Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs3g23000.3
CDS Infomation

gene=Cs3g23000
Sequence

ATGATGACCTCACTTTATTTTTCTCCTCGGATTATTTATCTAAATCTCTTGTTGGAGTCT
TTTGGAGCATTGCAACATCAGTATGACTTTTCTTTTTTTCAAGTTGTTTCTCTCTTTTTG
ACATTATGCCAGAGTGACAGTGAATACATGGCTGGTCAGCTATCAGCATTTGGTTATGCA
TTAACTGACAATTCTGAGGAGGCAGACATATGGCTCATCAATACTTGCACAGTTAAATCC
CCTAGTCAGTCTGCTATGGATACTTTAATAGCAAAATGTAAGAGTGCAAAAAAGCCCCTA
GTGGTAGCTGGGTGTGTGCCTCAAGGAAGTCGGGACTTGAAAGAGCTAGAAGGGGTCAGT
ATTGTTGGAGTCCAGCAAATTGATCGTGTTGTTGAAGTTGTTGAAGAGACTTTGAAAGGT
CATGAGGTGCGGCTTCTACATCGCAAGAAATTACCAGCTCTTGACCTCCCAAAGGTTAGG
AGGAACAAGTTTGTTGAGATTCTACCAATTAATGTTGGTTGTTTAGGTGCTTGTACTTAT
TGCAAGACAAAACATGCCCGCGGCCATTTGGGGAGCTACACTGTCGAAAGCCTTGTAGGC
CGTGTAAGAACTGTTATAGCTGATGGAGTTAAGGAGGTGTGGCTGAGCAGCGAAGATACT
GGAGCATACGGTCGTGACATTGGGGTTAACCTTCCAATTTTGTTAAATGCTATCGTTGCT
GAACTTCCTCCTGATGGGAGCACAATGCTTCGAATTGGGATGACTAATCCTCCTTTCATT
CTTGAGCATCTGAAAGAAATAGCGGAAGTTTTGCGTCACCCATGTGTATACTCCTTTCTT
CATGTACCAGTCCAATCTGGGAGTGATGCTGTCTTGAGTGCAATGAATCGGGAATATACT
TTGAGTGACTTCAGGACTGTGGTAGACACCTTGATTGAACTTGTGCCAGGGATGCAGATT
GCAACTGATATAATTTGTGGATTTCCAGGTGAGACTGATGAAGATTTTAATCAAACTGTT
AACCTCATCAAGGAGTACAAGTTCCCCCAAGTTCACATTTCACAGTTTTATCCCAGACCA
GGGACACCTGCTGCAAGGATGAAAAAGGTGCCAAGTGCTGTAGTGAAGAAACGGAGCCGT
GAATTGACATCTGTTTTTGAAGCTTTCACACCGTATCTTGGAATGGAGGGTAGAGTGGAA
AGAATATGGATAACTGAAATTGCAGCCGATGGAATTCACCTGGTTGGCCATACCAAGGGA
TATGTGCAGGTACTTGTACCTAGCACAGGAAATATGCTGGGTACCTCAGCTTTGGTGAAG
ATAACATCTGTTGGAAGGTGGTCAGTGTTTGGAGAAGTTATCAAAATTCTCAACCAAGTA
GATGATAAAATAGCGTCAAACAGGAGAATATCTAGTCAGGTTCGTCAGGACAAATGTTCT
TCCTGCTCCAGCCAAAATGAATCTAGTGCATGTTCAAATGAGCCAGATCCTAGTGCTTGT
GGATTGGAATGCTGTGAAGGAAAAATTACTTTGGAGGAAGGCCAAGTTTCCTGGATTGAC
AGATTTGCAGAAGATATAAACAGCCAAAATGTTATTGGATGGTTGCTAAGGAAGCGGAAG
AACCAGTTGAAAGGAGTGGAAAATGATGTTGCCTTGGGATCCAAGAAAAAGCAGGAATGG
ATGGGAGGGAATATGGGCGAGTGGGGTGTTGTGGATAGGGCTCTTCTGGGTGGAATGCTT
GTTAGTTTCTTGATAATTTTAGCACTGCTTATACACGTAGGATTTAGAACATTGTCAACC
AAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs3g23000.3
PEP Infomation
Sequence

MMTSLYFSPRIIYLNLLLESFGALQHQYDFSFFQVVSLFLTLCQSDSEYMAGQLSAFGYA
LTDNSEEADIWLINTCTVKSPSQSAMDTLIAKCKSAKKPLVVAGCVPQGSRDLKELEGVS
IVGVQQIDRVVEVVEETLKGHEVRLLHRKKLPALDLPKVRRNKFVEILPINVGCLGACTY
CKTKHARGHLGSYTVESLVGRVRTVIADGVKEVWLSSEDTGAYGRDIGVNLPILLNAIVA
ELPPDGSTMLRIGMTNPPFILEHLKEIAEVLRHPCVYSFLHVPVQSGSDAVLSAMNREYT
LSDFRTVVDTLIELVPGMQIATDIICGFPGETDEDFNQTVNLIKEYKFPQVHISQFYPRP
GTPAARMKKVPSAVVKKRSRELTSVFEAFTPYLGMEGRVERIWITEIAADGIHLVGHTKG
YVQVLVPSTGNMLGTSALVKITSVGRWSVFGEVIKILNQVDDKIASNRRISSQVRQDKCS
SCSSQNESSACSNEPDPSACGLECCEGKITLEEGQVSWIDRFAEDINSQNVIGWLLRKRK
NQLKGVENDVALGSKKKQEWMGGNMGEWGVVDRALLGGMLVSFLIILALLIHVGFRTLST
K*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs3g23000.3
Transcript Infomation

gene=Cs3g23000 CDS=944-2749
Sequence

ACGATGCCTCTTTGGCAGTCGGACAATTTGGGCTAAAATTCAAAACAAATTAAAAGAAGG
TCATTTGTTCATGGAGCCATCTGTGTGTTTTGTGCTCGCCGAATAAGCAGCTATCTTGGC
AGCTGCTACATTGCGTAGAGTGAATAAGCAAATGGAAGACATAGAAGATTTGTTGGCTGG
CAGCGGAGGTGGCGGTGCTCCTCCCGGTTTCAGATTGCCAATCAATGCCGTCGGTGTAAA
TCCGAAGTATAATAAGAACAAACCGCGGCTTCATGATAACCACCTCTCCAAAACTGGCTC
TCTCTCCCCCAAAATTCCTGGAACTGAGGTACTTTCTTTTTTCTTTTTTGGTTCGCCATT
TATCTTTATTTTTTTGTTTTAAGTTTTGTTTATTTTTCCAACTTTTGATTTTGTATTTTA
CAGACCATATATATGAAGACCTTTGGATGCTCACATAACCAGGTATTTATACGTACCATT
ACATTGTAATACAATTGTTTTGCAAAATTAGGTTTTCAAGAGTCATTTGTGATTTTTGCT
TTTATGAATAGGATTTAGTGTTTACTGTAAAAATAATAAGAACAACAACAACGATGATGA
TGATGATGATAATGATTGCCTTTCATTCTGTAATCAGGTCGTAGTTAGTTTATAAAAAGT
ATACTAATAAATTTAACAAGTTAATTAACCCAGAGATGTGTCATTCAATACAGAACAGCA
AACATACATCTCATTTAACTGTGTCCTTCATTTACATAATCTCTCTTCAAATCTGATATA
GGACAAGTTAAGAATATTGGAGTGTATTCTACATTTCTTATTCTTAGTAGGTAAGTTTGT
GAGTGGTGTTTGTTACTTTCATTGTACTGGGATTTTAGTTATAGGATTAGAGATAGTCTT
CTATAAATAGTGTTGTAATCTCTATTAGCTTTTCAAGTTTTGAATGATGACCTCACTTTA
TTTTTCTCCTCGGATTATTTATCTAAATCTCTTGTTGGAGTCTTTTGGAGCATTGCAACA
TCAGTATGACTTTTCTTTTTTTCAAGTTGTTTCTCTCTTTTTGACATTATGCCAGAGTGA
CAGTGAATACATGGCTGGTCAGCTATCAGCATTTGGTTATGCATTAACTGACAATTCTGA
GGAGGCAGACATATGGCTCATCAATACTTGCACAGTTAAATCCCCTAGTCAGTCTGCTAT
GGATACTTTAATAGCAAAATGTAAGAGTGCAAAAAAGCCCCTAGTGGTAGCTGGGTGTGT
GCCTCAAGGAAGTCGGGACTTGAAAGAGCTAGAAGGGGTCAGTATTGTTGGAGTCCAGCA
AATTGATCGTGTTGTTGAAGTTGTTGAAGAGACTTTGAAAGGTCATGAGGTGCGGCTTCT
ACATCGCAAGAAATTACCAGCTCTTGACCTCCCAAAGGTTAGGAGGAACAAGTTTGTTGA
GATTCTACCAATTAATGTTGGTTGTTTAGGTGCTTGTACTTATTGCAAGACAAAACATGC
CCGCGGCCATTTGGGGAGCTACACTGTCGAAAGCCTTGTAGGCCGTGTAAGAACTGTTAT
AGCTGATGGAGTTAAGGAGGTGTGGCTGAGCAGCGAAGATACTGGAGCATACGGTCGTGA
CATTGGGGTTAACCTTCCAATTTTGTTAAATGCTATCGTTGCTGAACTTCCTCCTGATGG
GAGCACAATGCTTCGAATTGGGATGACTAATCCTCCTTTCATTCTTGAGCATCTGAAAGA
AATAGCGGAAGTTTTGCGTCACCCATGTGTATACTCCTTTCTTCATGTACCAGTCCAATC
TGGGAGTGATGCTGTCTTGAGTGCAATGAATCGGGAATATACTTTGAGTGACTTCAGGAC
TGTGGTAGACACCTTGATTGAACTTGTGCCAGGGATGCAGATTGCAACTGATATAATTTG
TGGATTTCCAGGTGAGACTGATGAAGATTTTAATCAAACTGTTAACCTCATCAAGGAGTA
CAAGTTCCCCCAAGTTCACATTTCACAGTTTTATCCCAGACCAGGGACACCTGCTGCAAG
GATGAAAAAGGTGCCAAGTGCTGTAGTGAAGAAACGGAGCCGTGAATTGACATCTGTTTT
TGAAGCTTTCACACCGTATCTTGGAATGGAGGGTAGAGTGGAAAGAATATGGATAACTGA
AATTGCAGCCGATGGAATTCACCTGGTTGGCCATACCAAGGGATATGTGCAGGTACTTGT
ACCTAGCACAGGAAATATGCTGGGTACCTCAGCTTTGGTGAAGATAACATCTGTTGGAAG
GTGGTCAGTGTTTGGAGAAGTTATCAAAATTCTCAACCAAGTAGATGATAAAATAGCGTC
AAACAGGAGAATATCTAGTCAGGTTCGTCAGGACAAATGTTCTTCCTGCTCCAGCCAAAA
TGAATCTAGTGCATGTTCAAATGAGCCAGATCCTAGTGCTTGTGGATTGGAATGCTGTGA
AGGAAAAATTACTTTGGAGGAAGGCCAAGTTTCCTGGATTGACAGATTTGCAGAAGATAT
AAACAGCCAAAATGTTATTGGATGGTTGCTAAGGAAGCGGAAGAACCAGTTGAAAGGAGT
GGAAAATGATGTTGCCTTGGGATCCAAGAAAAAGCAGGAATGGATGGGAGGGAATATGGG
CGAGTGGGGTGTTGTGGATAGGGCTCTTCTGGGTGGAATGCTTGTTAGTTTCTTGATAAT
TTTAGCACTGCTTATACACGTAGGATTTAGAACATTGTCAACCAAATGAATTTTTTTTTA
ATATAAATAAATGTAACTTTCTTGTATTGATTTGTTTTATGAAGCGTGTGTGTAACCAAT
TTGAAAATAAGTTCACTGATAAAATTGATCTCCATGGATAGCATGATTTCATATGGTT