Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs5g31040.1
CDS Infomation

gene=Cs5g31040
Sequence

ATGTCTGAACTGATCGAAGGTCTCCCGGACGCTGTTGCCCTCAGGTGCCTTGCTCGGGTT
CCCTTCTTCCTACATCCTAAGTTGGAGCTTGTTTCTCGTTCCTGGAGAGCTGCTATTCGT
AGCCCTGAGCTGTTTAAAGCCCGACAGGAGGTTGGTTCATCAGAGAATTTACTATGCGTG
TGTGCTTTTGATCCTGAGAATTTATGGCAGCTTTATGACCCTCTCAGAGACCTTTGGATT
ACTCTTCCTGTTCTTCCCTCAAAAATTAGGCACCTTGCTCACTTTGGTGTTGTCTCCACT
GCTGGAAAACTGTTTGTACTTGGTGGTGGCAGTGATGCTGTTGACCCATTGACTGGGGAC
CAAGATGGAAGCTTCGCTACCAATGAGGTCTGGTCATATGACCCGGTAACACGTCAGTGG
TCTCCACGTGCATCCATGCTTGTGCCTCGTGCTATGTTTGCATGCTGCGCATTGAAGGAA
AAAATTGTTGTCGCAGGTGGTTTCACCAGTTGCCGGAAGTCAATTTCTCAAGCAGAAATG
TATGATCCTGAGAAGGATGTCTGGGTCCCAATTCCTGATCTCCATCGCACTCATAATTCA
GCATGCACAGGAGTGGTTATTGGAGGAAAGGTGCATGTCTTGCACAAAGGGCTGTCAACC
GTACAAGTGTTAGATCATATGGGTCTTGGGTGGACAGTTGAAGATTATGGTTGGCTCCAG
GGTCCAATGGCCATTGTTCATGATTCTGTCTACTTGATGAGTCATGGACTTATTATCAAA
CAACACAGGGATGTGAGGAAGGTTGTGGCTTCGGCATCTGAGTTTCGGAGGAGAATTGGA
TTTGCAATGATTGGTATGGGTGATGACATTTATGTAATTGGAGGGGTAATTGGCCCTGAT
AGGTGGAATTGGGATATCAAACCGATGTCTGATGTTGATGTCTTGACTGTTGGGGCTGAG
AGACCAACTTGGCGTCAGGTCTCTCCAATGACACGGTGTCGTGGAACAATTCTTGGGTGT
ACGCAGCTAAGAATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Cs5g31040.1
PEP Infomation
Sequence

MSELIEGLPDAVALRCLARVPFFLHPKLELVSRSWRAAIRSPELFKARQEVGSSENLLCV
CAFDPENLWQLYDPLRDLWITLPVLPSKIRHLAHFGVVSTAGKLFVLGGGSDAVDPLTGD
QDGSFATNEVWSYDPVTRQWSPRASMLVPRAMFACCALKEKIVVAGGFTSCRKSISQAEM
YDPEKDVWVPIPDLHRTHNSACTGVVIGGKVHVLHKGLSTVQVLDHMGLGWTVEDYGWLQ
GPMAIVHDSVYLMSHGLIIKQHRDVRKVVASASEFRRRIGFAMIGMGDDIYVIGGVIGPD
RWNWDIKPMSDVDVLTVGAERPTWRQVSPMTRCRGTILGCTQLRI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs5g31040.1
Transcript Infomation

gene=Cs5g31040 CDS=265-1302
Sequence

GTTGGGGTTTTTACTTTCTATATTTGAAGGATGATTTATCTCTCTCAGATTTTGCTTATG
CTATGCTGAGAAATGCTGTGATTGCATTTCCGCCAAGATGCAAGTACACCAGAAAATCAA
TTATGATTTTTTCTGGGAACATTAATTGGCGCTCATATATATGTATCTATTTTGATGTTT
CAGGTTGTGGTTGTGAAGCCTATCATCAGTCTGTAGCAATTCACCGGCAAAGGATCATAC
AAAACGGATGAAACTGTGGTTAGTATGTCTGAACTGATCGAAGGTCTCCCGGACGCTGTT
GCCCTCAGGTGCCTTGCTCGGGTTCCCTTCTTCCTACATCCTAAGTTGGAGCTTGTTTCT
CGTTCCTGGAGAGCTGCTATTCGTAGCCCTGAGCTGTTTAAAGCCCGACAGGAGGTTGGT
TCATCAGAGAATTTACTATGCGTGTGTGCTTTTGATCCTGAGAATTTATGGCAGCTTTAT
GACCCTCTCAGAGACCTTTGGATTACTCTTCCTGTTCTTCCCTCAAAAATTAGGCACCTT
GCTCACTTTGGTGTTGTCTCCACTGCTGGAAAACTGTTTGTACTTGGTGGTGGCAGTGAT
GCTGTTGACCCATTGACTGGGGACCAAGATGGAAGCTTCGCTACCAATGAGGTCTGGTCA
TATGACCCGGTAACACGTCAGTGGTCTCCACGTGCATCCATGCTTGTGCCTCGTGCTATG
TTTGCATGCTGCGCATTGAAGGAAAAAATTGTTGTCGCAGGTGGTTTCACCAGTTGCCGG
AAGTCAATTTCTCAAGCAGAAATGTATGATCCTGAGAAGGATGTCTGGGTCCCAATTCCT
GATCTCCATCGCACTCATAATTCAGCATGCACAGGAGTGGTTATTGGAGGAAAGGTGCAT
GTCTTGCACAAAGGGCTGTCAACCGTACAAGTGTTAGATCATATGGGTCTTGGGTGGACA
GTTGAAGATTATGGTTGGCTCCAGGGTCCAATGGCCATTGTTCATGATTCTGTCTACTTG
ATGAGTCATGGACTTATTATCAAACAACACAGGGATGTGAGGAAGGTTGTGGCTTCGGCA
TCTGAGTTTCGGAGGAGAATTGGATTTGCAATGATTGGTATGGGTGATGACATTTATGTA
ATTGGAGGGGTAATTGGCCCTGATAGGTGGAATTGGGATATCAAACCGATGTCTGATGTT
GATGTCTTGACTGTTGGGGCTGAGAGACCAACTTGGCGTCAGGTCTCTCCAATGACACGG
TGTCGTGGAACAATTCTTGGGTGTACGCAGCTAAGAATTTAGGCATCTATTTATGCTAAC
TCCTGCTTTATTGTGAAAAGTGTACTTTTTGTTGGTCACCTCTCTTCTCTCTCCGAACAT
CTTTTCTGGCTACCCTGTTTTGCTTGTAAGCCATAATCTTTACCCATGTTTTCACTTCGA
TTTTTAGGAGTTTATTGACGTAACCTCTTGTTTAGAAGAGAAAGCTTTTGATCAGTTTGA
CTGGAAACAACGGGTGGTACATGAAATATGTAGTAGCAGCATGGATGAAAAGTATTATTT
TTGCTTTATGGAGTATTTGAACAGAGAATAACAATTTATTTTATCTCTAGTTTATAATTT
ATTCATTTGATTCGCTGCATACACAATCTTTTGAGAGAATTATTATTCACAAGTACGTCA
GTGAGGGCTCTTGATAATTTTAGTAATTGGCGATCAGCAAAATTGACATATAGAACATTG
TAAATAATGCCAGCAATTTTGTT