Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs1g17970.1
CDS Infomation

gene=Cs1g17970
Sequence

ATGGCTGGTTTGGCACCCGAAGGATCTCAATTTGATGCTCGTCAGTATGACACCAAGATG
AATGAACTGCTCTCTACTGATGGGCAAGATTTCTTCACTTCTTATGATGAAGTTTATGAC
AGTTTTGATGCAATGGGACTGCAGGAAAACCTTTTGAGGGGAATCTATGCTTATGGGTTT
GAGAAGCCTTCTGCTATTCAGCAAAGGGGAATTGTTCCCTTCTGCAAGGGACTTGACGTC
ATTCAGCAGGCTCAGTCTGGAACTGGGAAAACAGCAACTTTCTGCTCTGGAATTTTGCAG
CAACTTGATTATGGTCTTGTCCAATGTCAGGCCCTGGTGTTGGCACCCACTAGGGAACTA
GCTCAACAAATTGAGAAAGTAATGAGGGCACTTGGTGATTATCTTGGTGTTAAGGTTCAT
GCTTGTGTCGGTGGGACAAGTGTTCGCGAGGATCAGCGCATTCTTCAAGCTGGTGTTCAT
GTTGTTGTTGGCACTCCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGCCGACAGTCTTTACGCCCT
GATTACATTAAGATGTTTGTACTGGATGAGGCTGATGAAATGCTTTCCCGTGGTTTTAAG
GATCAGATCTATGATATTTTCCAGCTGCTTCCAGCTAAAGTTCAGGTGGGGGTTTTCTCT
GCTACAATGCCTCCTGAGGCCTTGGAGATTACAAGGAAGTTTATGAACAAGCCTGTGAGA
ATCTTGGTTAAACGTGATGAACTCACCCTTGAGGGTATCAAGCAGTTTTATGTCAATGTT
GAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGAAACACTCTGTGATCTTTATGAGACTCTGGCCATAACC
CAGAGTGTCATCTTTGTGAACACTCGGCGAAAGGTCGACTGGCTTACTGACAAGATGCGA
AGCCGTGACCATACAGTCTCTGCCACTCATGGGGACATGGATCAGAACACCCGAGATATC
ATTATGCGTGAATTTCGCTCTGGTTCTTCTCGTGTTCTCATCACCACTGATCTGTTGGCT
CGTGGTATTGATGTGCAGCAAGTTTCACTTGTCATAAATTATGATCTGTCGACTGGCTTA
CTGACAAGATGCGAAGCCGTGACCATACAGTCTCTGCCACTCATGGGGACATGGATCAGA
ACACCCGAGATATCATTATGCGTGAATTTCGCTCTGGTTCTTCTCGTGTTCTCATCACCA
CTGATCTGTTGGCTCGTGGTATTGATGTGCAGCAAGTTTCACTTGTCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs1g17970.1
PEP Infomation
Sequence

MAGLAPEGSQFDARQYDTKMNELLSTDGQDFFTSYDEVYDSFDAMGLQENLLRGIYAYGF
EKPSAIQQRGIVPFCKGLDVIQQAQSGTGKTATFCSGILQQLDYGLVQCQALVLAPTREL
AQQIEKVMRALGDYLGVKVHACVGGTSVREDQRILQAGVHVVVGTPGRVFDMLRRQSLRP
DYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQLLPAKVQVGVFSATMPPEALEITRKFMNKPVR
ILVKRDELTLEGIKQFYVNVEKEEWKLETLCDLYETLAITQSVIFVNTRRKVDWLTDKMR
SRDHTVSATHGDMDQNTRDIIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLSTGL
LTRCEAVTIQSLPLMGTWIRTPEISLCVNFALVLLVFSSPLICWLVVLMCSKFHLS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs1g17970.1
Transcript Infomation

gene=Cs1g17970 CDS=420-1670
Sequence

CTTTGATGATTCTGTCGATGAGCAATATGCTTTAATGTGTTATGCTTAATACATTTTCTT
TCACTCTCCATATGAAAAAGAGTTTGTACCAAAGAGGGTCTAAATGAAAGCAAATAGAAA
CCACAGGGACACAAACGGAAATTACAACAAAAGCGGAACAGAAAAAAAGGGTTTCGAGTG
GTAACATGAACAGAACTCAACACACGCACACACAAGTGTTGGAGGCCGCGTATAATATAT
AAGTGCACCAAAGACCAAACTTTAGTCCCTTCCCTTTTAACTCCACGGCGCAGATCCGAG
GAGTTTGGTAACCCTAGCAACTATTTTCTCTTAAATCAATCTTCTCCTTCTCTTTGAAAA
AAAAAAGAAAACCAACTCTTTCTCTCCATTTTAATCACCATCATCAAAGCTTTGCAGATA
TGGCTGGTTTGGCACCCGAAGGATCTCAATTTGATGCTCGTCAGTATGACACCAAGATGA
ATGAACTGCTCTCTACTGATGGGCAAGATTTCTTCACTTCTTATGATGAAGTTTATGACA
GTTTTGATGCAATGGGACTGCAGGAAAACCTTTTGAGGGGAATCTATGCTTATGGGTTTG
AGAAGCCTTCTGCTATTCAGCAAAGGGGAATTGTTCCCTTCTGCAAGGGACTTGACGTCA
TTCAGCAGGCTCAGTCTGGAACTGGGAAAACAGCAACTTTCTGCTCTGGAATTTTGCAGC
AACTTGATTATGGTCTTGTCCAATGTCAGGCCCTGGTGTTGGCACCCACTAGGGAACTAG
CTCAACAAATTGAGAAAGTAATGAGGGCACTTGGTGATTATCTTGGTGTTAAGGTTCATG
CTTGTGTCGGTGGGACAAGTGTTCGCGAGGATCAGCGCATTCTTCAAGCTGGTGTTCATG
TTGTTGTTGGCACTCCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGCCGACAGTCTTTACGCCCTG
ATTACATTAAGATGTTTGTACTGGATGAGGCTGATGAAATGCTTTCCCGTGGTTTTAAGG
ATCAGATCTATGATATTTTCCAGCTGCTTCCAGCTAAAGTTCAGGTGGGGGTTTTCTCTG
CTACAATGCCTCCTGAGGCCTTGGAGATTACAAGGAAGTTTATGAACAAGCCTGTGAGAA
TCTTGGTTAAACGTGATGAACTCACCCTTGAGGGTATCAAGCAGTTTTATGTCAATGTTG
AGAAGGAAGAATGGAAGCTTGAAACACTCTGTGATCTTTATGAGACTCTGGCCATAACCC
AGAGTGTCATCTTTGTGAACACTCGGCGAAAGGTCGACTGGCTTACTGACAAGATGCGAA
GCCGTGACCATACAGTCTCTGCCACTCATGGGGACATGGATCAGAACACCCGAGATATCA
TTATGCGTGAATTTCGCTCTGGTTCTTCTCGTGTTCTCATCACCACTGATCTGTTGGCTC
GTGGTATTGATGTGCAGCAAGTTTCACTTGTCATAAATTATGATCTGTCGACTGGCTTAC
TGACAAGATGCGAAGCCGTGACCATACAGTCTCTGCCACTCATGGGGACATGGATCAGAA
CACCCGAGATATCATTATGCGTGAATTTCGCTCTGGTTCTTCTCGTGTTCTCATCACCAC
TGATCTGTTGGCTCGTGGTATTGATGTGCAGCAAGTTTCACTTGTCATAAATTATGATCT
GCCGACTCAACCAGAAAACTACCTTCACCGTATTGGACGAAGTGGTCGATTTGGAAGAAA
GGGTGTTGCCATTAATTTTGTGACAAGGGATGATGAGAGAATGCTTTTTGATATTCAAAA
GTTCTATAACGTGGTCATTGAGGAGCTGCCTTCAAATGTTGCTGACCTTCTTTGAGGAGG
TTCTGTTTTTTGTAAGTTTGTCGAGGCAAGAAGGGGTTTCCTGATTTTGCAAGTACTATT
TAATGTGGTGGATATTTTCTCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTCTTCTTCCTTTCCG
TCTAGTGTCTTAAATTAATGTTGTTCTCAAACATATCCGACCATTTAATCATATGGGTCA
TGCACATTTGCAAGCTGCACTGTGGTGGGTTTATAATTATTGAAATTTTTGTTGCTGTTA
GGTCTTTGTATTTTATGTCCTTTTGTTATAAATTTTATTTCTATTATAATTGTTTAGCAG
AAGCCGGTTATTAGATTT