Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs2g21570.4
CDS Infomation

gene=Cs2g21570
Sequence

ATGGTGGGATTCTTAATTCCTAAGCCTTGCCATATCACAACAAGAGGAAAAATCTTGTTC
TTTATTGTTTTTTCTATGTGGGTACCCATGGAAGTAATTGGTAGAACTGGAAATGGGAAT
GTATCGTCTTCGTCTTCAAGGCCAAGCTCTGTGAGGATTGGAGCTTTGTTTACTTATGAT
TCAGTCATAGGGAGGGCAGCAGGACCTGCAATTGCAGCTGCAGTTGATGATGTTAATTCT
GATCCCAGTATTCTTCCAGGGACGACATTAAATTTCGTTATTCGTGATACAAATTGCAGT
GGATTTGTTGGGACTATGGAAGCTTTGCAGCTTATGGAAAATGAAGTGGTTGCTGCAATT
GGTCCACAATCCTCTGGAATAGCTCATGTAATCTCCCATGTTGTCAATGAACTCAATGTA
CCACTTCTGTCGTTTGGAGCAACAGACCCCACTCTCACTTCTCTGCAATACCCCTATTTC
CTTCGAACAACACAAAGTGACTATTATCAGATGCATGCAGTTGCTGATTTAGTCGAGTAC
TATGGATGGAGGGAGGTGATTGCCATCTTTGTAGATGATGATTATGGCAGAAATGGGATT
TCTGTATTGGGTGATGCCTTGTCAAAGAAGCGTGCCAAGATTTCTTACAAGGCTCCCTTC
AGTCCTGGAGCCTCCAGAAGTGCAATTAATAGCTTGTTAGTTGGTGCAAACCTGATGGAA
TCACGAGTTTTTGTTGTACATGTTAATCCAGATACTGGTTTGACAATTTTCTCAGTCGCA
AAAAGTCTTGGGATGACAGCCGGTAGCTATGTTTGGATTGCTACAGATTGGCTTCCTTCT
GTTTTAGATTCAACGGAACCAGTTGATATTGACACAATGAACCTCTTACAAGGAGTTGTT
GCTCTCCGCCATCACACCCCAGATACGGATCTTAAAAAGAATTTCATTTCCAGGTGGAAG
AACCTCAAGTACAAAGAGAATAGTCCTTCGGGTTTTAATTCTTACGCGCTGTATGCGTAT
GATTCTGTTTGGTTAGTCGCCCATGCTCTTGATGCCTTGTTAAATGAAGGGGGAAAATTT
ACTTTCTCTAATGACCCAAAGTTACATGACACAAATGGAAGCATGCTGAACTTATCCTCC
CTCCGTGTTTTTGATGGAGGCCAACAGTTTCTCCAGACTTTGTTGAGGATGAATTTCACA
GGTCTAAGTGGTGAGATTAGATTTGATGCTGATAAGAATTTAGTTAATCCAGCTTATGAT
GTCCTTAACATTGGTGGAACTGGGTCACGGAGGATTGGTTATTGGTCAAATTATTCTGGT
CTCTCTGTTGTTGCTCCAGAGATCTTATATACAAAGCCTCCTAATTCTTCCAGTAATCGA
CATCTTTACAGTGTAATATGGCCTGGTGAAATTACGGCAACACCTCGGGGATGGGTGTTC
CCTAACAATGGGATGCCATTAAGAATTGCGGTGCCTAACCGAGTAAGTTATAATGAATTT
GTGGCTAAAGACAAGAGCCCTCCGGGGGTGAAAGGGTACTGTATTGATGTATTTGAAGCA
GCAGTAAACTTGCTTCCTTATCCTGTCCCACACAACTATATAATGTATGGAAATGGGAAG
AGAAACCCGATCTACAATGACATTGTGCAACAGGTTGCCCTGAATAAATTTGATGCAGCT
GTTGGTGACATCACGATTGTTACAAATCGGACAAAGCTTGTGGATTTTACACAGCCTTAC
ATGGAATCTGGTCTTGTTGTTGTTGCTCCAGTTCAAAAGTTAAAGTCTAGTCCTTGGGCT
TTTCTCAAGCCTTTTACTATACCAATGTGGCTCGTCACTGGAGGCTTCTTTCTTTTCGTG
GGAGCCGTTGTTTGGATTCTTGAGCATCGGTTCAATAATGAATTCCGTGGTCCTCCTAGT
CAGCAACTTGTAACTATCTTCTGGTTTAGCTTCTCAACAATGTTTTTCTCACACAGTATG
TTTGCTTGTGCCCAATTTTTTTCTGCTTTCTTTGTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs2g21570.4
PEP Infomation
Sequence

MVGFLIPKPCHITTRGKILFFIVFSMWVPMEVIGRTGNGNVSSSSSRPSSVRIGALFTYD
SVIGRAAGPAIAAAVDDVNSDPSILPGTTLNFVIRDTNCSGFVGTMEALQLMENEVVAAI
GPQSSGIAHVISHVVNELNVPLLSFGATDPTLTSLQYPYFLRTTQSDYYQMHAVADLVEY
YGWREVIAIFVDDDYGRNGISVLGDALSKKRAKISYKAPFSPGASRSAINSLLVGANLME
SRVFVVHVNPDTGLTIFSVAKSLGMTAGSYVWIATDWLPSVLDSTEPVDIDTMNLLQGVV
ALRHHTPDTDLKKNFISRWKNLKYKENSPSGFNSYALYAYDSVWLVAHALDALLNEGGKF
TFSNDPKLHDTNGSMLNLSSLRVFDGGQQFLQTLLRMNFTGLSGEIRFDADKNLVNPAYD
VLNIGGTGSRRIGYWSNYSGLSVVAPEILYTKPPNSSSNRHLYSVIWPGEITATPRGWVF
PNNGMPLRIAVPNRVSYNEFVAKDKSPPGVKGYCIDVFEAAVNLLPYPVPHNYIMYGNGK
RNPIYNDIVQQVALNKFDAAVGDITIVTNRTKLVDFTQPYMESGLVVVAPVQKLKSSPWA
FLKPFTIPMWLVTGGFFLFVGAVVWILEHRFNNEFRGPPSQQLVTIFWFSFSTMFFSHSM
FACAQFFSAFFV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs2g21570.4
Transcript Infomation

gene=Cs2g21570 CDS=256-2274
Sequence

CTACTTAATGCTTCAAGTTCCATTTTTTTTTCTCTTTTCTTTTTTTAGAATTTCACGGTT
TGAGAATCCATGCTTCTTTTAGTAGAATCATACTATATGATTTTCTTGATTCCATGGCTT
CAATATTTATCTGATAACTGGATTGTTGGAATCCATGTTCACTCTGACATTGTTGGCAGG
TGCTGGTTGTTATTTTTGAACAAATGCTAGTTGGAGCAGAAGAATTAATCAGTTAATTTC
AAACTTTTATTAAAAATGGTGGGATTCTTAATTCCTAAGCCTTGCCATATCACAACAAGA
GGAAAAATCTTGTTCTTTATTGTTTTTTCTATGTGGGTACCCATGGAAGTAATTGGTAGA
ACTGGAAATGGGAATGTATCGTCTTCGTCTTCAAGGCCAAGCTCTGTGAGGATTGGAGCT
TTGTTTACTTATGATTCAGTCATAGGGAGGGCAGCAGGACCTGCAATTGCAGCTGCAGTT
GATGATGTTAATTCTGATCCCAGTATTCTTCCAGGGACGACATTAAATTTCGTTATTCGT
GATACAAATTGCAGTGGATTTGTTGGGACTATGGAAGCTTTGCAGCTTATGGAAAATGAA
GTGGTTGCTGCAATTGGTCCACAATCCTCTGGAATAGCTCATGTAATCTCCCATGTTGTC
AATGAACTCAATGTACCACTTCTGTCGTTTGGAGCAACAGACCCCACTCTCACTTCTCTG
CAATACCCCTATTTCCTTCGAACAACACAAAGTGACTATTATCAGATGCATGCAGTTGCT
GATTTAGTCGAGTACTATGGATGGAGGGAGGTGATTGCCATCTTTGTAGATGATGATTAT
GGCAGAAATGGGATTTCTGTATTGGGTGATGCCTTGTCAAAGAAGCGTGCCAAGATTTCT
TACAAGGCTCCCTTCAGTCCTGGAGCCTCCAGAAGTGCAATTAATAGCTTGTTAGTTGGT
GCAAACCTGATGGAATCACGAGTTTTTGTTGTACATGTTAATCCAGATACTGGTTTGACA
ATTTTCTCAGTCGCAAAAAGTCTTGGGATGACAGCCGGTAGCTATGTTTGGATTGCTACA
GATTGGCTTCCTTCTGTTTTAGATTCAACGGAACCAGTTGATATTGACACAATGAACCTC
TTACAAGGAGTTGTTGCTCTCCGCCATCACACCCCAGATACGGATCTTAAAAAGAATTTC
ATTTCCAGGTGGAAGAACCTCAAGTACAAAGAGAATAGTCCTTCGGGTTTTAATTCTTAC
GCGCTGTATGCGTATGATTCTGTTTGGTTAGTCGCCCATGCTCTTGATGCCTTGTTAAAT
GAAGGGGGAAAATTTACTTTCTCTAATGACCCAAAGTTACATGACACAAATGGAAGCATG
CTGAACTTATCCTCCCTCCGTGTTTTTGATGGAGGCCAACAGTTTCTCCAGACTTTGTTG
AGGATGAATTTCACAGGTCTAAGTGGTGAGATTAGATTTGATGCTGATAAGAATTTAGTT
AATCCAGCTTATGATGTCCTTAACATTGGTGGAACTGGGTCACGGAGGATTGGTTATTGG
TCAAATTATTCTGGTCTCTCTGTTGTTGCTCCAGAGATCTTATATACAAAGCCTCCTAAT
TCTTCCAGTAATCGACATCTTTACAGTGTAATATGGCCTGGTGAAATTACGGCAACACCT
CGGGGATGGGTGTTCCCTAACAATGGGATGCCATTAAGAATTGCGGTGCCTAACCGAGTA
AGTTATAATGAATTTGTGGCTAAAGACAAGAGCCCTCCGGGGGTGAAAGGGTACTGTATT
GATGTATTTGAAGCAGCAGTAAACTTGCTTCCTTATCCTGTCCCACACAACTATATAATG
TATGGAAATGGGAAGAGAAACCCGATCTACAATGACATTGTGCAACAGGTTGCCCTGAAT
AAATTTGATGCAGCTGTTGGTGACATCACGATTGTTACAAATCGGACAAAGCTTGTGGAT
TTTACACAGCCTTACATGGAATCTGGTCTTGTTGTTGTTGCTCCAGTTCAAAAGTTAAAG
TCTAGTCCTTGGGCTTTTCTCAAGCCTTTTACTATACCAATGTGGCTCGTCACTGGAGGC
TTCTTTCTTTTCGTGGGAGCCGTTGTTTGGATTCTTGAGCATCGGTTCAATAATGAATTC
CGTGGTCCTCCTAGTCAGCAACTTGTAACTATCTTCTGGTTTAGCTTCTCAACAATGTTT
TTCTCACACAGTATGTTTGCTTGTGCCCAATTTTTTTCTGCTTTCTTTGTCTAAACATGA
GTTCTTTCATCTAATACTGATATCTGATATTTCTCTAGTTTTAAAACGCTGCTTGGACTT
GATGCAGGGGAGAACACTGTGAGTTCCTTGGGAAGGGTGGTACTGATTGTATGGCTGTTT
GTAGTGTTGATTATCAATTCAAGCTATACAGCTAGTTTGACTTCAATCCTCACAGTACAA
CAACTGACATCACAAATTGAAGGGATTGACAGCTTGATTTCCAGTACTGAGCCAATAGGA
GTTCAAGATGGGTCATTTGCATGGAACTATCTAGTAGATGAGCTCAAAATAGCAGAATCT
AGGCTGGTAAAGTTAAAAAACATGGAAGAATATTCCATTGCACTTGCTCGAGGACCCAAA
GGCGGTGGGGTTGCTGCAATTGTTGATGAGCTTCCTTACATTGAGCTCTTCATGTCCAAA
ACTAATTGTGAATTCAGGACAGTGGGGCAGGAGTTTACAAAAAGCGGATGGGGATTTGCA
TTCCAAAGAGACTCTCCTCTGGCAATTGACTTGTCAACTGCCATTCTTCAACTCTCAGAA
AATGGTGACCTGCAAAAAATCCATAATAAATGGTTAACATATAATGAATGCTCCATGGAC
CTCAGCCCAGCTGACGGAGGTGGCAGCCGACTCTCTCTAAAAAGCTTCTGGGGACTGTTC
CTCATTTGTGGCATTGCATGCTTCCTCGCTCTTATTTTCTTCTTCTGTAGGGTCTGTGGT
CAGTTTCGCAGGTTTGGCTCAGAGGACGAGGAGAGCATCGAGACCGAGGACATTGCACAT
GATACGTCTACATCTGGTAGACGTACACTCCGCTCAACTAGCTTCAAGGACTTAATTGAT
TTCATAGATAGAAAAGAGGCCGAAATTAAGGAAATTCTTAAACGGAGGAATAGTGATAAC
AAACGGCCTAGCCAGAGCTCTGATGGGTAGACGAATTCTCCTGCTTAGGTTTTACCCTGC
TCCTCTTTGTTGTTTAGCGTCATGATCAAAATACGAATTCATCTACACTAATATATCTGC
TTCTTTCTTCAAAGCCAAGATTTAGGTTAGTTTGTAGAAGAACATTAGAAAATCTTGTGT
AATCACCAACCATTTTGTATTACAAAATGATGCTTTGTACTCCTCATGTGGTTATTGAAG
GAATGAATATGTAGATAGTTTTTCATACTTATCACGGCATAAAAGCACTTCTTTACTGAA
ATGCTTGAAATATTTTTGGCTTTGTTTCAACCTATGTGAGAGGCATACGACCATGAGAAA
AATTGTCTCTCAAATGCCTGAAATGAAA