Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs4g19800.1
CDS Infomation

gene=Cs4g19800
Sequence

ATGGCGGCAGCTAGTTACGATTACGAAGACGCTCCGGCCGATTACGATGGTTCAGCGGAT
GCGCGCGCTTCATCCCAAGACCTAGGCTACGACCCTAACTTCGTGCCTGACTCCGTAAAG
TCATTCGTTGTTCATCTTTACCGCCACATTCGCGAGAAGAATGTCTACGAGATCCACCAG
ATGTACGAGACGTCGTTTCAGAGTCTCTCCGACCGCCTCTTCAAGGATACTCCCTGGCCA
TCCGTTGACGCCGTCGCTCATTATGTTGACAATGATCATGTTTTCTGTCTTCTCTATCGC
GAGATGTGGTTCCGCCACTTGTACGCTAGATTGTCGCCTACTCTCAAGCAGAGGATTGAT
TCTTGGGACAATTATTGTAGCCTGTTTCAGGTGGTGCTGCATGGAGTGGTGAATATGCAG
TTGCCAAACCAGTGGTTGTGGGATATGGTGGATGAGTTTGTTTACCAGTTCCAGAGTTTC
TGTCAGTACAGAGCCAAGATGAAGAACAAGACAGAGCAGGAGATTGCACTTTTGAGGCAG
TATGATCAGGCTTGGAATGTTTATGGCGTGCTCAATTTCTTGCAAGCACTCGTGGAGAAG
TCGATGATCATTCAGATTTTGGAGCGTGAGAAGGAAGGCCTTGAGCAGTTTACAGCCACT
GATGGTTATGATTACAATGGTGGAAGCAATGTGTTGAAAGTTTTGGGGTATTTCAGCATG
GTTGGTTTGCTGCGTGTTCACTGTCTTCTGGGTGATTATCATACTGGTCTTAAGTGCTTA
CAGCCAATTGACATTACTCAACAAGGTGTTTACACCAGTGTTATAGGAAGTCACATTACT
ACCATTTACCATTATGGGTTTGCCAATCTTATGTTGCGGAGGTATGTGGATGCCATTCGT
GAATTTAATAAGATTCTCCTGTACATATACAAGACCAAGCAATACCATCAGAAATCTCCA
CAGTATGAGCAGATACTAAAGAAGAATGAGCAGATGTATGCCTTGCTGGCAATTTGTCTT
TCTCTTTGTCCCCAAGTGAAGCATGTTGAGGAGACTGTGAACTCGCAACTACGGGAGAAA
TATGGGGAGAAGATGATTCGGATGCAAAGATATGATGATGAAGCATTTTCTATCTATGAT
GAGCTCTTCTCGTATGCATGTCCTAAGTTCATTACTCCCTCTGCTCCGAGCTTTGAGGAG
CCTCTTGTAAATTACAACCAGGATGCCTATAGACTCCAGTTGAAGCTTTTCCTTTATGAG
GTGAAGCAGCAACAATTATTATCAGGAGTCCGATCTTTCTTGAAAGTGTATTCATCACTG
TACCTTTCGGAGCTTGCAACTTACATGGAAGTGGATGAGCCCACTCTTAGGACTATCCTG
ATGACATACAAGCACAAGACTCACGCCGTTGATTCTGATGGGAAGATTACTTCTAATGCA
GATGTGGATTTCTACATTGATGATAATATGATTCATGTAGTTGAGTCCAAGCCGGTGAAG
CGATATGGTGATTTTTTCTTGCGGCAGATTGCCAAGCTCGAAGGGTTGATTAATGATTTG
GACAGGGTAAGGCTGGACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs4g19800.1
PEP Infomation
Sequence

MAAASYDYEDAPADYDGSADARASSQDLGYDPNFVPDSVKSFVVHLYRHIREKNVYEIHQ
MYETSFQSLSDRLFKDTPWPSVDAVAHYVDNDHVFCLLYREMWFRHLYARLSPTLKQRID
SWDNYCSLFQVVLHGVVNMQLPNQWLWDMVDEFVYQFQSFCQYRAKMKNKTEQEIALLRQ
YDQAWNVYGVLNFLQALVEKSMIIQILEREKEGLEQFTATDGYDYNGGSNVLKVLGYFSM
VGLLRVHCLLGDYHTGLKCLQPIDITQQGVYTSVIGSHITTIYHYGFANLMLRRYVDAIR
EFNKILLYIYKTKQYHQKSPQYEQILKKNEQMYALLAICLSLCPQVKHVEETVNSQLREK
YGEKMIRMQRYDDEAFSIYDELFSYACPKFITPSAPSFEEPLVNYNQDAYRLQLKLFLYE
VKQQQLLSGVRSFLKVYSSLYLSELATYMEVDEPTLRTILMTYKHKTHAVDSDGKITSNA
DVDFYIDDNMIHVVESKPVKRYGDFFLRQIAKLEGLINDLDRVRLD*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs4g19800.1
Transcript Infomation

gene=Cs4g19800 CDS=165-1745
Sequence

ATCAAATCCTAATCCAATTGCACATCCGCTCTCTCAGTAAACCCTAATACTCTCTTCTCT
CTCTCTCTCTCTTTTCAGTTTCTCACTCTCCATCCCATCTCCTCCTCTACCTCCGCCTTT
CCCTTTGTATAGTGCACGAATTAAACTCTGATCTATAAGCAATAATGGCGGCAGCTAGTT
ACGATTACGAAGACGCTCCGGCCGATTACGATGGTTCAGCGGATGCGCGCGCTTCATCCC
AAGACCTAGGCTACGACCCTAACTTCGTGCCTGACTCCGTAAAGTCATTCGTTGTTCATC
TTTACCGCCACATTCGCGAGAAGAATGTCTACGAGATCCACCAGATGTACGAGACGTCGT
TTCAGAGTCTCTCCGACCGCCTCTTCAAGGATACTCCCTGGCCATCCGTTGACGCCGTCG
CTCATTATGTTGACAATGATCATGTTTTCTGTCTTCTCTATCGCGAGATGTGGTTCCGCC
ACTTGTACGCTAGATTGTCGCCTACTCTCAAGCAGAGGATTGATTCTTGGGACAATTATT
GTAGCCTGTTTCAGGTGGTGCTGCATGGAGTGGTGAATATGCAGTTGCCAAACCAGTGGT
TGTGGGATATGGTGGATGAGTTTGTTTACCAGTTCCAGAGTTTCTGTCAGTACAGAGCCA
AGATGAAGAACAAGACAGAGCAGGAGATTGCACTTTTGAGGCAGTATGATCAGGCTTGGA
ATGTTTATGGCGTGCTCAATTTCTTGCAAGCACTCGTGGAGAAGTCGATGATCATTCAGA
TTTTGGAGCGTGAGAAGGAAGGCCTTGAGCAGTTTACAGCCACTGATGGTTATGATTACA
ATGGTGGAAGCAATGTGTTGAAAGTTTTGGGGTATTTCAGCATGGTTGGTTTGCTGCGTG
TTCACTGTCTTCTGGGTGATTATCATACTGGTCTTAAGTGCTTACAGCCAATTGACATTA
CTCAACAAGGTGTTTACACCAGTGTTATAGGAAGTCACATTACTACCATTTACCATTATG
GGTTTGCCAATCTTATGTTGCGGAGGTATGTGGATGCCATTCGTGAATTTAATAAGATTC
TCCTGTACATATACAAGACCAAGCAATACCATCAGAAATCTCCACAGTATGAGCAGATAC
TAAAGAAGAATGAGCAGATGTATGCCTTGCTGGCAATTTGTCTTTCTCTTTGTCCCCAAG
TGAAGCATGTTGAGGAGACTGTGAACTCGCAACTACGGGAGAAATATGGGGAGAAGATGA
TTCGGATGCAAAGATATGATGATGAAGCATTTTCTATCTATGATGAGCTCTTCTCGTATG
CATGTCCTAAGTTCATTACTCCCTCTGCTCCGAGCTTTGAGGAGCCTCTTGTAAATTACA
ACCAGGATGCCTATAGACTCCAGTTGAAGCTTTTCCTTTATGAGGTGAAGCAGCAACAAT
TATTATCAGGAGTCCGATCTTTCTTGAAAGTGTATTCATCACTGTACCTTTCGGAGCTTG
CAACTTACATGGAAGTGGATGAGCCCACTCTTAGGACTATCCTGATGACATACAAGCACA
AGACTCACGCCGTTGATTCTGATGGGAAGATTACTTCTAATGCAGATGTGGATTTCTACA
TTGATGATAATATGATTCATGTAGTTGAGTCCAAGCCGGTGAAGCGATATGGTGATTTTT
TCTTGCGGCAGATTGCCAAGCTCGAAGGGTTGATTAATGATTTGGACAGGGTAAGGCTGG
ACTGAGCTGACACCATGCCGGACTTCAACTTCTCTGCTGCTTCCGGTTTCCCCTTCCTTT
TTCTATCTATTCGATAAATGACAGAGATTTTGTACTACTTAGTTGGCATTTTCTCGTTTG
AATTAGTGAGATGTCTATGTTTAGCTTTGGAATGTAATTCAGTTTCTACATTTTTTTTTA
ATTTAAAAAATTATTATACATGTATTCTTAGTAGTTGCACCAAAGGAGTTAAAGAAGTTG
CTCATTCTGTCGACAACTTTTCAGCTCGCAATTTTGCCGGTAGTTTTGAAATTTTCTAAT
ACGCACCCAGCGTTATGCAGGCGATGCGGAGTTTATATAAAATGGACAGTGTGTTTAAGA
CAATTTGAAAATTTAAACCTCAAATATAAGTGAGAATGGATTTTTAAACTAACCATGGTA
GATTTTTGGGTTGTGGTAGAATAATTCTATCTATTTTAACCATTAAAAAATATATATATG
GTATGCA