Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs2g22080.1
CDS Infomation	gene=Cs2g22080
Sequence	ATGAAGACACTCGCAGCTGCCAAATTCAGTCTAAAAAACCCACTTGTTTCCCTCCTTCAA ATCTCGAAAACAACCACACATATCCTCCAAATTCTTGCCCAACTCACCACCAACGACTTG ATCACCGAACCCTTTACGTTAAGCCAGTTACTTATGTCTCTAACGTCACCCAACACACTC AACATGGATCAAGCAGAGCGCTTATTCAACCAAATTTACCAACCTAATACTTACATGCAT AACACTATGATCAGGGGCTATACTCAAAGCTCAAACCCACAAAAGGCTTTGTCTTTTTAC GTCAATATGAAAAGGAAAGGGCTTTTGGTTGATAATTATACGTACCCATTTGTGTTGAAG GCTTGTGGCGTGTTAATGGGGTTGGTGGAGGGGACAGAGATACATGGAGAGGTAGTGAAA ATGGGGTTTTTGTGTGATGTGTTTGTGGTGAATGGTTTGATTGGAATGTATAGCAAATGT GGTCACATGGGTTGTGCTAGATCAGTGTTTGAAGGGTCTGAGATTAAGGATTTGGTGTCT TGGAATTTAGTGTTGCGTGGGTTTGTGGAATGTGGGGAAATGGGGAAAGCGCGGGAGGTG TTCGACGAAATGCCGCAGAAGGACGCAATTTCTTGGTCTATTATGATTGATGGGTATAGG AAGAAAAAGGGAGACATTTCTTCGGCTCGAATTCTTTTTGAACACATGCCCATCAAGGAT TTGATTTCTTGGAACTCCATGATCGATGGGTATGCTAAGATTGGAGATTTGGTAGCTGCT CAACAATTATTTAATGAGATGCCAGAGAGAAATGTGTTTTCATGGAGCATTATGATAGAT GGCTATGCTCAACATGGAAATCCTAAGGAAGCCCTGTATCTTTTCAGGGAGATGCTTTGT CAAGGTGTGAGACCTGATGTGATATCTGTCATGGGTGCAATATCAGCGTGTGCACAGGTG GGTGCACTTGATCTAGGCAAATGGATACATGTGTTCATGAAGAGAAGCAGAATCACAATG GACATGATTGTTCAAACTGCCTTAATAGACATGTATATGAAATGTGGGAGTCTTGATGAG GCCCGGAGGATTTTTTATAGCATGACAAAGAAGAATGTCATTTCTTATAATGTGATGATT GCAGGTCTTGGTATGAATGGTTTCGGGGAGGAAGCTCTGAAATGCTTTGCACAAATGGAG ACGGAGGGAATTCCAAAGGATGATCTGATCTTCCTTGGTGTTTTAATAGCATGTAGCCAT TCAGGTCTTGCAACTGAAGGATATCGCATCTTTCAAAGTATGAAGAGACATTGTGGCATA GAGCCTAAGCTTGAACACTACAGTTGTTTAGTAGATCTCCTTAGCCGGGCAGGTGAACTA GAGCAGGCCCTAAATATCGTAGAGTCTATGCCAATGAAACCTAATTTAGCTCTGTGGGGA ACCCTTTTATTGGCATGTCGAAATCATCAAAATGTGACACTGGCAGAAGTTGTAGTGGAA GGGCTTGTGGAGTTGAAAGCAGATGACTGTGGCTTATATGTACTTCTATCAAATATCTAT GCAGATGCGGGAATGTGGGAGCATGCACTCCGTATACGGAAAATGATGAGGAAAAGAAAG ATAAAGAAGGAAACTGGAAGGAGTGTAATTGAGATAGATGGCAACATCAAAGAGTTTGTT AGTGGAGAAATCTTTGATGTCCAGAGTGAGGAATTAGAATTGGTTATCCAAAGCTTCGTA AAGACAACCATTGAAAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Cs2g22080.1
PEP Infomation
Sequence	MKTLAAAKFSLKNPLVSLLQISKTTTHILQILAQLTTNDLITEPFTLSQLLMSLTSPNTL NMDQAERLFNQIYQPNTYMHNTMIRGYTQSSNPQKALSFYVNMKRKGLLVDNYTYPFVLK ACGVLMGLVEGTEIHGEVVKMGFLCDVFVVNGLIGMYSKCGHMGCARSVFEGSEIKDLVS WNLVLRGFVECGEMGKAREVFDEMPQKDAISWSIMIDGYRKKKGDISSARILFEHMPIKD LISWNSMIDGYAKIGDLVAAQQLFNEMPERNVFSWSIMIDGYAQHGNPKEALYLFREMLC QGVRPDVISVMGAISACAQVGALDLGKWIHVFMKRSRITMDMIVQTALIDMYMKCGSLDE ARRIFYSMTKKNVISYNVMIAGLGMNGFGEEALKCFAQMETEGIPKDDLIFLGVLIACSH SGLATEGYRIFQSMKRHCGIEPKLEHYSCLVDLLSRAGELEQALNIVESMPMKPNLALWG TLLLACRNHQNVTLAEVVVEGLVELKADDCGLYVLLSNIYADAGMWEHALRIRKMMRKRK IKKETGRSVIEIDGNIKEFVSGEIFDVQSEELELVIQSFVKTTIER*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs2g22080.1
Transcript Infomation	gene=Cs2g22080 CDS=1-1761
Sequence	ATGAAGACACTCGCAGCTGCCAAATTCAGTCTAAAAAACCCACTTGTTTCCCTCCTTCAA ATCTCGAAAACAACCACACATATCCTCCAAATTCTTGCCCAACTCACCACCAACGACTTG ATCACCGAACCCTTTACGTTAAGCCAGTTACTTATGTCTCTAACGTCACCCAACACACTC AACATGGATCAAGCAGAGCGCTTATTCAACCAAATTTACCAACCTAATACTTACATGCAT AACACTATGATCAGGGGCTATACTCAAAGCTCAAACCCACAAAAGGCTTTGTCTTTTTAC GTCAATATGAAAAGGAAAGGGCTTTTGGTTGATAATTATACGTACCCATTTGTGTTGAAG GCTTGTGGCGTGTTAATGGGGTTGGTGGAGGGGACAGAGATACATGGAGAGGTAGTGAAA ATGGGGTTTTTGTGTGATGTGTTTGTGGTGAATGGTTTGATTGGAATGTATAGCAAATGT GGTCACATGGGTTGTGCTAGATCAGTGTTTGAAGGGTCTGAGATTAAGGATTTGGTGTCT TGGAATTTAGTGTTGCGTGGGTTTGTGGAATGTGGGGAAATGGGGAAAGCGCGGGAGGTG TTCGACGAAATGCCGCAGAAGGACGCAATTTCTTGGTCTATTATGATTGATGGGTATAGG AAGAAAAAGGGAGACATTTCTTCGGCTCGAATTCTTTTTGAACACATGCCCATCAAGGAT TTGATTTCTTGGAACTCCATGATCGATGGGTATGCTAAGATTGGAGATTTGGTAGCTGCT CAACAATTATTTAATGAGATGCCAGAGAGAAATGTGTTTTCATGGAGCATTATGATAGAT GGCTATGCTCAACATGGAAATCCTAAGGAAGCCCTGTATCTTTTCAGGGAGATGCTTTGT CAAGGTGTGAGACCTGATGTGATATCTGTCATGGGTGCAATATCAGCGTGTGCACAGGTG GGTGCACTTGATCTAGGCAAATGGATACATGTGTTCATGAAGAGAAGCAGAATCACAATG GACATGATTGTTCAAACTGCCTTAATAGACATGTATATGAAATGTGGGAGTCTTGATGAG GCCCGGAGGATTTTTTATAGCATGACAAAGAAGAATGTCATTTCTTATAATGTGATGATT GCAGGTCTTGGTATGAATGGTTTCGGGGAGGAAGCTCTGAAATGCTTTGCACAAATGGAG ACGGAGGGAATTCCAAAGGATGATCTGATCTTCCTTGGTGTTTTAATAGCATGTAGCCAT TCAGGTCTTGCAACTGAAGGATATCGCATCTTTCAAAGTATGAAGAGACATTGTGGCATA GAGCCTAAGCTTGAACACTACAGTTGTTTAGTAGATCTCCTTAGCCGGGCAGGTGAACTA GAGCAGGCCCTAAATATCGTAGAGTCTATGCCAATGAAACCTAATTTAGCTCTGTGGGGA ACCCTTTTATTGGCATGTCGAAATCATCAAAATGTGACACTGGCAGAAGTTGTAGTGGAA GGGCTTGTGGAGTTGAAAGCAGATGACTGTGGCTTATATGTACTTCTATCAAATATCTAT GCAGATGCGGGAATGTGGGAGCATGCACTCCGTATACGGAAAATGATGAGGAAAAGAAAG ATAAAGAAGGAAACTGGAAGGAGTGTAATTGAGATAGATGGCAACATCAAAGAGTTTGTT AGTGGAGAAATCTTTGATGTCCAGAGTGAGGAATTAGAATTGGTTATCCAAAGCTTCGTA AAGACAACCATTGAAAGATGA