Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs1g25390.1
CDS Infomation

gene=Cs1g25390
Sequence

ATGGTGTTATTGGGCAATGATGATTCACCTGAAGACATAACGATTGAAATTCTATCAAGG
CTACCTGTGAAATCTCTTATACGATTAAGGTGCGTTTGCAAATCTTGGTATGCTTTAATA
AAAGACCCTAATTTTATTTCCATGCATCTTAAAAATGATGTCAATACCCGTCTAATTGTT
CTATATGCGAAAGAGGATGACACAGAAGAGCATAGCCATCCGAAAGAGTATTTTTGTTTA
TTCCCGGATGAGACACTTGAAGATTTATCATTACAAGATCTTTCAACTCAAGAACCCGTA
CTTGGATCGTTTAAGGGTCTTTATTGTGGTATTGTTTTTATAGAAGGGTTAAACAATCGC
ATAACTCTATGGAATATTGCAACTCGAGAGTCCATTACTCTTCCGAAATATAGGGCTATC
ATTCCACAATATACGAGGGTTTTTGGTACTAAAATTGGATTCGGATTGGATCCAAAAACT
AAGGACTACAAAGTGGTTTTAATATTAACCTTGTGGGACGAAAAAAGAGATTCCTCATGT
GCATTCTCCCTTGTTGCCGTGTATACCCTACGTACTAATTCCTGGAAAAATTTGAAGCCA
ATTGATTACACTATGCGATTATCATCTGAGCGCACATACTTCGATGGAGCTTTTTACTGG
TTGTTGAAATTGGAAAATGATAACGACAGTTATGTAATCCTTTCATTTAACATGGCCGAC
GAGAAGTTCCAGGAGATACAGGGGCCTTGCATACTTGAATCATCATTAGATGTGACTCTT
GGGATATACTATCAGTCTCTATCTCTACTAATTTTAGATAATGTAGACCACTGTTTTAAA
ATATGGGTGATGAGAAAGAAGAATTGGATTAAACAATTAACTGTTGGACCTTTTATAGGA
ATTTTCCAACCACTCCTGTTTTGGAAGAAAGGCGCATTCTTTGTTGAATCTAACTCTTCA
CAGTTGCTCCTGTATGAACCTGGTACCGGGGAATTAAGGGATTTTGAACTCGAATGCTGT
TGGTTTTCAGTTTATATTTATACTGAGAGTTTAATTCCATTAAAAGGAGGGGATGGTGTA
TTCGACTTTGACATTCCATGGCATGTTTTGGGTGTACATCAAACAGAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs1g25390.1
PEP Infomation
Sequence

MVLLGNDDSPEDITIEILSRLPVKSLIRLRCVCKSWYALIKDPNFISMHLKNDVNTRLIV
LYAKEDDTEEHSHPKEYFCLFPDETLEDLSLQDLSTQEPVLGSFKGLYCGIVFIEGLNNR
ITLWNIATRESITLPKYRAIIPQYTRVFGTKIGFGLDPKTKDYKVVLILTLWDEKRDSSC
AFSLVAVYTLRTNSWKNLKPIDYTMRLSSERTYFDGAFYWLLKLENDNDSYVILSFNMAD
EKFQEIQGPCILESSLDVTLGIYYQSLSLLILDNVDHCFKIWVMRKKNWIKQLTVGPFIG
IFQPLLFWKKGAFFVESNSSQLLLYEPGTGELRDFELECCWFSVYIYTESLIPLKGGDGV
FDFDIPWHVLGVHQTE*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs1g25390.1
Transcript Infomation

gene=Cs1g25390 CDS=1-1131
Sequence

ATGGTGTTATTGGGCAATGATGATTCACCTGAAGACATAACGATTGAAATTCTATCAAGG
CTACCTGTGAAATCTCTTATACGATTAAGGTGCGTTTGCAAATCTTGGTATGCTTTAATA
AAAGACCCTAATTTTATTTCCATGCATCTTAAAAATGATGTCAATACCCGTCTAATTGTT
CTATATGCGAAAGAGGATGACACAGAAGAGCATAGCCATCCGAAAGAGTATTTTTGTTTA
TTCCCGGATGAGACACTTGAAGATTTATCATTACAAGATCTTTCAACTCAAGAACCCGTA
CTTGGATCGTTTAAGGGTCTTTATTGTGGTATTGTTTTTATAGAAGGGTTAAACAATCGC
ATAACTCTATGGAATATTGCAACTCGAGAGTCCATTACTCTTCCGAAATATAGGGCTATC
ATTCCACAATATACGAGGGTTTTTGGTACTAAAATTGGATTCGGATTGGATCCAAAAACT
AAGGACTACAAAGTGGTTTTAATATTAACCTTGTGGGACGAAAAAAGAGATTCCTCATGT
GCATTCTCCCTTGTTGCCGTGTATACCCTACGTACTAATTCCTGGAAAAATTTGAAGCCA
ATTGATTACACTATGCGATTATCATCTGAGCGCACATACTTCGATGGAGCTTTTTACTGG
TTGTTGAAATTGGAAAATGATAACGACAGTTATGTAATCCTTTCATTTAACATGGCCGAC
GAGAAGTTCCAGGAGATACAGGGGCCTTGCATACTTGAATCATCATTAGATGTGACTCTT
GGGATATACTATCAGTCTCTATCTCTACTAATTTTAGATAATGTAGACCACTGTTTTAAA
ATATGGGTGATGAGAAAGAAGAATTGGATTAAACAATTAACTGTTGGACCTTTTATAGGA
ATTTTCCAACCACTCCTGTTTTGGAAGAAAGGCGCATTCTTTGTTGAATCTAACTCTTCA
CAGTTGCTCCTGTATGAACCTGGTACCGGGGAATTAAGGGATTTTGAACTCGAATGCTGT
TGGTTTTCAGTTTATATTTATACTGAGAGTTTAATTCCATTAAAAGGAGGGGATGGTGTA
TTCGACTTTGACATTCCATGGCATGTTTTGGGTGTACATCAAACAGAGTGA