Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs5g28880.4
CDS Infomation

gene=Cs5g28880
Sequence

ATGTGTAAAGCGGCGGTGGCCTGGGAACCCAACAAGCCATTGGTGATTGAGGATGTGCAG
GTTGCTCCGCCTCAGGCTGGCGAGGTCCGAATCAAGATTCTCTTCACTGCTCTCTGCCAC
ACTGATGCTTACACCTGGAGCGGCAAGGATCCTGAAGGTCTCTTCCCTTGTATCCTAGGT
CATGAGGCTGCTGGGATTGTGGAGAGTGTTGGTGAAGGTGTGACCGAGGTTCAACCAGGT
GATCATGTCATCCCTTGTTACCAGGCAGAATGCCGAGAGTGCAAGTTTTGCAAGTCTGGA
AAGACTAACCTCTGTGGTAAGGTTAGGGGTGCCACTGGTGCTGGTGTCATGATGAATGAC
CGCAAGAGCCGTTTCTCGATAAATGGAAAGCCTATCTATCACTTCATGGGAACCTCAACA
TTTAGCCAGTACACAGTTGTGCATGATGTTAGTGTTGCAAAGATTGACCCACAAGCTCCT
TTGGACAAAGTATGCCTTCTTGGCTGTGGTGTTCCTACTGGTCTTGGAGCAGTTTGGAAC
ACTGCAAAAGTAGAGCCGGGTTCTATAGTTGCTGTTTTTGGCCTTGGGACTGTTGGCCTT
GCTGTGGCAGAGGGTGCAAAGGCAGCTGGAGCTTCACGTGTTATTGGTATAGATATTGAC
CCAAAAAAGTTTGATAGAGCAAAGAATTTTGGAGTTACTGAATTTGTAAATCCCAAGGAC
CATGACAAACCCATTCAGCAGGTCCTTGTCGATCTCACGGATGGTGGTGTTGACTATAGT
TTTGAATGCATTGGCAATGTCTCTGTGATGAGGGCAGCTTTGGAATGCTGTCACAAGGGC
TGGGGAACATCAGTTATTGTGGGTGTTGCTGCATCAGGTCAGGAAATATCCACTCGTCCT
TTCCAGTTGGTGACTGGTCGTGTATGGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGTTTCAAGAGCCGT
TCACAAGTGCCTTGGCTTGTAGACAAGTACATGAAGAAGGAAATTAAGGTTGATGAGTAC
GTAACTCACAATATGACTCTTGGGGAGATCAACGAGGCATTCCGTTATATGCATGGAGGG
GACTGCCTACGCTGTGTGCTTAAAATGCAGGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs5g28880.4
PEP Infomation
Sequence

MCKAAVAWEPNKPLVIEDVQVAPPQAGEVRIKILFTALCHTDAYTWSGKDPEGLFPCILG
HEAAGIVESVGEGVTEVQPGDHVIPCYQAECRECKFCKSGKTNLCGKVRGATGAGVMMND
RKSRFSINGKPIYHFMGTSTFSQYTVVHDVSVAKIDPQAPLDKVCLLGCGVPTGLGAVWN
TAKVEPGSIVAVFGLGTVGLAVAEGAKAAGASRVIGIDIDPKKFDRAKNFGVTEFVNPKD
HDKPIQQVLVDLTDGGVDYSFECIGNVSVMRAALECCHKGWGTSVIVGVAASGQEISTRP
FQLVTGRVWKGTAFGGFKSRSQVPWLVDKYMKKEIKVDEYVTHNMTLGEINEAFRYMHGG
DCLRCVLKMQD*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs5g28880.4
Transcript Infomation

gene=Cs5g28880 CDS=132-1247
Sequence

TTCCCCCCCCCCTCTTTAATCTATCGGTCGCGCTTCATGGTGTATTATTATCAATGTTGT
GTTTTGAGTTTGAGAAGTCTAATTTTATTGGGTGTGATTCTGATTTTTGAATTGTGAATT
TTGTGATTTCTATGTGTAAAGCGGCGGTGGCCTGGGAACCCAACAAGCCATTGGTGATTG
AGGATGTGCAGGTTGCTCCGCCTCAGGCTGGCGAGGTCCGAATCAAGATTCTCTTCACTG
CTCTCTGCCACACTGATGCTTACACCTGGAGCGGCAAGGATCCTGAAGGTCTCTTCCCTT
GTATCCTAGGTCATGAGGCTGCTGGGATTGTGGAGAGTGTTGGTGAAGGTGTGACCGAGG
TTCAACCAGGTGATCATGTCATCCCTTGTTACCAGGCAGAATGCCGAGAGTGCAAGTTTT
GCAAGTCTGGAAAGACTAACCTCTGTGGTAAGGTTAGGGGTGCCACTGGTGCTGGTGTCA
TGATGAATGACCGCAAGAGCCGTTTCTCGATAAATGGAAAGCCTATCTATCACTTCATGG
GAACCTCAACATTTAGCCAGTACACAGTTGTGCATGATGTTAGTGTTGCAAAGATTGACC
CACAAGCTCCTTTGGACAAAGTATGCCTTCTTGGCTGTGGTGTTCCTACTGGTCTTGGAG
CAGTTTGGAACACTGCAAAAGTAGAGCCGGGTTCTATAGTTGCTGTTTTTGGCCTTGGGA
CTGTTGGCCTTGCTGTGGCAGAGGGTGCAAAGGCAGCTGGAGCTTCACGTGTTATTGGTA
TAGATATTGACCCAAAAAAGTTTGATAGAGCAAAGAATTTTGGAGTTACTGAATTTGTAA
ATCCCAAGGACCATGACAAACCCATTCAGCAGGTCCTTGTCGATCTCACGGATGGTGGTG
TTGACTATAGTTTTGAATGCATTGGCAATGTCTCTGTGATGAGGGCAGCTTTGGAATGCT
GTCACAAGGGCTGGGGAACATCAGTTATTGTGGGTGTTGCTGCATCAGGTCAGGAAATAT
CCACTCGTCCTTTCCAGTTGGTGACTGGTCGTGTATGGAAAGGAACAGCTTTTGGTGGTT
TCAAGAGCCGTTCACAAGTGCCTTGGCTTGTAGACAAGTACATGAAGAAGGAAATTAAGG
TTGATGAGTACGTAACTCACAATATGACTCTTGGGGAGATCAACGAGGCATTCCGTTATA
TGCATGGAGGGGACTGCCTACGCTGTGTGCTTAAAATGCAGGATTGAGAGGATCTATTGA
GCCCTGCATTAGTTCTTATGAAATGGTATATTTTGGTGTTTACATGGTAATTGCATCCTT
TTATGTGCAAACTGTGAGTGTGTGAAGAAAACTACTCTAATGTGAGATAGTTTGGCATGT
GTTGCAGCAAAAATGTTTCTATTCAACTTTATTAAGCAGCATATTGCTAAGGACTTGCAT
CACAATAATAAATGTGTTGTCTATGAAGTATGAACTATCTGCTGCTGCAGTAGCTTTCAG
AATAACATTTATGGATCCCTGAAGGTTGTCTGGGGTTTGTTTACCAAATTCCATCTGATA
ATTTTACCTGCCTTGCGGTGCAGAGGTTTTTTTCAACTCAATCACAGGTCTTGGTTTGGT
TTTACATGTAATAATTTAAAAATAAACTCTCTGCTTCAGAAACGTAATTCCTCTCTAGAT
GTTGATATTTTAAACAAAAGAAGAATATACGACCGCTACTGAAACTTGTTAT