Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs3g07460.2
CDS Infomation

gene=Cs3g07460
Sequence

ATGGCTCAGCTTTTACACCCCTCCTTTAGCAATTTCACATTCAATTCAGTAAAACTGAAA
TCGATAAGAGGTTCCAGAACCCAGAAAACCAATTCGAAATCATTTTGTTGTGTGCTTACT
GAAGATAACCGAACAAGTGTGGTTAAGAATGGGAATGATATGTTGGATATATGTAGGGTT
GTGAATGGGATGTGGCAGACAAGTGGTGGATGGGGTAAAATTGATACAAACAACGCTGTC
AATGCTATGCTTCATTATGCTGATGCTGGACTTACCACTTTTGACATGGCTGATATATAT
GGGCCTGCTGAAGATCTCTATGGCATCTTCATCAATCGAGTTCGTCGAGAGAGGCCACCA
GAGTTCTTGGATAAGGTCAGAGGTCTCACTAAATGGGTACCTCCACCAGTCAAGATGACA
AGTAGCATCGTTAGAGAGAGCATCGATGTATCAAGGAGGCGGATGGATGTACCTTGCTTG
GACATGCTTCAGTTTCATTGGTGGGATTATTCTAATCCTGGTTACCTTGATGCACTAAAT
CACCTTACAGATCTGAAAGAAGAAGGTAAAATTAAGACTGTTGCTTTGACAAATTTTGAC
ACGGAAAGACTGCGAATAATACTGGAGAATGGTATCCCTGTTGTTAGCAATCAGGTGCAA
CATTCAGTTGTTGACATGCGTCCCCAGCAGAAAATGGCAGAGCTTTGTCAGCTCACAGGA
GTCAAACTAATAACGTATGGCACAGTAATGGGTGGTTTGTTATCTGAAAAGTTCCTTGAC
ACCAACTTGTCGATTCCTTTTGCTGGCCCCCCATTGAACACTCCGTCCCTTCAGAAGTAC
AAAAGGATGGTTGATGCCTGGGGAGGGTGGAGTCAGTTCCAAGTTTTGCTTCAGACACTG
AAAAGAATAGCTTCCAAACATGGGGTATCAATTCCAGTTGTTGCTGTAAGATACATACTA
GACCAGCCAGCAGTTGCAGGATCAATGATAGGGGTGAGACTCGGTTTAGCAGAACATATA
CAGGACACCAATGCCATCTTCATGCTCTCTCTCGATGAAGATGATGTTAACAGCATACAA
GAAGTTACCAAAAAGGGGAAGGATTTGCTTGGAGTGATTGGTGATTGTGGAGACGAGTAT
AGGCGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs3g07460.2
PEP Infomation
Sequence

MAQLLHPSFSNFTFNSVKLKSIRGSRTQKTNSKSFCCVLTEDNRTSVVKNGNDMLDICRV
VNGMWQTSGGWGKIDTNNAVNAMLHYADAGLTTFDMADIYGPAEDLYGIFINRVRRERPP
EFLDKVRGLTKWVPPPVKMTSSIVRESIDVSRRRMDVPCLDMLQFHWWDYSNPGYLDALN
HLTDLKEEGKIKTVALTNFDTERLRIILENGIPVVSNQVQHSVVDMRPQQKMAELCQLTG
VKLITYGTVMGGLLSEKFLDTNLSIPFAGPPLNTPSLQKYKRMVDAWGGWSQFQVLLQTL
KRIASKHGVSIPVVAVRYILDQPAVAGSMIGVRLGLAEHIQDTNAIFMLSLDEDDVNSIQ
EVTKKGKDLLGVIGDCGDEYRR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs3g07460.2
Transcript Infomation

gene=Cs3g07460 CDS=158-1306
Sequence

TTGTTATAAAAGTGATGTTAGTGAATGGTAGTTGATGACAGAGAGCAGATAAGGCTACAT
TGAAAAAAACTAGATTTTCATTTTTAGGTGAATTAGGAAAATACCCTTTAAAGTTTGCTC
TGTCTATTCATTCATATTTAGCATCTTTCTTTTCAAAATGGCTCAGCTTTTACACCCCTC
CTTTAGCAATTTCACATTCAATTCAGTAAAACTGAAATCGATAAGAGGTTCCAGAACCCA
GAAAACCAATTCGAAATCATTTTGTTGTGTGCTTACTGAAGATAACCGAACAAGTGTGGT
TAAGAATGGGAATGATATGTTGGATATATGTAGGGTTGTGAATGGGATGTGGCAGACAAG
TGGTGGATGGGGTAAAATTGATACAAACAACGCTGTCAATGCTATGCTTCATTATGCTGA
TGCTGGACTTACCACTTTTGACATGGCTGATATATATGGGCCTGCTGAAGATCTCTATGG
CATCTTCATCAATCGAGTTCGTCGAGAGAGGCCACCAGAGTTCTTGGATAAGGTCAGAGG
TCTCACTAAATGGGTACCTCCACCAGTCAAGATGACAAGTAGCATCGTTAGAGAGAGCAT
CGATGTATCAAGGAGGCGGATGGATGTACCTTGCTTGGACATGCTTCAGTTTCATTGGTG
GGATTATTCTAATCCTGGTTACCTTGATGCACTAAATCACCTTACAGATCTGAAAGAAGA
AGGTAAAATTAAGACTGTTGCTTTGACAAATTTTGACACGGAAAGACTGCGAATAATACT
GGAGAATGGTATCCCTGTTGTTAGCAATCAGGTGCAACATTCAGTTGTTGACATGCGTCC
CCAGCAGAAAATGGCAGAGCTTTGTCAGCTCACAGGAGTCAAACTAATAACGTATGGCAC
AGTAATGGGTGGTTTGTTATCTGAAAAGTTCCTTGACACCAACTTGTCGATTCCTTTTGC
TGGCCCCCCATTGAACACTCCGTCCCTTCAGAAGTACAAAAGGATGGTTGATGCCTGGGG
AGGGTGGAGTCAGTTCCAAGTTTTGCTTCAGACACTGAAAAGAATAGCTTCCAAACATGG
GGTATCAATTCCAGTTGTTGCTGTAAGATACATACTAGACCAGCCAGCAGTTGCAGGATC
AATGATAGGGGTGAGACTCGGTTTAGCAGAACATATACAGGACACCAATGCCATCTTCAT
GCTCTCTCTCGATGAAGATGATGTTAACAGCATACAAGAAGTTACCAAAAAGGGGAAGGA
TTTGCTTGGAGTGATTGGTGATTGTGGAGACGAGTATAGGCGTTGATTTTGACCTCTTTT
TCCAAACTTCCTATGACTTGCCCCGTTACCCGTTACTAATGAAAGCCCTTGGTGCCTTAT
TTTTGGGTACCGGTAGCGAAAAGCACATTGTGCCCGTTAGTATGTTAATTACATCTTAAT
TTTATATTGTAAATATATTTAAGGAAAAATGAAAATTAGCGGGAGACAAAGATGGATTTT
TTTTAAAAAAAAATGGAACTGTTTTGAATGTATTATTGGAAGAATATAATTAATAAAAAA
AATAATAAAGTGATAGTCATGTGGCAGTTACTATTTTTAACTATCACCTCTAGAAAAAAA
GAAAAAAGTGATAGTCAAAAGTGACGGTTGTTATTTAACTATTATTTTATTATTTTTATT
AATTATATTTTTTTAATGA