Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs4g20280.1
CDS Infomation	gene=Cs4g20280
Sequence	ATGTTTAAGCAATTTTTCAGTAAACTTCCGAAAAAATCATTGAAACCGGATTCGCCTGAG TTGAATCGGACCAACTCCGGCACCGATTTCTCCACAAACTCTAACACAACGACGACAAGC AATAGCGCTGCTTCTGGGAATGGGAATAAATCCAACGGTGGAGAAAAATATTCTTCAGCG GGCAAATCCAATGTTGCGACAAAAAGAACCTCGTCAGCTGTGTTTCCCGCCAGCGTCGTG GCAGGAATCGAGCCGTTGCTTCCATTCAAAGATGTGCCCAATGGTGAGAAGATGAATTTA TTTGTCAGTAAAGTGAGCCTTTGTTGTGTAACATTTGATTTCACTGACCCAACTAAGAAT TGTGTTGAAAAGGATGTTAAAAAACAGACCTTGATTGAGCTGTTAGATTTTGTAGCCGCT GGGTCTATGAAATTTAGCGAACCGGCGATTTTAGCAATGTGTAGGATGTGTGCTGTTAAT TTGTTCAGAGTTTTTCCTCCTAATTATCGGTGTAGTTCACATACTACTGGTGAAAATGAT GACGACGAGCCTATGTTCGATCCCTCGTGGCCACATTTGCAAATTGTGTATGATTTGTTG CTCAAGTTTATTACTTCTTCGTGTCTTGATGCCAAGGTTGCGAAAAGGTATATCGACCAT TCCTTTATTTTAAGATTGCTTGATTTGTTTGATTCCGATGATCCGAGAGAAAGGGAGTGT TTAAAGACCATTTTGCACCGGGTTTATGGGAAATTTATGGTTCATAGGCCGTTTATCAGA AAGTCTATGAGTAACATATTTTATCGGTTTGTTTTTGAGACGGAGAAACATAATGGAATT GCAGAGTTGTTGGAGATTTTGGGGAGTATAATTAGTGGGTTTGCATTGCCTTTGAAAGAG GAACACAAGATCTTCTTGAGGAGAGTTATAATTCCTTTGCACAAGCCCAAGTCTTTGGGG ACTTATTTTCAACAGCTCTCATACTGCGTCATGCAGTTTATAGAGAAGGAGCCCAAGTTG TCGAGTACTGTGATAAATGGATTGTTGAAATACTGGCCGATAACCAACAGCCAGAAGGAG GTGATGTTCCTTGGGGAGATAGAAGAGATTTTGGAAGCAATTAATATGGTGGAATTTCAA AAGGTCATGGTTTCATTGTTCTGGCGGATTGGATGCTGCATTAACAGTTTCCACTTCCAG GTCGCCGAAAGAGCCCTTTTCTTGTGGAACAACGATCAAATTGTGAACTTGATTGCACAT AACCGGCAGGTGATTCTGCCTATTTTACTTCCAGTTTTAGAGAAAAATGCCCAGAGCCAT TGGAACCAAGCAGTTCTCAACCTCACTCTGAATGTTAGAAAGATGTTCTCTGAGATGGAC GACGTGCTATTCATGTCTTGCCATGCTCAGTACAGGGAACAAGTAGCCAACCTGAGCCTG GTAGATCAAAGGCGGAAGGAAGCATGGGAGCAATTAGAAAATGCAGCCCGTCTTCAGCCA ATAACAGGAAATACTGCTGTTCTGGTGACTCCTTTAGCAACCTCAATTGCCTGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Cs4g20280.1
PEP Infomation
Sequence	MFKQFFSKLPKKSLKPDSPELNRTNSGTDFSTNSNTTTTSNSAASGNGNKSNGGEKYSSA GKSNVATKRTSSAVFPASVVAGIEPLLPFKDVPNGEKMNLFVSKVSLCCVTFDFTDPTKN CVEKDVKKQTLIELLDFVAAGSMKFSEPAILAMCRMCAVNLFRVFPPNYRCSSHTTGEND DDEPMFDPSWPHLQIVYDLLLKFITSSCLDAKVAKRYIDHSFILRLLDLFDSDDPREREC LKTILHRVYGKFMVHRPFIRKSMSNIFYRFVFETEKHNGIAELLEILGSIISGFALPLKE EHKIFLRRVIIPLHKPKSLGTYFQQLSYCVMQFIEKEPKLSSTVINGLLKYWPITNSQKE VMFLGEIEEILEAINMVEFQKVMVSLFWRIGCCINSFHFQVAERALFLWNNDQIVNLIAH NRQVILPILLPVLEKNAQSHWNQAVLNLTLNVRKMFSEMDDVLFMSCHAQYREQVANLSL VDQRRKEAWEQLENAARLQPITGNTAVLVTPLATSIAC*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs4g20280.1
Transcript Infomation	gene=Cs4g20280 CDS=614-2170
Sequence	CAAAAAAGTAAAAAAATTAAAAATTAAAAATTAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAATAAAA CGCCCATTAATACACAATTACACATCTGATAGTTTAGTTTGGTTTCTTTTCATGGAGATC AAACCACACCTACAACAACCTTAAACAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCCT CCCTTTCCTAGATCTCCATTTTATCTCTCTAAAAGTCTCTTTGTTGTGGATCTTCACTCT TTAGATTCCCCAATCACTTTTATAATCAATTTCTCAAATTAACTGTCCCTCTGTTTCAAT TTTTGAAGATTTGTGTAATCATTATTTCTTTGATTGTGCATGCACTCACATTCAAAATTT TTTTCCCTCAAAACCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACATGCAACTTCCACTGCT GTACCGTACCTCAAAGATCTGATTTTTCTTCAATGTCCATCATTTTACCGCAAATCTTTT CGCTCTTTCATGTCTCTGTAACTTTTAATCGTTTACCCACATTCTCAACAGATCGGTAAC GAACAATTTAGGGTTTCATTTTCCCTTTTGTTCATATTTATTTTTTCTTTTTGATTTTTT ATTATTTTTGACAATGTTTAAGCAATTTTTCAGTAAACTTCCGAAAAAATCATTGAAACC GGATTCGCCTGAGTTGAATCGGACCAACTCCGGCACCGATTTCTCCACAAACTCTAACAC AACGACGACAAGCAATAGCGCTGCTTCTGGGAATGGGAATAAATCCAACGGTGGAGAAAA ATATTCTTCAGCGGGCAAATCCAATGTTGCGACAAAAAGAACCTCGTCAGCTGTGTTTCC CGCCAGCGTCGTGGCAGGAATCGAGCCGTTGCTTCCATTCAAAGATGTGCCCAATGGTGA GAAGATGAATTTATTTGTCAGTAAAGTGAGCCTTTGTTGTGTAACATTTGATTTCACTGA CCCAACTAAGAATTGTGTTGAAAAGGATGTTAAAAAACAGACCTTGATTGAGCTGTTAGA TTTTGTAGCCGCTGGGTCTATGAAATTTAGCGAACCGGCGATTTTAGCAATGTGTAGGAT GTGTGCTGTTAATTTGTTCAGAGTTTTTCCTCCTAATTATCGGTGTAGTTCACATACTAC TGGTGAAAATGATGACGACGAGCCTATGTTCGATCCCTCGTGGCCACATTTGCAAATTGT GTATGATTTGTTGCTCAAGTTTATTACTTCTTCGTGTCTTGATGCCAAGGTTGCGAAAAG GTATATCGACCATTCCTTTATTTTAAGATTGCTTGATTTGTTTGATTCCGATGATCCGAG AGAAAGGGAGTGTTTAAAGACCATTTTGCACCGGGTTTATGGGAAATTTATGGTTCATAG GCCGTTTATCAGAAAGTCTATGAGTAACATATTTTATCGGTTTGTTTTTGAGACGGAGAA ACATAATGGAATTGCAGAGTTGTTGGAGATTTTGGGGAGTATAATTAGTGGGTTTGCATT GCCTTTGAAAGAGGAACACAAGATCTTCTTGAGGAGAGTTATAATTCCTTTGCACAAGCC CAAGTCTTTGGGGACTTATTTTCAACAGCTCTCATACTGCGTCATGCAGTTTATAGAGAA GGAGCCCAAGTTGTCGAGTACTGTGATAAATGGATTGTTGAAATACTGGCCGATAACCAA CAGCCAGAAGGAGGTGATGTTCCTTGGGGAGATAGAAGAGATTTTGGAAGCAATTAATAT GGTGGAATTTCAAAAGGTCATGGTTTCATTGTTCTGGCGGATTGGATGCTGCATTAACAG TTTCCACTTCCAGGTCGCCGAAAGAGCCCTTTTCTTGTGGAACAACGATCAAATTGTGAA CTTGATTGCACATAACCGGCAGGTGATTCTGCCTATTTTACTTCCAGTTTTAGAGAAAAA TGCCCAGAGCCATTGGAACCAAGCAGTTCTCAACCTCACTCTGAATGTTAGAAAGATGTT CTCTGAGATGGACGACGTGCTATTCATGTCTTGCCATGCTCAGTACAGGGAACAAGTAGC CAACCTGAGCCTGGTAGATCAAAGGCGGAAGGAAGCATGGGAGCAATTAGAAAATGCAGC CCGTCTTCAGCCAATAACAGGAAATACTGCTGTTCTGGTGACTCCTTTAGCAACCTCAAT TGCCTGTTAACCTACCTACATTTTGTAACTTTTGCTCCAAAATTTTTACAAGTCTTTCTC CGCCTTACAATATATGGGGTGGTGAAATCCC