Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs2g05060.1
CDS Infomation

gene=Cs2g05060
Sequence

ATGCCAAATTTATCCAGAATCAGATCGTCCGTTTTCTCATCAACTCACAACCGTCATTAC
ACGCTGGTCCCACCAAATCAGACTTTCCCTCCCAAACTACAAAACTATGACAGTCTCTCG
AACCCGTTAACTGCCACCTCACTTCCTTCAGCTCTTCAACACTATATCAATTCGGATACA
CCATTTTATGGCCTAAAGATTCATGCTCATATAACTAAAACTGGGGTAAAGCCCAACACC
AATATCTCCATCAAACTCTTGATATTGCATCTGAAGTGTGGCGCCTTAAAATATGCGGGC
CAAATGTTTGACGAATTGCCTCAACGAACTCTATCGGCATATAATTACATGATAGCTGGG
TATCTAAAAAATGGGCAGGTTGAAGAATCGCTCAGTTTGGTGAGGAAATTAGTTTCTTCC
GGCGAAAGGCCCGATGGGTATACGTTTTCAATGATTCTAAAGGCGTCTACTTGTTGTCGC
AGTAATGTTCCCTTGCCGCGGAATTTAGGGAGAATGGTACATGCCCAGATACTGAAATGT
GATGTCAAGGCTGATGACGTGCTCTATACAGCGCTTGTCGACTCGTATGTGAAGGGTGGG
AAGACTAGCTATGCGAGGATTGTGTTTGATATGATGTTGGAGAAAAATGTGATATGTTCT
ACATCCATGATTTCAGGGTTTATGAGTCAGGGTTTTGTGGAAGATGCTGAAGAAATTTTT
AGGAAGACAGTCGAAAAAGATATTGTCGTCTACAATGCAATGATTGAAGGTTATAGTATC
TCAATTGAGACTGCTAGGAAGGCTCTTGAGGTTTACATTGATTTGCAAAGGCTTAGTTTT
CGGCCTAACATATCAACTTTTGCTAGTGTAATTGGAGCTTGCTCTGTGTTTACTGATTTT
GAATTTGGTCAACAGGTTCATTGCCAACTTATTAAGAATGTGTTCTTTGAGGATGTAAAA
CTGGGAAGTGCTCTTGTGGACATGTATGCAAAATGTGGAAAGATTGATGATGCACGAAGA
GTTTTTGACCACATGCAACAAAAGAACGTGTTTACATGGACTTCCATGATTGATGGTTAT
GGAAAGAATGGGAATCCGAATCAAGCACTTGAGCTCTTTTGTATGATGCAAGAATGTTGC
GTCCAACCCAATTATGTTACATTCCTTGGTGCTCTCTCGGCTTGTGGACACGCCGGTTTA
GTTGATAAAGGCCGTGAAATATTTGAGAGCATGGAGAGAGATTACTCAATGAAACCGAAG
ATGGAACATTATGCTTGTATGGTCGATTTATTGGGACGTGCCGGGAGTCTCGAACAAGCG
TTAAAGTTTGTGTTGGAAATGCCTGAGAAACCTAATTCTGATGTTTGGGCAGCTCTACTT
AGTTCATGTAGGCTGCATGATGATGTTGAGATGGCAAATATAGCGGCTAATGAAATTTTT
AAGTTAAATGCTAATGATCGGCCAGGGGCGTACGTTGCACTATCCAATACTTTGGCGGCT
GCTGGGAAATGGGATAGTGTGACTGAACTTAGGGAGAAGATGAAGTTAAGAGGGGTACTC
AAAGATACTGGCTGCAGCTGGGTTGGTACCGAGAGTGGTTTATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs2g05060.1
PEP Infomation
Sequence

MPNLSRIRSSVFSSTHNRHYTLVPPNQTFPPKLQNYDSLSNPLTATSLPSALQHYINSDT
PFYGLKIHAHITKTGVKPNTNISIKLLILHLKCGALKYAGQMFDELPQRTLSAYNYMIAG
YLKNGQVEESLSLVRKLVSSGERPDGYTFSMILKASTCCRSNVPLPRNLGRMVHAQILKC
DVKADDVLYTALVDSYVKGGKTSYARIVFDMMLEKNVICSTSMISGFMSQGFVEDAEEIF
RKTVEKDIVVYNAMIEGYSISIETARKALEVYIDLQRLSFRPNISTFASVIGACSVFTDF
EFGQQVHCQLIKNVFFEDVKLGSALVDMYAKCGKIDDARRVFDHMQQKNVFTWTSMIDGY
GKNGNPNQALELFCMMQECCVQPNYVTFLGALSACGHAGLVDKGREIFESMERDYSMKPK
MEHYACMVDLLGRAGSLEQALKFVLEMPEKPNSDVWAALLSSCRLHDDVEMANIAANEIF
KLNANDRPGAYVALSNTLAAAGKWDSVTELREKMKLRGVLKDTGCSWVGTESGL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs2g05060.1
Transcript Infomation

gene=Cs2g05060 CDS=8-1612
Sequence

ATGAAACATGCCAAATTTATCCAGAATCAGATCGTCCGTTTTCTCATCAACTCACAACCG
TCATTACACGCTGGTCCCACCAAATCAGACTTTCCCTCCCAAACTACAAAACTATGACAG
TCTCTCGAACCCGTTAACTGCCACCTCACTTCCTTCAGCTCTTCAACACTATATCAATTC
GGATACACCATTTTATGGCCTAAAGATTCATGCTCATATAACTAAAACTGGGGTAAAGCC
CAACACCAATATCTCCATCAAACTCTTGATATTGCATCTGAAGTGTGGCGCCTTAAAATA
TGCGGGCCAAATGTTTGACGAATTGCCTCAACGAACTCTATCGGCATATAATTACATGAT
AGCTGGGTATCTAAAAAATGGGCAGGTTGAAGAATCGCTCAGTTTGGTGAGGAAATTAGT
TTCTTCCGGCGAAAGGCCCGATGGGTATACGTTTTCAATGATTCTAAAGGCGTCTACTTG
TTGTCGCAGTAATGTTCCCTTGCCGCGGAATTTAGGGAGAATGGTACATGCCCAGATACT
GAAATGTGATGTCAAGGCTGATGACGTGCTCTATACAGCGCTTGTCGACTCGTATGTGAA
GGGTGGGAAGACTAGCTATGCGAGGATTGTGTTTGATATGATGTTGGAGAAAAATGTGAT
ATGTTCTACATCCATGATTTCAGGGTTTATGAGTCAGGGTTTTGTGGAAGATGCTGAAGA
AATTTTTAGGAAGACAGTCGAAAAAGATATTGTCGTCTACAATGCAATGATTGAAGGTTA
TAGTATCTCAATTGAGACTGCTAGGAAGGCTCTTGAGGTTTACATTGATTTGCAAAGGCT
TAGTTTTCGGCCTAACATATCAACTTTTGCTAGTGTAATTGGAGCTTGCTCTGTGTTTAC
TGATTTTGAATTTGGTCAACAGGTTCATTGCCAACTTATTAAGAATGTGTTCTTTGAGGA
TGTAAAACTGGGAAGTGCTCTTGTGGACATGTATGCAAAATGTGGAAAGATTGATGATGC
ACGAAGAGTTTTTGACCACATGCAACAAAAGAACGTGTTTACATGGACTTCCATGATTGA
TGGTTATGGAAAGAATGGGAATCCGAATCAAGCACTTGAGCTCTTTTGTATGATGCAAGA
ATGTTGCGTCCAACCCAATTATGTTACATTCCTTGGTGCTCTCTCGGCTTGTGGACACGC
CGGTTTAGTTGATAAAGGCCGTGAAATATTTGAGAGCATGGAGAGAGATTACTCAATGAA
ACCGAAGATGGAACATTATGCTTGTATGGTCGATTTATTGGGACGTGCCGGGAGTCTCGA
ACAAGCGTTAAAGTTTGTGTTGGAAATGCCTGAGAAACCTAATTCTGATGTTTGGGCAGC
TCTACTTAGTTCATGTAGGCTGCATGATGATGTTGAGATGGCAAATATAGCGGCTAATGA
AATTTTTAAGTTAAATGCTAATGATCGGCCAGGGGCGTACGTTGCACTATCCAATACTTT
GGCGGCTGCTGGGAAATGGGATAGTGTGACTGAACTTAGGGAGAAGATGAAGTTAAGAGG
GGTACTCAAAGATACTGGCTGCAGCTGGGTTGGTACCGAGAGTGGTTTATGAAGTTTCAT
GTTGGAAAATACCTTTGTAAATCAATGTTTAGGTAAAAATACCTTTATAAAAACCACTCA
TCCTGATTTCCCCATCACTCTTTGGAGAGTTCATCTGTTTCAGATGAGGACTTGAATGCA
TCAGTCTCGCTGAGCTTCGTGATGAAATTTGTTGGAATTATCAGGATGAGTGGTTTTTAT
AATTTTTAGTGGGCAAGATGCTCACTAGATTGTTGATTAATTGGCGGAGCTTAAGCTGTT
GTCATAGATGAAAGCCACACGGGATAATTTGCAATTCTTGTTAATCCTATGCTCTGAGGA
AAGTTGTACTTTGATTTTCACAAATGCTTTTATAGTGATTTCCTTTACTTTACG