Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs1g18550.3
CDS Infomation	gene=Cs1g18550
Sequence	ATGTTCCTTCACATTCCTGCTATAGCTTCAGTTGATATTATTTCAGCAATTGAATTTGAT AAAACCGGAGACCATCTTGCTACTGGTGACCGCGGGGGCCGGGTAGTTCTCTTTGAGCGG ACAGATACGAAGGATCATGGAGGATCCAGAAGGGATCTGGAGAGGATGGACTATTCAACA AGTAGGCATCCTGAGTTTCGTTATAAGACAGAGTTTCAGAGCCATGAACCTGAGTTTGAC TATCTCAAGAGTTTGGAAATAGAAGAGAAAATAAACAAAATCAGATGGTGCCAAACAGCC AACGGTGCACTATTTCTCCTCTCTACTAATGATAAAACAATTAAGTTTTGGAAGGTGCAA GAAAAGAAGGTGAAGAAAATTGCTGACATGAATGTGGACCCTTCAAAAGCAGTAGGAAAT GGCAATGTTGCTAGTTCAAGTAATAATGTTAGCCCTAAACCATATCTTGCAAATGGTGGA TCACCTAGCAAGGAGTTCTCATTCCCACCAGGGGGCATTCCATCGCTTCGTTTACCTACG GTAGTAACGTCCAACGAGACTAGCCTAGTGGCTAGATGTCGAAGGGTATATGCTCATGCA CACGATTATCATATCAATTCTATTTCTAACAATAGTGACGGTGAAACATTTATATCGGCT GACGATCTGCGAATTAATCTTTGGAACTTGGAAATTAGCAATCAAAGTTTTAACATTGTT GATGTGAAGCCTGCAAACATGGAGGATCTAACTGAGGTGATAACTTCGGCAGAATTTCAC CCTACTCACTGTAATATGTTAGCATATAGCAGCTCAAAGGGCTCAATACGCCTTATTGAC TTGAGGCAATCAGCTTTGTGTGATTCTCATGCTATATTGTTTGAGGAACAGGAGGCCCCT GGTTCTAGATCATTCTTCACAGAAATAATTGCATCTATTTCAGATATTAAGTTTGCAAAG GATGGAAGACATATACTTAGTCGTGATTACATGACTCTTAAGTTGTGGGATATTAACATG GATTCAGGCCCCGTTGCAACCTTCCAGGTTCATGAATACTTGAGACCTAAGCTGTGTGAT TTATATGAAAATGATTCAATCTTTGATAAATTTGAGTGTTGCTTAAGTGGTGACGGATTG CGGGTGGCTACAGGTTCTTACAGCAATCTATTCCGTGTGTTCGGCTGTGCCCCAGGAAGC ACTGAGGCCACAACTTTGGAAGCCAGCAAAAACCCAATGAGGAGACAAGTTCAAACCCCT TCAAGGCCTTCCAGATCCCTTAGCAGCATAACACGTGTTGTCAGACGAGGATCGGATGTG CCTGGAGTTGATACAAATGGAAATTCTTTTGATTTCACGACAAAGTTGCTGCACCTAGCA TGGCACCCAACCGAGAACTCAATTGCTTGTGCTGCTGCAAACAGCTTGTACATGTATTAT GCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Cs1g18550.3
PEP Infomation
Sequence	MFLHIPAIASVDIISAIEFDKTGDHLATGDRGGRVVLFERTDTKDHGGSRRDLERMDYST SRHPEFRYKTEFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWCQTANGALFLLSTNDKTIKFWKVQ EKKVKKIADMNVDPSKAVGNGNVASSSNNVSPKPYLANGGSPSKEFSFPPGGIPSLRLPT VVTSNETSLVARCRRVYAHAHDYHINSISNNSDGETFISADDLRINLWNLEISNQSFNIV DVKPANMEDLTEVITSAEFHPTHCNMLAYSSSKGSIRLIDLRQSALCDSHAILFEEQEAP GSRSFFTEIIASISDIKFAKDGRHILSRDYMTLKLWDINMDSGPVATFQVHEYLRPKLCD LYENDSIFDKFECCLSGDGLRVATGSYSNLFRVFGCAPGSTEATTLEASKNPMRRQVQTP SRPSRSLSSITRVVRRGSDVPGVDTNGNSFDFTTKLLHLAWHPTENSIACAAANSLYMYY A*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs1g18550.3
Transcript Infomation	gene=Cs1g18550 CDS=71-1516
Sequence	CTGCATTATCAAGGACTCTGGCGGTTAGATGTCAAGTTAAGTGTATTGGGAGAGCCAATC TCAGTTGGAAATGTTCCTTCACATTCCTGCTATAGCTTCAGTTGATATTATTTCAGCAAT TGAATTTGATAAAACCGGAGACCATCTTGCTACTGGTGACCGCGGGGGCCGGGTAGTTCT CTTTGAGCGGACAGATACGAAGGATCATGGAGGATCCAGAAGGGATCTGGAGAGGATGGA CTATTCAACAAGTAGGCATCCTGAGTTTCGTTATAAGACAGAGTTTCAGAGCCATGAACC TGAGTTTGACTATCTCAAGAGTTTGGAAATAGAAGAGAAAATAAACAAAATCAGATGGTG CCAAACAGCCAACGGTGCACTATTTCTCCTCTCTACTAATGATAAAACAATTAAGTTTTG GAAGGTGCAAGAAAAGAAGGTGAAGAAAATTGCTGACATGAATGTGGACCCTTCAAAAGC AGTAGGAAATGGCAATGTTGCTAGTTCAAGTAATAATGTTAGCCCTAAACCATATCTTGC AAATGGTGGATCACCTAGCAAGGAGTTCTCATTCCCACCAGGGGGCATTCCATCGCTTCG TTTACCTACGGTAGTAACGTCCAACGAGACTAGCCTAGTGGCTAGATGTCGAAGGGTATA TGCTCATGCACACGATTATCATATCAATTCTATTTCTAACAATAGTGACGGTGAAACATT TATATCGGCTGACGATCTGCGAATTAATCTTTGGAACTTGGAAATTAGCAATCAAAGTTT TAACATTGTTGATGTGAAGCCTGCAAACATGGAGGATCTAACTGAGGTGATAACTTCGGC AGAATTTCACCCTACTCACTGTAATATGTTAGCATATAGCAGCTCAAAGGGCTCAATACG CCTTATTGACTTGAGGCAATCAGCTTTGTGTGATTCTCATGCTATATTGTTTGAGGAACA GGAGGCCCCTGGTTCTAGATCATTCTTCACAGAAATAATTGCATCTATTTCAGATATTAA GTTTGCAAAGGATGGAAGACATATACTTAGTCGTGATTACATGACTCTTAAGTTGTGGGA TATTAACATGGATTCAGGCCCCGTTGCAACCTTCCAGGTTCATGAATACTTGAGACCTAA GCTGTGTGATTTATATGAAAATGATTCAATCTTTGATAAATTTGAGTGTTGCTTAAGTGG TGACGGATTGCGGGTGGCTACAGGTTCTTACAGCAATCTATTCCGTGTGTTCGGCTGTGC CCCAGGAAGCACTGAGGCCACAACTTTGGAAGCCAGCAAAAACCCAATGAGGAGACAAGT TCAAACCCCTTCAAGGCCTTCCAGATCCCTTAGCAGCATAACACGTGTTGTCAGACGAGG ATCGGATGTGCCTGGAGTTGATACAAATGGAAATTCTTTTGATTTCACGACAAAGTTGCT GCACCTAGCATGGCACCCAACCGAGAACTCAATTGCTTGTGCTGCTGCAAACAGCTTGTA CATGTATTATGCATAGAGATGGTGCAAGAAGATTGTATTTGCTTTGTTACTTTCTGTAGG TTGCTGACAGAAAAGGCTTCTTCCCCTTTCTCACCAACCTGTGAATTGGAGCTACGTCAA TTTCACACTACCAAGTGCCCTATCAATCCTTTGCACATGATATATGGTATGGAGGTCACG AAATGGCTGTAGAATCCATGAGGAAGCTACCTGATTTTGTTCCCGGGTGGGCAGCTTGAT TCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTCCCCCTTTTCCCCTTCTCTTCCCATGCCCCCAA AAATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTCTGTTTTGCGTATCTTCTGGTAAAAATAGA AGATGCGGTTGTGTTTTAAAATTGTGTCGGGTCAAAGTCAAGAAGGAAATATGATTGTAG CTCTCCTACAACAAGAAAAAACTAAAGGATGTTCAATATTTGCCGCTAGGTTTAAGGTAA ATGTAGTTTTTGTTTTTTGCCCCCACTCTCTTTTACTCCAATCTTAGTGGGAAGGAGCTG TTGAGACTTGCACTGCATCATTTTTTCATTGATTCTTTAGTCGATGTTTGGAACATCACC CCTCTAGTTCTAAAGATAAATGTAGCTCTTTTTATTGATTCTTTGTCACTAGGTTCGCCA AGTGACTGCTTCTGTCTGACTCCAAATTGCCTAGCTACAAGTTTTGGTGGGACGGCCGGT GTTTGCCGTTAGGATTAAGATAACTGGTTCCCTGTTTGCTTTTCTTGTTTCTTCCTTTTT CTCTTTTGGCGGTTAACAGTTGCCCCAAAAAAAAAAAAATTGTCTGTAGAATGGCTTGTA CTCTTGTAATGTTGTTCTTTAATCTTTGTTTTTCCAAGATTAACCTTACTTTTTTTTTTT TTTGACCTTTTTCAGCCCCGTGCTTATGCTTGCCTTTCTTCTGCTTATAGTAAGGAAATG AAATGATGTTGACATCTTTATTTTGCTTGCTTGGAAACCACGGCTGTTTTCAGCCTGGAG GTTTCTTCTTTTTATGCTTGCTTTG