Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs3g11280.3
CDS Infomation

gene=Cs3g11280
Sequence

ATGAGAGATTTTCCATCTTGTTTTGGGGAAAATGGGGTACAAGTAGCAGATTCTTCATCT
TCAAACGCTGCTAAAAATGCACAGAATTTGGTTACTTCTGTTTATCAAGCTCGTATTCGA
GGCAGGTCTTGCTTGATTACTATTACATGGAGCAAGAATTTGATGGGTCAAGGCCTTTCT
GTGGGGATTGATGATGCTTCAAACCAATGTCTTTGTAAAGTTGATATTAAACCTTGGTTG
TTCTCGAAAAGGAAAGGGTCAAAGAGTTTAGAAGCTTATTCTTGTATAATTGACATCTAT
TGGGACCTTTCCTCGGCAAAATTTGGTTCTGGGCCTGAACCATTGGAGGGATTTTATGTG
AGTGTTGTTGTTGATAGGCAAATGGTTTTGCTTCTTGGGGATATGAGAAAAGAAGCTTTT
AAGAAGACTAATGCCACCCCTGTTCCTTCTAATGCCGTTTTCGTTGCTAAAAGGGAGCAT
CTTTTTGGCAAGAAAGTGTTTTTTACCAAGGCACAGTTTTGCAATGGTGGGCAAATCCAT
GATCTTGTGATTGAATGTGACACACATGGAATGAATGATCCATGCCTCATGGTTCGTGTA
GATGGAAAAAGTGTGATGAAGGTGAAGCATCTCAGGTGGAAGTTCAGGGGAAATCATACT
ATCTTGGTTGATGGGCTGCCGGTGGAAGTTTTCTGGGATGTTCACAATTGGCTTTTTGGT
GCATCAGTTGGGAATGCTGTTTTCATGTTCAAGACATGCCTCTCAGCCGAGAAGCTGTGG
GCTAGTGGACCCCTTTCTGATCCAAACACATTGCCATGGTCATTCTCGCAGAGATTCCTA
GATTCCAAGTCTCAAAGTCTTGGTTTTTCACTGATTTTGTATGCTTGGAAGAATGAATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Cs3g11280.3
PEP Infomation
Sequence

MRDFPSCFGENGVQVADSSSSNAAKNAQNLVTSVYQARIRGRSCLITITWSKNLMGQGLS
VGIDDASNQCLCKVDIKPWLFSKRKGSKSLEAYSCIIDIYWDLSSAKFGSGPEPLEGFYV
SVVVDRQMVLLLGDMRKEAFKKTNATPVPSNAVFVAKREHLFGKKVFFTKAQFCNGGQIH
DLVIECDTHGMNDPCLMVRVDGKSVMKVKHLRWKFRGNHTILVDGLPVEVFWDVHNWLFG
ASVGNAVFMFKTCLSAEKLWASGPLSDPNTLPWSFSQRFLDSKSQSLGFSLILYAWKNE*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs3g11280.3
Transcript Infomation

gene=Cs3g11280 CDS=246-1145
Sequence

GTTTTGTCTTTGAGTATATATGTGTGTCTCTCATGTTTTCTTTTAACTTTTATTTCATGG
GCTTTTTGTGGAAAAAATGTTTCAGATTTTATATCCAGATCAAATCAAGCTTGACGGGCA
GATTTTGGAGCACTTCTGAGATGGGTTTTCAGCTTTGTCTCTTGTAAGTGGAGGTTTCAA
AAAAGGGTTGTTAAAAGGCTTGTATAGAGAGTTTGTAAAAGTGAATTGAATTTACTGGGT
TAAAAATGAGAGATTTTCCATCTTGTTTTGGGGAAAATGGGGTACAAGTAGCAGATTCTT
CATCTTCAAACGCTGCTAAAAATGCACAGAATTTGGTTACTTCTGTTTATCAAGCTCGTA
TTCGAGGCAGGTCTTGCTTGATTACTATTACATGGAGCAAGAATTTGATGGGTCAAGGCC
TTTCTGTGGGGATTGATGATGCTTCAAACCAATGTCTTTGTAAAGTTGATATTAAACCTT
GGTTGTTCTCGAAAAGGAAAGGGTCAAAGAGTTTAGAAGCTTATTCTTGTATAATTGACA
TCTATTGGGACCTTTCCTCGGCAAAATTTGGTTCTGGGCCTGAACCATTGGAGGGATTTT
ATGTGAGTGTTGTTGTTGATAGGCAAATGGTTTTGCTTCTTGGGGATATGAGAAAAGAAG
CTTTTAAGAAGACTAATGCCACCCCTGTTCCTTCTAATGCCGTTTTCGTTGCTAAAAGGG
AGCATCTTTTTGGCAAGAAAGTGTTTTTTACCAAGGCACAGTTTTGCAATGGTGGGCAAA
TCCATGATCTTGTGATTGAATGTGACACACATGGAATGAATGATCCATGCCTCATGGTTC
GTGTAGATGGAAAAAGTGTGATGAAGGTGAAGCATCTCAGGTGGAAGTTCAGGGGAAATC
ATACTATCTTGGTTGATGGGCTGCCGGTGGAAGTTTTCTGGGATGTTCACAATTGGCTTT
TTGGTGCATCAGTTGGGAATGCTGTTTTCATGTTCAAGACATGCCTCTCAGCCGAGAAGC
TGTGGGCTAGTGGACCCCTTTCTGATCCAAACACATTGCCATGGTCATTCTCGCAGAGAT
TCCTAGATTCCAAGTCTCAAAGTCTTGGTTTTTCACTGATTTTGTATGCTTGGAAGAATG
AATAGAGATATCTAGGAATTTTCTTTGAATGCTAACAAAAAGTTTTAGTGAGTGGTATTT
TTTTTCGAACTATGTTATTTATTCACAATTAAATTGATTAAAAATGAGTCCATTTGTATT
TTTCTCATGTGCTTTCCTCTTGAGCAACCATAGTAATTGAATGGATTTGAGACGATTTTG
TTGTTCTTAGTCCGCTGTATATCCTGAATACATTAATTATTAATTTCATTCTGTCTTCTA
CATTGAAGATTCATAAAAAGTGAATAGCCATGCTGTTGCAGTTTGATTTTGTTTAGCACA
TAATGTCTTGTTGAGTTGAAATATCCTTTAATTATCAATATTTGAGCATGGTATATTCTC
AATGTAAATATGCCTTCTTTTATAAAGCCAACTCAGCTAAGTTAATCAATCGGTCTCTTA
ATCATTTTCTATTAGTCGGGTTTGATTTCCTTCTGTGCAGGAGCTTGAGTTACTGGATGT
GCTTAATGATGTTGCACAGACACCTCTGAGTAAATGAAAACCTACCTTGAGCAGCAGAAA
GACTTCTGATGATCCATGGACTTTGGTATGAAATTCTTTCTGTTCATTTTGTCACGTCAG
TGAGTAATAACTACATGAACTATAAACTATTCTTGTATTTAATTGATGTTTTCAAGTACG
TAACCTGACAAAATATTGGGACTTAGTATGCCTTGGCTTATCTTTGTTTGATGCTTGTTT
GGAAATTGTTGCACCTTAACGTTTGGACTGTTTTACTTTATTATCACAGAATACATTTCT
ATTCTGCCATTTTCACAAATTAAGCCTCAGGAACCACAAAAGCTATGGATTCATCTTCAT
TTCCTTCCTTTAAAGAAAGAGGACAAAAGAGAATTCTTTTACTTTCTCTCTACCTTTGCA
ATTTTGTAGCTTTGAGCATTTCACTCAGCCATTTTTTTCATTCTTTTTTATACACATAGT
TTTCTTTTGCTCCCTTAGTCTCGTATAAATAGTTAGTTTGATAAGATTAAGACAAGTTTG
GAGTGGTGTGCAATTCATGATATGTCCCAACTCAACTTTGCTGCATCTCTGAATTGCTGC
TTATGTTTTAGAGGACAGATGAGCAGTCTAATAAGATGTAAGTACCATTTATTAGTTATG
TAACTAGAGATTATAGGAAGCATATTTGAAGGGAATAAAATGATTGTGAAGAATAATTTA
TGATGTAAAAATAAAAACGTAGACATAAACAATGTTCCTTGGCAAAAGAAAATGAGACAG
CTACTTTACATTTTGACTTGGCTGGCAAAGGCCTGCAGCATTTTTGAAGCCTTCGGCTAC
ATATATTGCCTCTGGTACTTTGGCCTTTTCATGAGTATGTCTTGTTGTTTACAGTTTAAG
CATGTTTTTCGAATTTGATGCACTGCAATGTCATTTTCAATTTACATTTTGTTTGGAACC
TACTTTTATGTCAGGGAATGTCCACACCATCGGCTCCGGTGCTCTAAGTTCTTGAATCTT
TACTTCTTAATTTAGTTTCCTTACCTTACCACCTTTTATCATATTTGAAACTCGCATGCA
TAAAGCTAGCTTGGTTGGTAATAACAATAGAAGCATTATGTACAACTTCTACATTTAGCT
TCAAATAGAACATATTCTCCTATGCTTTGTGATTGGTGAAATAGTGTTTAAGGACGAAGT
TACCCACAGCTCCTCCTTATACCCGCAAACTATGTGTTTAATGATCCCTGTGCTGGTGAG
GAAGATTCATTTCGAATTTGTTTTAGAACTCAAGCTTTGTGACAGAGTAAGAAGAATTAT
GATCTGCACTGCTTATGAGTTGTTCACCAACCATGAATGCATCACCTGTCAACTTCATTG
TTTGCGTCTCCTCTCTGGTTGACTTGCCGCAGGAGGGTTATTTTTGGTTCATATTCTTTT
GATCCTCTTCTCCCATTTCATAGTCAAAAGTTTTTACTTAACCGTGTATTACAAGCTGTT
TATCTACTGACTGGCATGGTGAACAAGCATCATCCTCAGTTATCCTTTAAGAGAAGAAAA
GGAAAAAAAAAATTTGCATCTATTGCAAATTCTCTGAAAGAAGAATTTGGAGGAGTAGAG
TAATCTTTTATTATCATGTAATTAATCTATTCTTTACTTTCCAG