Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs5g20540.1
CDS Infomation

gene=Cs5g20540
Sequence

ATGGATGAAGAGTATGATGTCATCGTCTTGGGAACCGGTCTCAAGGAATGCATCCTCAGT
GGTCTCCTCTCTGTTGATGGCCTCAAGGTCCTGCACATGGACAGGAATGATTATTATGGA
GGAGAGTCATCATCGCTCAATCTCATTCAGCTCTGGAAGAGATTTAGGGGAAATGAACAA
CCTCCTGCTCACTTGGGCTCTAGTAGGGATTATAATGTTGACATGATCCCGAAGTTTATA
ATTGCAAATGGAGCTCTTGTTCGTGTCCTCATTCATACTGATGTTACAAAGTATCTGTAC
TTCAAAGCTGTGGATGGCAGCTTCGTCTATAATAAAGGAAAGGTCCACAAGGTGCCAGCA
ACTGATATGGAAGCGCTCAAATCTCCACTCATGGGTATTTTTGAGAAGCGCCGTGCACGC
AAGTTTTTCATTTATGTTCAAGATTATGATGAAAATGATCCCAAAACACACGAGGGAATG
GACTTGACCAGGGTGACCACTAGAGAGCTGATTGCGAAGTATGGTCTTGATGACAACACT
ATTGACTTCATTGGTCATGCATTGGCACTTCATAGAGATGATCGTTACTTAAACGAACCT
GCTCTTGATACAGTGAAGAGAATGAAGTTATACGCAGAGTCTATTGCACGATTTCAAGGA
GGATCACCATACATTTACCCTCTGTATGGCCTTGGAGAGCTGCCTCAGGCCTTTGCTCGG
CTTAGTGCTGTTTATGGTGGGACGTATATGTTGAATAAACCTGAGTGCAAGGTAGAGTTT
GATGAAGAAGGTAAAGTAGTCGGTGTCACGTCAGAAGGGGAAACTGCAAAGTGCAAGAAA
GTTGTTTGTGATCCTTCCTATTTGCCCAACAAGGTGAGGAAGGTTGGCAGGGTTGCTAGG
GCAATCGCTATTATGAGCCACCCAATCCCAAACACCAATGATTCCCATTCAGTGCAGGTT
ATCCTTCCGCAAAAACAGTTGGGTCGTAGATCAGACATGTACCTCTTCTGTTGTTCCTAC
TCCCACAATGTTGCTCCAAAGGGCAAATTCATTGCATTCGTATCGACTGAGGCAGAGACT
GATCATCCACAGACTGAACTTAAGCCTGGAATTGATCTTTTGGGTCCAGTCGATGAAATA
TTCTATGATATATATGACAGATATGAACCAGTTAATGAACCTTCTTTGGACAATTGCTTT
ATCTCAACGAGCTATGATGCCACAACACACTTTGAGTCAACTGTCACGGATGTACTGAAC
ATGTATACCATGATAACCGGAAAGGTTCTTGACCTCAGTGTGGATTTAAGTGCTGCCAGT
GCTGCAGAAGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs5g20540.1
PEP Infomation
Sequence

MDEEYDVIVLGTGLKECILSGLLSVDGLKVLHMDRNDYYGGESSSLNLIQLWKRFRGNEQ
PPAHLGSSRDYNVDMIPKFIIANGALVRVLIHTDVTKYLYFKAVDGSFVYNKGKVHKVPA
TDMEALKSPLMGIFEKRRARKFFIYVQDYDENDPKTHEGMDLTRVTTRELIAKYGLDDNT
IDFIGHALALHRDDRYLNEPALDTVKRMKLYAESIARFQGGSPYIYPLYGLGELPQAFAR
LSAVYGGTYMLNKPECKVEFDEEGKVVGVTSEGETAKCKKVVCDPSYLPNKVRKVGRVAR
AIAIMSHPIPNTNDSHSVQVILPQKQLGRRSDMYLFCCSYSHNVAPKGKFIAFVSTEAET
DHPQTELKPGIDLLGPVDEIFYDIYDRYEPVNEPSLDNCFISTSYDATTHFESTVTDVLN
MYTMITGKVLDLSVDLSAASAAEE*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs5g20540.1
Transcript Infomation

gene=Cs5g20540 CDS=221-1555
Sequence

TTTAAGAATATTAAAATGGGGGACACAATTATTTAGCAAAATGAGTTAAAGGCAAACTTT
GGAAGATATTCTTTTGGAATTTCCCATTTAACAAACAAAGCACCTCCTTCTCTCACTCTA
ATTCCTTTCTTTGCTTCTATTAATATTACTCCCTTCACTTTGACCTAACCCACAAAACCC
TCTGAATCAGAAATCAAAAATCAAAAATCAAATCATCAACATGGATGAAGAGTATGATGT
CATCGTCTTGGGAACCGGTCTCAAGGAATGCATCCTCAGTGGTCTCCTCTCTGTTGATGG
CCTCAAGGTCCTGCACATGGACAGGAATGATTATTATGGAGGAGAGTCATCATCGCTCAA
TCTCATTCAGCTCTGGAAGAGATTTAGGGGAAATGAACAACCTCCTGCTCACTTGGGCTC
TAGTAGGGATTATAATGTTGACATGATCCCGAAGTTTATAATTGCAAATGGAGCTCTTGT
TCGTGTCCTCATTCATACTGATGTTACAAAGTATCTGTACTTCAAAGCTGTGGATGGCAG
CTTCGTCTATAATAAAGGAAAGGTCCACAAGGTGCCAGCAACTGATATGGAAGCGCTCAA
ATCTCCACTCATGGGTATTTTTGAGAAGCGCCGTGCACGCAAGTTTTTCATTTATGTTCA
AGATTATGATGAAAATGATCCCAAAACACACGAGGGAATGGACTTGACCAGGGTGACCAC
TAGAGAGCTGATTGCGAAGTATGGTCTTGATGACAACACTATTGACTTCATTGGTCATGC
ATTGGCACTTCATAGAGATGATCGTTACTTAAACGAACCTGCTCTTGATACAGTGAAGAG
AATGAAGTTATACGCAGAGTCTATTGCACGATTTCAAGGAGGATCACCATACATTTACCC
TCTGTATGGCCTTGGAGAGCTGCCTCAGGCCTTTGCTCGGCTTAGTGCTGTTTATGGTGG
GACGTATATGTTGAATAAACCTGAGTGCAAGGTAGAGTTTGATGAAGAAGGTAAAGTAGT
CGGTGTCACGTCAGAAGGGGAAACTGCAAAGTGCAAGAAAGTTGTTTGTGATCCTTCCTA
TTTGCCCAACAAGGTGAGGAAGGTTGGCAGGGTTGCTAGGGCAATCGCTATTATGAGCCA
CCCAATCCCAAACACCAATGATTCCCATTCAGTGCAGGTTATCCTTCCGCAAAAACAGTT
GGGTCGTAGATCAGACATGTACCTCTTCTGTTGTTCCTACTCCCACAATGTTGCTCCAAA
GGGCAAATTCATTGCATTCGTATCGACTGAGGCAGAGACTGATCATCCACAGACTGAACT
TAAGCCTGGAATTGATCTTTTGGGTCCAGTCGATGAAATATTCTATGATATATATGACAG
ATATGAACCAGTTAATGAACCTTCTTTGGACAATTGCTTTATCTCAACGAGCTATGATGC
CACAACACACTTTGAGTCAACTGTCACGGATGTACTGAACATGTATACCATGATAACCGG
AAAGGTTCTTGACCTCAGTGTGGATTTAAGTGCTGCCAGTGCTGCAGAAGAATGAGGAAT
CTGCAACTCCCCGTTCATGTTTGCGCATGTAATGCCGTCAGTGGGATAAAGCTCGAAAGA
ATGTGGGGGTTGGACACTTGGACTTTGTCATGGTTTCTGTTTCTCATAGTTGGTGATTTT
ATTATTATTATTATGTAATGGAATCTTGTTTTAATTGTTCGCCGTGGGAACTAATGTGTA
GATTTCAAACATGCATCTTTAATTTGCTTAAATTATATCTTAAATTTTTCAGCTTGATTT
TATCTTGCCCAGGCATCAGCCCCATATGAGCCTAATTGTATGTTGCTTTGAAATTCCCT