Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs3g22870.2
CDS Infomation	gene=Cs3g22870
Sequence	ATGATGACTCTCTTGGCTTTGATAACTTTGCTAAGCAGTTCAGATTGCCAAAATAACAAC ACTGCCAAATCCTGTTCTCCTCATCATTTCCAAATAATCGTATTTATCTTCTCCCTATAT CTAGTAGCCATTGGTCAAGGAGGGCACAAGCCTTGCACTCAGGCATTTGGTGCTGATCAG TTTGATGCACAGAACCCTCAGGAACGCAGAGCCAAAAGCTCTTTTTTCAATTGGTGGTAT TTTGGTATATCCTTTGGCGCCAATTCAACAATTCTGGTTGTAATTTACATCCAAGATAAC CTTAATTGGGCTCTTGGATTTGGGATTCCCTGTGCCTTTATGGTAGCTGCACTTGTTCTT TTCCTACTTGGAACTAAGACCTACAGGTTTAGCATTAAAAGTAAACAGAGAAACCCATTT GCAAGAATTGGTCGAGTGTTTGTTGTTGCAATTAAGACCAGGAAAGCTACCCTGGCTAGT GAAGATGAAGCTCAAAGTTCTCAGCAGTTCAAGTTTCTGAACAAGGCCTTGCTTGCAACA CCAGATGTGTCATTGGAAGATGGGAAGCTGTGTACACTTGAGGATGTTGAAGAGGCAAAG GCATTATTAAGACTTATTCCAATATGGGCAACCTGCTTGGTGTATGCTATTGTATTTGCA CAATACACAACGTTCTTCACAAAGCAAGGAGCTACAATGGACAGAACCATCACTCGAAGC ATCAAAATCCCAGCTGCTTCACTGCAATTGTTTATTGGTATTGGCATTATCACCTTCATT CCAATCTATGATTGCATTTTTGTTCCGATAACAAGATATTTCACCCAAAATCCTTCTGGT ATCACAATGCTTCAAAGAATTGGAGCTGGGATGCTTTTATCATCTATTTCCATGGTAGTT GCAGCTTTAGTAGAAATAAAAAGGCTTGAAACAGCAAAAGAGTATGGACTGATTGACAAG CCAAATGTGACAATTCCAACGAGTGTGTGGTGGTTGATTCCTCAATATTTATTATGTGGG ATTGCAGATGTTTTCACTATAGTTGGTCTACAAGAATTCTTCTATGATCAAATTCCCAAA GAATTAAAGAGTTTTGGTCTCTCCATTTACATGAGTGTGCTTGGAGTTGGGGGCTTCCTT AGTAGCATTCTGGTGTCAATTATCAATGAAGCAACAAGTAGAGATGGCGGGGACAGCTGG TTTGCTGATAATTTGAATCGAGCGCATCTTGATTATTTTTATTGGTTACTTGCTGCACTT AGTGCTGGAGGATTGCTAGCCTTTTTGTATTTTGCAAAATCTTATAACAGAGAAAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Cs3g22870.2
PEP Infomation
Sequence	MMTLLALITLLSSSDCQNNNTAKSCSPHHFQIIVFIFSLYLVAIGQGGHKPCTQAFGADQ FDAQNPQERRAKSSFFNWWYFGISFGANSTILVVIYIQDNLNWALGFGIPCAFMVAALVL FLLGTKTYRFSIKSKQRNPFARIGRVFVVAIKTRKATLASEDEAQSSQQFKFLNKALLAT PDVSLEDGKLCTLEDVEEAKALLRLIPIWATCLVYAIVFAQYTTFFTKQGATMDRTITRS IKIPAASLQLFIGIGIITFIPIYDCIFVPITRYFTQNPSGITMLQRIGAGMLLSSISMVV AALVEIKRLETAKEYGLIDKPNVTIPTSVWWLIPQYLLCGIADVFTIVGLQEFFYDQIPK ELKSFGLSIYMSVLGVGGFLSSILVSIINEATSRDGGDSWFADNLNRAHLDYFYWLLAAL SAGGLLAFLYFAKSYNREN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs3g22870.2
Transcript Infomation	gene=Cs3g22870 CDS=1160-2479
Sequence	CGTTTTTTCATCTCATTTTCATATAAGGGATGGAAAAGGATTTCCCATCCCGTCCCCTTA CCAACCCTACTCGGATGGTACACAGTCGCTGCCTGCTACTCCATCAAACAGTAGAATGAT TATGTAACAGTACCTCTAGAACTGAAAGTCTTTGATCGCTGAGCATTTATGGCTATCTCT GAGCTTTCTACCACCGAAACTCTGCTCCCAGAAAACACAATTGGCTTTGTGGATCACCAG GGTCGTCCGATCGACAGATTAAACTCCGGTGGCTGGAGAGCAGCATCTTTCATTATAGGT GTTGAAGTTGCAGAGAGGTTTGCATATTATGGGATATCATCAAATCTCATTACATATTTG ACGGGACAGCTTGGTGAGTCGACGGCGACGGCAGCTGCGGCGGTCAATGTCTGGTCGGGA ACGGCGTCGCTGCTACCCCTTTTAGGGGCATTTCTTGCTGATTCTTTTCTTGGCCGTTTT CGCACCATCGTTGTTGCTTCTCTCATTTACATCTTGGTTAGTGTCTCTTTCCCCTTCCCT CTCTGTCGATCCAAAATTTATTCTAACAAAATAATAAATAATATTTACATTTTTTAGTGT TTTGTTGTCCTAATTTTAGTTTACTACTGAAACATGACCCTGCGCTGACATTAACAATTT TACCAAGTTCGCTGCTGTTATAGAATTTTTTTTTTTTGTCGGTGACAGATTTTTAACTAT TATTATAATGTTTTATTTTTATATATTTTATCTTTAACCAATTCAATTTAGTGGACACAT GCTAATCATGAAAATTATAGGGGATAAATTGTAAAATCCGAAGTTATTGGGGGCAAATAG CAATCTCTCCTAAAGCTCTAGCAATTTATGTTACTACCCACATAAAATTGAAGGTTTTTT TTTTTTAAAGTAAATAAATTGAAGAGTCCAGCAACGAAAATATGCAATCTTTATCTTTTA TTATGGTTCATCTGCAAATGTGTATGAACAAGAGAAGTAAAGGAAATGAGCTTTTATTCT GGTACATTATCAATGGAATGATCGAGGAATTCTCCACCAAAATATTATCTGATAGCACAT GCCTATATTGATTCTTTTTAAATTTATGCCATAAACTTGTAGCTTTGATTCAGCTTACAA TGCATCACAGGGACTAAGCATGATGACTCTCTTGGCTTTGATAACTTTGCTAAGCAGTTC AGATTGCCAAAATAACAACACTGCCAAATCCTGTTCTCCTCATCATTTCCAAATAATCGT ATTTATCTTCTCCCTATATCTAGTAGCCATTGGTCAAGGAGGGCACAAGCCTTGCACTCA GGCATTTGGTGCTGATCAGTTTGATGCACAGAACCCTCAGGAACGCAGAGCCAAAAGCTC TTTTTTCAATTGGTGGTATTTTGGTATATCCTTTGGCGCCAATTCAACAATTCTGGTTGT AATTTACATCCAAGATAACCTTAATTGGGCTCTTGGATTTGGGATTCCCTGTGCCTTTAT GGTAGCTGCACTTGTTCTTTTCCTACTTGGAACTAAGACCTACAGGTTTAGCATTAAAAG TAAACAGAGAAACCCATTTGCAAGAATTGGTCGAGTGTTTGTTGTTGCAATTAAGACCAG GAAAGCTACCCTGGCTAGTGAAGATGAAGCTCAAAGTTCTCAGCAGTTCAAGTTTCTGAA CAAGGCCTTGCTTGCAACACCAGATGTGTCATTGGAAGATGGGAAGCTGTGTACACTTGA GGATGTTGAAGAGGCAAAGGCATTATTAAGACTTATTCCAATATGGGCAACCTGCTTGGT GTATGCTATTGTATTTGCACAATACACAACGTTCTTCACAAAGCAAGGAGCTACAATGGA CAGAACCATCACTCGAAGCATCAAAATCCCAGCTGCTTCACTGCAATTGTTTATTGGTAT TGGCATTATCACCTTCATTCCAATCTATGATTGCATTTTTGTTCCGATAACAAGATATTT CACCCAAAATCCTTCTGGTATCACAATGCTTCAAAGAATTGGAGCTGGGATGCTTTTATC ATCTATTTCCATGGTAGTTGCAGCTTTAGTAGAAATAAAAAGGCTTGAAACAGCAAAAGA GTATGGACTGATTGACAAGCCAAATGTGACAATTCCAACGAGTGTGTGGTGGTTGATTCC TCAATATTTATTATGTGGGATTGCAGATGTTTTCACTATAGTTGGTCTACAAGAATTCTT CTATGATCAAATTCCCAAAGAATTAAAGAGTTTTGGTCTCTCCATTTACATGAGTGTGCT TGGAGTTGGGGGCTTCCTTAGTAGCATTCTGGTGTCAATTATCAATGAAGCAACAAGTAG AGATGGCGGGGACAGCTGGTTTGCTGATAATTTGAATCGAGCGCATCTTGATTATTTTTA TTGGTTACTTGCTGCACTTAGTGCTGGAGGATTGCTAGCCTTTTTGTATTTTGCAAAATC TTATAACAGAGAAAATTAATATTGTTTAGATGTTTCCTTTTTTTTAAAAAAAAAAGTTAT GGGATTACGAAACTAGATTTAAATGTTTTATCAATATTATAAATTCTAATAAATCTCTAC GTCA