Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs5g22140.6
CDS Infomation

gene=Cs5g22140
Sequence

ATGATGGAAAATAAAAGAAGTCCTTGTGCTGTTGACCAAGGCAGTCTCCCTACTCTTACA
TCCAAGCGACACAAAGCTGATCTGTCCATCTCCGCCAAGGAGAGGAAAGAGAAGCTTGGT
GAACGAATCATTGCTCTGCAACAGCTTGTTTCACCATATGGAAAGACGGATACTGCATCT
GTCCTTTGGGAGGCGATGGAGTACATACAATTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGTTGAGT
GCTCCATACCTCCAAAGCATGCCAGCAGCTAAGGTGCAGGAATTAGAGCAGTATAGCCTG
AGAAACCGAGGTTTATGTCTCGTTCCAATTTCCTGTACTGCTGGAGTTGCTCGGAGCAAT
GGTGCTGACATTTGGGCACCCATCAAGACCACTTCACCTAAATTTGAGAAAGCCATCACA
CAATTCCATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs5g22140.6
PEP Infomation
Sequence

MMENKRSPCAVDQGSLPTLTSKRHKADLSISAKERKEKLGERIIALQQLVSPYGKTDTAS
VLWEAMEYIQFLHEQVKVLSAPYLQSMPAAKVQELEQYSLRNRGLCLVPISCTAGVARSN
GADIWAPIKTTSPKFEKAITQFH*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs5g22140.6
Transcript Infomation

gene=Cs5g22140 CDS=1498-1929
Sequence

AAAACCTTATAAAAACACTTTCACACAACTCATTTATTCCTCTTTCTCCTCAACTTTTCA
CACGCCCTTCTCTTCTCCCCTTTCTGCAACTTGACAACCCATTTATGGCTTCTCTTTTTT
AACCCTTTTGATGCTCAAATTTCAACTGGGTTTCGGTGATTTTAGTGAACTCTTTTGAAG
TTTTGATTAAAGGGTTTAATTTTGTCGTAAAGTTTTCAACTTTTTGAGACGCAAAAACTG
ACAAATTTAAGCAGAAAGTTCCATTTTCTTGAAAGGGAAACCGTTTTTTTGTTTCCAAAG
ACGGACTTTTGGGTTCGTTGTTTTTTAAAAAAAAAACTTGGAACAAAGCCATTTATTTTG
GCTTTCACTAAACACTTCGGTGGAAATTTGAGTGATACTTGAACTGGGCTGTGATTGTTT
TTAGCGTATAAAGCTCAGATTTTTATTGTGAGCTCTCTTGGCAATGCTGACTCTATACTC
TTGGTGAGTTCTAAATTTTGCTTGTTTCTTCTTCTTTCTTTTTAAACAACTCTGCTTCAC
TTAGTTTCCTCAATTTACGGAAATTTTGTTCACTTTGCTGCTTGATTTCCTCTTTATTAT
TGTTTGAGTATGCCTTTGCTATGTGTGTTAACTGCATGGTAGTTATCATAATTTCTTGGT
TACTATTTATTTAATTGTGTTTATGTTGGTTAATTATATTCCTTGATTGATATTAGATTA
AGATGATATTCCTTGATATTAAATAATAGTTAATTGGAAGATCAAACACGCAAATTAATT
TATGATTCATTCATGCATCCTAAATATTGATTTTCACTAGGGACCCACAAAAATCATTTC
TTTTATCTGGGTTTGTTCCCCCATCAAACACACAAAAAGACACCATTATAGTCCTAAGTT
CATTTATATATTTGGTGTTTGTGCTTTAGTCGATTAATAAAGTAATGAATGGTTAGCCAT
TTTTAAATTCATTGGAGGGTCTAGATTGTGTAGACATACGAACCCAATACATCACTTGTT
TTTAATATTAAGTAGGTGAACGTGACTTTCACTGAAAGATGGAAAATCTTGTCTATTTGT
GCGCTCAGAATTAGTTCAGTATAGTGATATTGTTTCTTAATTATGCAAATGTGTATTTTG
TATTGTGTTTTGCGTTTCATTTCTGACCAAAACAGTGGATGTTTGTTTTATTTATGCAAA
TATTAGCAATATTATGATATTTATTTGAAAGATGTCTTGTATGGCTATAAAATGTTTGAT
TATTTTAATCTATAATGATAATGGTGTTTTGTTTCACCTTAGATGATTGTTTAATCAAAT
TAACCTCATTGGATAGTCAACTGTGATTTTACATTATTTTGGGTATCATCACACGGGCTC
GTACTGCTGCTGATCTCTAGGCAGAAGCTTCATCCCCGTGATCAGCGGTATTGGTATCTG
AAGTCTTGACTGGGACCTACCTCGTTGGAGGGAGTATAAGGTATAAAGGTGTCGAAGATG
ATGGAAAATAAAAGAAGTCCTTGTGCTGTTGACCAAGGCAGTCTCCCTACTCTTACATCC
AAGCGACACAAAGCTGATCTGTCCATCTCCGCCAAGGAGAGGAAAGAGAAGCTTGGTGAA
CGAATCATTGCTCTGCAACAGCTTGTTTCACCATATGGAAAGACGGATACTGCATCTGTC
CTTTGGGAGGCGATGGAGTACATACAATTTCTACATGAACAAGTGAAGGTGTTGAGTGCT
CCATACCTCCAAAGCATGCCAGCAGCTAAGGTGCAGGAATTAGAGCAGTATAGCCTGAGA
AACCGAGGTTTATGTCTCGTTCCAATTTCCTGTACTGCTGGAGTTGCTCGGAGCAATGGT
GCTGACATTTGGGCACCCATCAAGACCACTTCACCTAAATTTGAGAAAGCCATCACACAA
TTCCATTGACACAAGCCATTGCTCACCTGCCGTAAAGGCTTCCAGAGGTGCTGCAGTGGG
TAAACCAACTTTTCGCACGTAGTGCATAACAAATTTTTGTTAGGCAGTTGTAATGGGATT
GTGGTATGTGAAATAGTTGGTCATTGAAGATGTACACTATGTAATTGCAGTCCCACACCC
TTATAGTTTTAACTGGTGGTGGGTTCATTCTGTCCTATTATGTTCTCCGTTTCTAATTAA
TCAATCTAAATGTATATCTATGACGTATGTTGTATAATGATCCTGATATATTAAAATCAT
AATATATGGTGGAGCTTCCTGATTCATTATGTGGCTTTCTCAGAGTCAAGCATACTACTG
CATATTTAATGC