCTATAGCGGCGGCGATGACGATGCGGCACCTGCCTATGCATTCGACAGCGACGATGCT GATGTGGCCGATTACGAGTTCATCGACAATGATTCCGATGATTCTGATGATCTCGTCTCT AATCGCCATCAGCTAAACTACACCGTTTTGACTGAAGCGGATATTCGTCAGCGTCAAGAG GAGGATATAACGAGGATATCTACCGTGCTCTCTATTTCAAAAGTTGCAGCTAGCATCCTG CTCCGCTTTTATAATTGGAGTGTCAGTAAAGTACATGATGAATGGTTTGCTGATGAAGAA AGGGTTCGAAAGGCTGTTGGCTTGTTAGAGAAACCAGCTGTTCAATTTCCAGATGGTGAA GAAATGACTTGTGGTATATGCTTTGAAAATTATCCGAGTGATAGATTGCTTGCTGCTGCT TGTGGCCATCCCTTTTGTAGTTCATGCTGGACAGGGTATATCAGCACAGCCATTAATGAT GGTCCTGGGTGTTTGATGTTGCGATGTCCTGATCCTTCTTGTGGTGCTGCTGTCGGTCAA GATATGATTTATTTATTGTCTTCTGATGAAGATAAAGTAAAGTATAATCGTTATTTCATT CGGTCTTATGTTGAAGACAACAGAAAGACGAAGTGGTGTCCTGCTCCCGGTTGTGATTAT GCTGTGGATTTTGTTGTTGGTAGTGGAAACTATGATGTTACTTGCCGCTGTTCATATAGC TTTTGCTGGAATTGTACAGAGGAAGCTCACCGTCCTGTAGACTGTGATACCGTAGCCAAG TGGGTACTGAAGAATAGTGCTGAGTCAGAAAATATGAATTGGATACTGGCTAATTCCAAG CCTTGTCCAAGGTGCAAGCGACCAATTGAGAAAAACCAAGGCTGTATGCATATGACATGC ACACCTCCGTGTAAATTCGAATTTTGCTGGCTCTGCCTTGGTCAATGGTCAGATCATGGT GAGAGGACAGGTGGTTTCTACGCATGTAACCGCTATGAGACAGCAAAACAAGAGGGAGTT TATGATGAGTCTGAAAAGCGAAGAGAGATGGCGAAAAACTCTCTGGAGAGATATACTCAC TATTATGAACGATGGGCGACAAACCAATCGTCTAGGCAAAAAGCATTGGCAGACCTACAG CAAATGCAGACTGTTCATCTTGAGAAGCTAAGCGATGTACAGTGCCAACCCGAGTCACAG CTCAAGTTCATCACAGAAGCCTGGCTACAGATAGTTGAATGTAGGCGGGTTCTAAAGTGG ACATATGCGTATGGATATTATTTGCCGGACCATGAACATGCTAAGAGACAGTTCTTTGAG TATTTGCAAGGTATGCCAGATCCTCCATTTCCGTGCTGGTATTTTGCTTATGTTTGGTTT GTTCTAATTACAACTGTACCTGTAGGTGAAGCTGAGTCTGGGTTGGAAAGACTGCATCAA TGTGCAGAGAAGGAGCTTCAAATTTACCTTAATGCAGATGGCCCCTCAAAAGATTTTAAT GAATTCAGAACAAAACTTGCTGGATTGACAAGTGTGACAAGGAATTACTTTGAGAATTTG GTCCGAGCTCTTGAAAATGGTCTGTCAGATGTAGATACGCACGCTACCTGTAGCAGGACA GGGAGCTCAAAGAGCTTGGGAGGTACAAGTAGGGGAAGAAGTGGGAAGAATAAGGGTTCG ACATCCAGATCAAGTGGGTCCAATAAAAACATTGATGATTCCAGTCACTGGTACTGTGAC CAGTGCACATATGCGAATGTCAATTCTGCCACTGCCTGTGCGATGTGCCAGCATAGTCGG TAA

Peptide Sequence

PEP ID	Cs6g05090.2
PEP Infomation
Sequence	MESEDEFDMQDANASAEEDDFYSGGDDDAAPAYAFDSDDADVADYEFIDNDSDDSDDLVS NRHQLNYTVLTEADIRQRQEEDITRISTVLSISKVAASILLRFYNWSVSKVHDEWFADEE RVRKAVGLLEKPAVQFPDGEEMTCGICFENYPSDRLLAAACGHPFCSSCWTGYISTAIND GPGCLMLRCPDPSCGAAVGQDMIYLLSSDEDKVKYNRYFIRSYVEDNRKTKWCPAPGCDY AVDFVVGSGNYDVTCRCSYSFCWNCTEEAHRPVDCDTVAKWVLKNSAESENMNWILANSK PCPRCKRPIEKNQGCMHMTCTPPCKFEFCWLCLGQWSDHGERTGGFYACNRYETAKQEGV YDESEKRREMAKNSLERYTHYYERWATNQSSRQKALADLQQMQTVHLEKLSDVQCQPESQ LKFITEAWLQIVECRRVLKWTYAYGYYLPDHEHAKRQFFEYLQGMPDPPFPCWYFAYVWF VLITTVPVGEAESGLERLHQCAEKELQIYLNADGPSKDFNEFRTKLAGLTSVTRNYFENL VRALENGLSDVDTHATCSRTGSSKSLGGTSRGRSGKNKGSTSRSSGSNKNIDDSSHWYCD QCTYANVNSATACAMCQHSR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs6g05090.2
Transcript Infomation	gene=Cs6g05090 CDS=1-1863
Sequence	ATGGAATCGGAGGACGAATTCGATATGCAAGACGCGAACGCATCGGCGGAGGAAGACGAT TTCTATAGCGGCGGCGATGACGATGCGGCACCTGCCTATGCATTCGACAGCGACGATGCT GATGTGGCCGATTACGAGTTCATCGACAATGATTCCGATGATTCTGATGATCTCGTCTCT AATCGCCATCAGCTAAACTACACCGTTTTGACTGAAGCGGATATTCGTCAGCGTCAAGAG GAGGATATAACGAGGATATCTACCGTGCTCTCTATTTCAAAAGTTGCAGCTAGCATCCTG CTCCGCTTTTATAATTGGAGTGTCAGTAAAGTACATGATGAATGGTTTGCTGATGAAGAA AGGGTTCGAAAGGCTGTTGGCTTGTTAGAGAAACCAGCTGTTCAATTTCCAGATGGTGAA GAAATGACTTGTGGTATATGCTTTGAAAATTATCCGAGTGATAGATTGCTTGCTGCTGCT TGTGGCCATCCCTTTTGTAGTTCATGCTGGACAGGGTATATCAGCACAGCCATTAATGAT GGTCCTGGGTGTTTGATGTTGCGATGTCCTGATCCTTCTTGTGGTGCTGCTGTCGGTCAA GATATGATTTATTTATTGTCTTCTGATGAAGATAAAGTAAAGTATAATCGTTATTTCATT CGGTCTTATGTTGAAGACAACAGAAAGACGAAGTGGTGTCCTGCTCCCGGTTGTGATTAT GCTGTGGATTTTGTTGTTGGTAGTGGAAACTATGATGTTACTTGCCGCTGTTCATATAGC TTTTGCTGGAATTGTACAGAGGAAGCTCACCGTCCTGTAGACTGTGATACCGTAGCCAAG TGGGTACTGAAGAATAGTGCTGAGTCAGAAAATATGAATTGGATACTGGCTAATTCCAAG CCTTGTCCAAGGTGCAAGCGACCAATTGAGAAAAACCAAGGCTGTATGCATATGACATGC ACACCTCCGTGTAAATTCGAATTTTGCTGGCTCTGCCTTGGTCAATGGTCAGATCATGGT GAGAGGACAGGTGGTTTCTACGCATGTAACCGCTATGAGACAGCAAAACAAGAGGGAGTT TATGATGAGTCTGAAAAGCGAAGAGAGATGGCGAAAAACTCTCTGGAGAGATATACTCAC TATTATGAACGATGGGCGACAAACCAATCGTCTAGGCAAAAAGCATTGGCAGACCTACAG CAAATGCAGACTGTTCATCTTGAGAAGCTAAGCGATGTACAGTGCCAACCCGAGTCACAG CTCAAGTTCATCACAGAAGCCTGGCTACAGATAGTTGAATGTAGGCGGGTTCTAAAGTGG ACATATGCGTATGGATATTATTTGCCGGACCATGAACATGCTAAGAGACAGTTCTTTGAG TATTTGCAAGGTATGCCAGATCCTCCATTTCCGTGCTGGTATTTTGCTTATGTTTGGTTT GTTCTAATTACAACTGTACCTGTAGGTGAAGCTGAGTCTGGGTTGGAAAGACTGCATCAA TGTGCAGAGAAGGAGCTTCAAATTTACCTTAATGCAGATGGCCCCTCAAAAGATTTTAAT GAATTCAGAACAAAACTTGCTGGATTGACAAGTGTGACAAGGAATTACTTTGAGAATTTG GTCCGAGCTCTTGAAAATGGTCTGTCAGATGTAGATACGCACGCTACCTGTAGCAGGACA GGGAGCTCAAAGAGCTTGGGAGGTACAAGTAGGGGAAGAAGTGGGAAGAATAAGGGTTCG ACATCCAGATCAAGTGGGTCCAATAAAAACATTGATGATTCCAGTCACTGGTACTGTGAC CAGTGCACATATGCGAATGTCAATTCTGCCACTGCCTGTGCGATGTGCCAGCATAGTCGG TAAATATATATCCCTTCTGCAGAGTGACCCAACTGGATGGAGAGACATCGGCTTTGCCTC ACTGACTATTAGGTGTCAACGGCAGCATTGCCAGGGGAAGAAGTAAGTCTCTGTTTATTC TCTTGGAATTCAAAGTGATTACAAATGAAATTGAAAATAAGGGTGGGGAGGGGAATCAAG GAAGAATTTGTTCCGTCTTGTGTTCTTGGAATAGAATCTGTATATAGTTTATTTCATGCA CGTCAGTCTTAACTTAATTCTGCCATGTGTCAGGGTCGACGGAAAATGTATTATTAATCG TTAGTCTTTGTGGTCATTTATTTAGAATTTGTATTCGCTTGAACCTTTCAAGTGGATTGC AAAAGTGGAAGCTACTTGGGGATAATGAGCTGCATTGTCACCTGGCCAGGATGAAATAAA TTTGTTTTGCCAATGTCTTGATGGCCTTCTTGTGTGGCAAGCACTTTGTATTATGTATAC TGTGAAAGGTTATTATTGGTTACTATTGCTAATGAAAGTTCCCGTTGGTCCTCATGT