Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs6g02200.2
CDS Infomation	gene=Cs6g02200
Sequence	ATGGGCAACAATCTTAATGCCGAATTATCCAAGAAAACTATTTTTGGTATTAAGGTTTGG GAAGTAATTGGAATTTCTGTTGCATTATTCATCATTATTATTCTCTCTGTATTATCATTT TGCTTAACATCGAGGAAAAAATCAAGAAGGGCTAGAAACAACCTGCCCTTCAGTCAAATC CCCACTGTTTCTAAGGAAATAAAGGAAGTTAGGGTGGAGCAAGTATCAACGAATGAGTTT GTTCAGCGTGATGGTATTCTTCTTACTATTCATGACAAATCCAGTGACAAAGAGTCAGAT AAGGTTATGGTTCATTTGGGTATGGGAAAATTGAAGAAGGGAGATAATAGCAGTCATTCA GGTTCTTTTCATCATACAGATAAAGATGGAGGGTCTATATCAGGGGAAGATTCAGGCAGC GTAACTGTGTACAAGCCATCTTCTTCACATCCCATTACGGCTCCTTCTCCTCTTATTGGT CTGCCTGAGTTTTCTCAATTGGGATGGGGCCACTGGTTTACATTAAGGGATCTTGAACTT GCTACCAACCGATTTTCAAAGGAAAACGTCCTTGGTGAGGGTGGATATGGAGTTGTTTAT CGGGGAAATTTGATCAATGGGTCTCCAGTGGCAGTTAAGAAGATCCTGAATAACGTGGGC CAGGCAGAGAAAGAATTCAGAGTGGAAGTTGAAGCCATTGGCCATGTCCGCCACAAGAAT TTGGTTCGTCTTCTAGGGTATTGTATTGAAGGAATTCATAGGATGTTGGTTTATGAGTAT GTCAACAATGGAAATTTAGAACAGTGGCTTCATGGAGCTATGCGTCATCATGGATATCTT ACTTGGGAGGCCCGTATGAAGGTTCTTCTTGGCACAGCTAAGGCTCTTGCCTATCTGCAT GAGGCTATTGAGCCTAAAGTGGTTCACCGGGACATTAAATCAAGCAATATATTGATTGAC GATGACTTCAATGCAAAAGTTTCTGATTTTGGCTTGGCTAAGTTGCTGGGTGCTGGGAAA AGTCATGTCACAACTCGAGTTATGGGGACATTTGGATATGTGGCTCCGGAGTATGCAAAT ACTGGTCTGTTGAATGAGAAAAGTGATGTTTATAGCTTTGGGGTTCTGCTTTTGGAAGCA ATAACTGGTAGAGACCCTGTGGACCACGGTCGTCCTGCACATGAGGTAAATTTGGTCGAT TGGCTGAAGATGATGGTTGGAAGCAGGAGGTCAGAGGAAGTGGTGGACCCAAATATTGAG GTAAGGCCATCGACAAGAGCTCTAAAGCGTTCCCTTTTGACAGCATTACGGTGCGTTGAT CCAGATTCAGAAAAAAGACCCAAAATGAGCCAAGTTGTGCGCATGCTTGAGTCCGAGGAA TATCCTATAGTAAGAGAGGTCAATTTTTCTAACTCAAATTTACATAAGCTGATTAGAACT ATATTAATGAACAGTTGTTTTTACTTTTTACTCTCTTCAATAATTTTATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Cs6g02200.2
PEP Infomation
Sequence	MGNNLNAELSKKTIFGIKVWEVIGISVALFIIIILSVLSFCLTSRKKSRRARNNLPFSQI PTVSKEIKEVRVEQVSTNEFVQRDGILLTIHDKSSDKESDKVMVHLGMGKLKKGDNSSHS GSFHHTDKDGGSISGEDSGSVTVYKPSSSHPITAPSPLIGLPEFSQLGWGHWFTLRDLEL ATNRFSKENVLGEGGYGVVYRGNLINGSPVAVKKILNNVGQAEKEFRVEVEAIGHVRHKN LVRLLGYCIEGIHRMLVYEYVNNGNLEQWLHGAMRHHGYLTWEARMKVLLGTAKALAYLH EAIEPKVVHRDIKSSNILIDDDFNAKVSDFGLAKLLGAGKSHVTTRVMGTFGYVAPEYAN TGLLNEKSDVYSFGVLLLEAITGRDPVDHGRPAHEVNLVDWLKMMVGSRRSEEVVDPNIE VRPSTRALKRSLLTALRCVDPDSEKRPKMSQVVRMLESEEYPIVREVNFSNSNLHKLIRT ILMNSCFYFLLSSIIL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs6g02200.2
Transcript Infomation	gene=Cs6g02200 CDS=638-2128
Sequence	AAAAAACACTAAAAAAGGCATAGGGAAAGCTGAGAAAATGAAATGACTGATAATCAGTCG GCTTCAAAGCAGATTAATCAAACGAAAAAAACTCTACAAATTCTTGCATTATGCTTGTGT TTTACTTTCACTACAAAATGTAATGTAATGTGTTGCAAGGCATCTAAAACTCATCACCTA CCGCTGATAACTCCATCTCTTCTTCTTCCTTCCTTTCTCTCTTATCATCCCCCCATCACT CAATAAACTCACAACACCTACGACACCACCACCACCACCACCACCAACACAAAAAACAAA AACATATTTTCAATACTTCCATATGTCCATTTGCTCTTTGGTACAAACACAACAGAGTCA CCCGCCTTCTGTTGTGGTCTTTGGTGCAAGAAAGCTCTTTCGCAGCTTAGATTTAAGACT CACATTTGCCTTTTCGCTCACAACCCAGATTACAAAATCAAGTCTTTTTGGCTATGTAGT TTAAATTTCCTATCTTTCATCAACTGGCTTTGGTTTTGGTTTCTTTTTCTTGCTCTTCAC ATGGGTGGTTTTTTTGGTATGAGATCTGGGTGGCTGTGTTGAAAGAGTTGCAAAGATCTG AACTTTGACGGTTGTGGACATCTGGAAGTAGAAAAGTATGGGCAACAATCTTAATGCCGA ATTATCCAAGAAAACTATTTTTGGTATTAAGGTTTGGGAAGTAATTGGAATTTCTGTTGC ATTATTCATCATTATTATTCTCTCTGTATTATCATTTTGCTTAACATCGAGGAAAAAATC AAGAAGGGCTAGAAACAACCTGCCCTTCAGTCAAATCCCCACTGTTTCTAAGGAAATAAA GGAAGTTAGGGTGGAGCAAGTATCAACGAATGAGTTTGTTCAGCGTGATGGTATTCTTCT TACTATTCATGACAAATCCAGTGACAAAGAGTCAGATAAGGTTATGGTTCATTTGGGTAT GGGAAAATTGAAGAAGGGAGATAATAGCAGTCATTCAGGTTCTTTTCATCATACAGATAA AGATGGAGGGTCTATATCAGGGGAAGATTCAGGCAGCGTAACTGTGTACAAGCCATCTTC TTCACATCCCATTACGGCTCCTTCTCCTCTTATTGGTCTGCCTGAGTTTTCTCAATTGGG ATGGGGCCACTGGTTTACATTAAGGGATCTTGAACTTGCTACCAACCGATTTTCAAAGGA AAACGTCCTTGGTGAGGGTGGATATGGAGTTGTTTATCGGGGAAATTTGATCAATGGGTC TCCAGTGGCAGTTAAGAAGATCCTGAATAACGTGGGCCAGGCAGAGAAAGAATTCAGAGT GGAAGTTGAAGCCATTGGCCATGTCCGCCACAAGAATTTGGTTCGTCTTCTAGGGTATTG TATTGAAGGAATTCATAGGATGTTGGTTTATGAGTATGTCAACAATGGAAATTTAGAACA GTGGCTTCATGGAGCTATGCGTCATCATGGATATCTTACTTGGGAGGCCCGTATGAAGGT TCTTCTTGGCACAGCTAAGGCTCTTGCCTATCTGCATGAGGCTATTGAGCCTAAAGTGGT TCACCGGGACATTAAATCAAGCAATATATTGATTGACGATGACTTCAATGCAAAAGTTTC TGATTTTGGCTTGGCTAAGTTGCTGGGTGCTGGGAAAAGTCATGTCACAACTCGAGTTAT GGGGACATTTGGATATGTGGCTCCGGAGTATGCAAATACTGGTCTGTTGAATGAGAAAAG TGATGTTTATAGCTTTGGGGTTCTGCTTTTGGAAGCAATAACTGGTAGAGACCCTGTGGA CCACGGTCGTCCTGCACATGAGGTAAATTTGGTCGATTGGCTGAAGATGATGGTTGGAAG CAGGAGGTCAGAGGAAGTGGTGGACCCAAATATTGAGGTAAGGCCATCGACAAGAGCTCT AAAGCGTTCCCTTTTGACAGCATTACGGTGCGTTGATCCAGATTCAGAAAAAAGACCCAA AATGAGCCAAGTTGTGCGCATGCTTGAGTCCGAGGAATATCCTATAGTAAGAGAGGTCAA TTTTTCTAACTCAAATTTACATAAGCTGATTAGAACTATATTAATGAACAGTTGTTTTTA CTTTTTACTCTCTTCAATAATTTTATGAAGCATAACCTCATTCTATTCTCTTCATCTTAC TTATGGTTGCTTGTATTCAGCTCTTTCCAATTGAGCCTTTGCTGAGGATTTTGTTTTGCT GAATTTGTATGAAACTCATCCTTTTTCAGGATCGAAGACACCGAAGAACTCAGGGAGGCA CCAGTATGGAGATTGAATCCCAGAAAGAAAATTCTGACACAGACCGGAGTGATTATCCGG GTTCAAGGTCGGAGAGCAAGCGGACATAACTGGAACAAACAAATCATTTTTCAGAATTGG AGGGATTTAAAATTCGACATGGAGGGGGGGGGGGTTAATTACAAAATTTTT