Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs5g21740.1
CDS Infomation

gene=Cs5g21740
Sequence

ATGGGAATGGGGAAATGGTTGAAAATCGGAATGGTAGTGGGGGTGATAGCGATAATAAGG
GAAGTAAGCAAACATTACGGATTTGGATTTGATAAAGACACTGGTATTAAAGCTATTAGA
GAATGGTCGGATCGGTTGGGTGTTTGGGCGATTCCTGTTTTCGTGGGATTTCACACACTC
ACTATCGCTCTTTGCTTGCCCTACGCTGTCTTCTTCGAAGCCGCCGCTTCTCTTCTCTTC
GGTTTCTTCCCTGCTGTTCTTTGCGTCTTTTCCGCTAAGCTTCTTGGAGCTTCCCTCTCC
TTCTGGATCGGCAGGTTAGTTTTCAAGAGTTCGAATTCAGCAATGGAGTGGGCTCAGAGA
AACAAGTACTTCCATATCCTTTCTAGAGGAGTTGAAAAAGATGGTTGGAAATTTGTGGTG
TTAGCACGCTTTTCGCCAATGCCCTCGTATGTCATTAACTATGCCTTAGCTGCCACAAAC
GTTGGGTTTGTAGTGGATTTTCTGCTCCCAACAATTATTGGCTGCCTGCCAATGATTTTG
CAGAACACATCCATTGGTAGCCTTGCTGGTGCTGCTGTTGCTTCAGCATCCAGCTCTTGG
AAATCCCAGGTTTGGTCCTACCTCTTTCCCCTACTTGGGATTGTATCAAGCATTCTGATT
TCTTTTAGGATAAAAAAGTACTCCACTGATATCACAGTGGCTGAATCTCCTAGCGATATT
GTTGCAGACTCATCTCATGGTAAAACAGGAAGAGAGGGTCTGAAGAAAAGTCAATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs5g21740.1
PEP Infomation
Sequence

MGMGKWLKIGMVVGVIAIIREVSKHYGFGFDKDTGIKAIREWSDRLGVWAIPVFVGFHTL
TIALCLPYAVFFEAAASLLFGFFPAVLCVFSAKLLGASLSFWIGRLVFKSSNSAMEWAQR
NKYFHILSRGVEKDGWKFVVLARFSPMPSYVINYALAATNVGFVVDFLLPTIIGCLPMIL
QNTSIGSLAGAAVASASSSWKSQVWSYLFPLLGIVSSILISFRIKKYSTDITVAESPSDI
VADSSHGKTGREGLKKSQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs5g21740.1
Transcript Infomation

gene=Cs5g21740 CDS=222-998
Sequence

GGGTGGCCCATGAATGAAATAGTTGAATAAGGCTTCTGTTAAATGGGCCCAGAGACGCCG
CCTATGTGTTTGAGAAAATGCTCGAAGAAAGAAGGGTGGTCGTACTCGTAGCGTGTGAGC
GTGAGACACTGACATTGCTGGCATCACCACGCAAAGAAAAGCATATTATTAGGTTGACTT
GGTAGGAGGGGGGAAAAAAGAAGTAAAAAGACGAGAGAGGAATGGGAATGGGGAAATGGT
TGAAAATCGGAATGGTAGTGGGGGTGATAGCGATAATAAGGGAAGTAAGCAAACATTACG
GATTTGGATTTGATAAAGACACTGGTATTAAAGCTATTAGAGAATGGTCGGATCGGTTGG
GTGTTTGGGCGATTCCTGTTTTCGTGGGATTTCACACACTCACTATCGCTCTTTGCTTGC
CCTACGCTGTCTTCTTCGAAGCCGCCGCTTCTCTTCTCTTCGGTTTCTTCCCTGCTGTTC
TTTGCGTCTTTTCCGCTAAGCTTCTTGGAGCTTCCCTCTCCTTCTGGATCGGCAGGTTAG
TTTTCAAGAGTTCGAATTCAGCAATGGAGTGGGCTCAGAGAAACAAGTACTTCCATATCC
TTTCTAGAGGAGTTGAAAAAGATGGTTGGAAATTTGTGGTGTTAGCACGCTTTTCGCCAA
TGCCCTCGTATGTCATTAACTATGCCTTAGCTGCCACAAACGTTGGGTTTGTAGTGGATT
TTCTGCTCCCAACAATTATTGGCTGCCTGCCAATGATTTTGCAGAACACATCCATTGGTA
GCCTTGCTGGTGCTGCTGTTGCTTCAGCATCCAGCTCTTGGAAATCCCAGGTTTGGTCCT
ACCTCTTTCCCCTACTTGGGATTGTATCAAGCATTCTGATTTCTTTTAGGATAAAAAAGT
ACTCCACTGATATCACAGTGGCTGAATCTCCTAGCGATATTGTTGCAGACTCATCTCATG
GTAAAACAGGAAGAGAGGGTCTGAAGAAAAGTCAATAATAGAATTAATCAACATTAATTT
TCTTCTTTGATTATTGTTATGGTTGAATACAAAGTTATACATCACGAATTTTCATTTGAG
AGTCAATTTTACATTTCGATCTTTTCTGTGTGGTACTCTTTTTAAAGGTTCAGAGTTGGG
TGATTCTTTCCAGTTTATTTTTCTCTTAACCATTCAGTTATACTTCAGTCTTTATGAAGG
TCAAATATGTAATCAACAAGTTTGTGCGGAGGAAGAATGCTTTATAGTGGTAATCAACAA
ATCGTCTGGTATTATTATATTGCTAAATACCAATTTTGAAGTAAGACTTTGCATATTATA
ATTACGTATTATTATATTGCTAAATACCTATTTTGAAGTAAGACTTTGCATATTGTAATT
ACCATTTTGATGACAACTTGATTTTTGATGTATGACAAATTGCACTGATGGGAGAGTTGG
CACTAATTGCATCTTTATGTAACTCCTGAATTTTTGTTTATTCAAATATTTGCTGCTGAT
AAATAACTTGTGACAACTGATTCTATACGTACATTGCTGTGAGTTTGAAATTTTTAATTG
CTTTAAC