Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs3g24890.1
CDS Infomation

gene=Cs3g24890
Sequence

ATGGAACAAAGCGGCCCAACATACGACAGTGGTAGCGGCGGCGGTGCTCCGGTTGGTGTT
CGGATCCAACACAATAGAAGGTTACCCGATTTCTTACAAAGCGTGAATCTTAAGTACGTA
AAACTTGGGTACCATTACCTCATTTCAAATCTATTAACACTATGTTTCATTCCCTTAATT
ATAATCACCTCTATTCAAGTTTCGGAAATGAACATTGATGATCTACGTCAGTTGTGGATT
CACCTTCAGTTCAATCTCGTAAGCGTTGTTATTTGCTCAGCCATTCTTGTTTTTGGCTTA
ACGGTTTTTATCATGACTCGGCCAAGACCGGTTTATTTAGTTGATTACTCCTGTTACAAA
CCACCCCATAATCTCAAAGCCTCGTATGATAAATTCATGGAGCATTCGAAGTTAACAGGG
GATTTTGATGAGTCCTCTCTCGAGTTCCAGCGCAAGATTCTTGAGCGTTCTGGGCTTGGA
GAGGAGACTTATTTCCCTGAAGCTATGCATGCTATTCCACCTAAGCCATCAATGGCTGCT
GCCAGAGAAGAGGCTGAGCAGGTCATGTATGGTGCGTTGGATAACCTTTTTAGTAATACA
AATGTTAATCCCAAAGATATTGGTATTCTTGTTGTCAATTGTAGTTTGTTTAATCCTACA
CCGTCTTTGTCAGCTATGATTGTGAATAAGTATAGACTGCGAGGTAATATTAGGAGTTAT
AATCTTGGTGGGATGGGTTGTAGTGCTGGAGTGATTGCGGTTGATCTTGCAAAAGATTTG
TTGCAAGTGAATTGGAACACCTATGCTGTTGTTGTCAGTACTGAGAATATTACTCAGAAT
TGGTATTTTGGGAATAAGAAGTCCATGCTGATACCCAATTGCTTGTTTCGAGTCGGGTGT
TCTGCAGTTTTGCTTTCTAATAAGCGTAAGGATAGGAGGCAGGCGAAGTATAGGCTTGTT
CATATTGTGAGGACGCACAAAGGGGCAGATGATAAGGCTTTTCGTTGTGTTTATCAGGAA
CAAGATGATCAAGGGAAGACGGGTGTTTCTCTATCAAAAGAACTGATGGCGATTGCTGGA
GGAGCACTTAAAACTAATATCACTACGCTGGGTCCTGTTGTGCTTCCAGTTAGTGAACAG
CTTTTGTTTTTTGCAACTCTGGTGATTAAGAAGCTTTTCAATAGGAATGTCAAGCCTTAC
ATCCCGGATTTCAAGCTGGCTTTTGATCATTTCTGTATACATGCTGGTGGCAGGGCTGTG
ATTGATGAGTTGGAGAAGAATCTGCAGTTGCTACCGGTCCATGTAGAGGCTTCTCGAATG
ACTCTTCACCGTTTCGGGAATACCTCGTCGAGCTCTATCTGGTATGAGCTAGCATATATT
GAAGCCAAGGGGAGGATGTGCAGGGGTCACCGCGTCTGGCAGATTGCCTTTGGAAGTGGT
TTCAAATGTAACAGTGCTGTATGGCAGGCGCTCCAGAATGTGAAACCATCTCATCATAGT
CCCTGGGAAGATTGCATTGATAATTATCCTGTGAAATTAATCAGCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Cs3g24890.1
PEP Infomation
Sequence

MEQSGPTYDSGSGGGAPVGVRIQHNRRLPDFLQSVNLKYVKLGYHYLISNLLTLCFIPLI
IITSIQVSEMNIDDLRQLWIHLQFNLVSVVICSAILVFGLTVFIMTRPRPVYLVDYSCYK
PPHNLKASYDKFMEHSKLTGDFDESSLEFQRKILERSGLGEETYFPEAMHAIPPKPSMAA
AREEAEQVMYGALDNLFSNTNVNPKDIGILVVNCSLFNPTPSLSAMIVNKYRLRGNIRSY
NLGGMGCSAGVIAVDLAKDLLQVNWNTYAVVVSTENITQNWYFGNKKSMLIPNCLFRVGC
SAVLLSNKRKDRRQAKYRLVHIVRTHKGADDKAFRCVYQEQDDQGKTGVSLSKELMAIAG
GALKTNITTLGPVVLPVSEQLLFFATLVIKKLFNRNVKPYIPDFKLAFDHFCIHAGGRAV
IDELEKNLQLLPVHVEASRMTLHRFGNTSSSSIWYELAYIEAKGRMCRGHRVWQIAFGSG
FKCNSAVWQALQNVKPSHHSPWEDCIDNYPVKLIS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs3g24890.1
Transcript Infomation

gene=Cs3g24890 CDS=73-1620
Sequence

GAAAAAAAAAATTATAGTAAAAAGTTGACCTCCCCCCCCATCTCTCTCTCTCTCTGTCTA
TCACTACCGGCAATGGAACAAAGCGGCCCAACATACGACAGTGGTAGCGGCGGCGGTGCT
CCGGTTGGTGTTCGGATCCAACACAATAGAAGGTTACCCGATTTCTTACAAAGCGTGAAT
CTTAAGTACGTAAAACTTGGGTACCATTACCTCATTTCAAATCTATTAACACTATGTTTC
ATTCCCTTAATTATAATCACCTCTATTCAAGTTTCGGAAATGAACATTGATGATCTACGT
CAGTTGTGGATTCACCTTCAGTTCAATCTCGTAAGCGTTGTTATTTGCTCAGCCATTCTT
GTTTTTGGCTTAACGGTTTTTATCATGACTCGGCCAAGACCGGTTTATTTAGTTGATTAC
TCCTGTTACAAACCACCCCATAATCTCAAAGCCTCGTATGATAAATTCATGGAGCATTCG
AAGTTAACAGGGGATTTTGATGAGTCCTCTCTCGAGTTCCAGCGCAAGATTCTTGAGCGT
TCTGGGCTTGGAGAGGAGACTTATTTCCCTGAAGCTATGCATGCTATTCCACCTAAGCCA
TCAATGGCTGCTGCCAGAGAAGAGGCTGAGCAGGTCATGTATGGTGCGTTGGATAACCTT
TTTAGTAATACAAATGTTAATCCCAAAGATATTGGTATTCTTGTTGTCAATTGTAGTTTG
TTTAATCCTACACCGTCTTTGTCAGCTATGATTGTGAATAAGTATAGACTGCGAGGTAAT
ATTAGGAGTTATAATCTTGGTGGGATGGGTTGTAGTGCTGGAGTGATTGCGGTTGATCTT
GCAAAAGATTTGTTGCAAGTGAATTGGAACACCTATGCTGTTGTTGTCAGTACTGAGAAT
ATTACTCAGAATTGGTATTTTGGGAATAAGAAGTCCATGCTGATACCCAATTGCTTGTTT
CGAGTCGGGTGTTCTGCAGTTTTGCTTTCTAATAAGCGTAAGGATAGGAGGCAGGCGAAG
TATAGGCTTGTTCATATTGTGAGGACGCACAAAGGGGCAGATGATAAGGCTTTTCGTTGT
GTTTATCAGGAACAAGATGATCAAGGGAAGACGGGTGTTTCTCTATCAAAAGAACTGATG
GCGATTGCTGGAGGAGCACTTAAAACTAATATCACTACGCTGGGTCCTGTTGTGCTTCCA
GTTAGTGAACAGCTTTTGTTTTTTGCAACTCTGGTGATTAAGAAGCTTTTCAATAGGAAT
GTCAAGCCTTACATCCCGGATTTCAAGCTGGCTTTTGATCATTTCTGTATACATGCTGGT
GGCAGGGCTGTGATTGATGAGTTGGAGAAGAATCTGCAGTTGCTACCGGTCCATGTAGAG
GCTTCTCGAATGACTCTTCACCGTTTCGGGAATACCTCGTCGAGCTCTATCTGGTATGAG
CTAGCATATATTGAAGCCAAGGGGAGGATGTGCAGGGGTCACCGCGTCTGGCAGATTGCC
TTTGGAAGTGGTTTCAAATGTAACAGTGCTGTATGGCAGGCGCTCCAGAATGTGAAACCA
TCTCATCATAGTCCCTGGGAAGATTGCATTGATAATTATCCTGTGAAATTAATCAGCTAG
CTCACCTCAATGGTATTAACGTCGGGGGTACTTGACTACCAGTTTGTTTATATTGTACCA
CATCACGTCATGATTGTCAATAATTGCTTATGTCATTATTACAGAATGCTCTAATCTTTC
TTTCAACCAGAAGTTTAATAGCGAAATAGTAGATCCTCGTTTTACTTCTCAGAGCCGCTA
GGTTCTCGGAGTATGAGGAGGGAATGACACCGCCGGCCTTTTTATCTTTTAACGTAAGTT
TACGATTTTTAATTTCGAAAATAAGTTAAAAAGAAG