Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID

Cs1g11320.1
CDS Infomation

gene=Cs1g11320
Sequence

ATGGGCAACGTTTTGCAAATCACATGCGATGGCGCTATTTTCAATCGTTGCCTGGATTGC
TTTCTTGGCAAAGTAGCATACATAAGAAACCTCGAAGATAATGTCGTTGCCTTGGAGAAG
GACTTAGCATTACTAATCGCTAAAAGGAACGATTTGATGACGAGGGTTGTCGATGCTGAA
CGGCAACAAATGAGAAGGCTGGATCAAGTGCAAGTGTGGCTTTCGAGTGTGGAAGCTGTT
GAAGCTGAAGCTGGTGAATTGATAAGACGTCGCTCTCAAGAAATTGAGAAACTATGTCTT
GGGGGCTACTGTTCCAAGAACTGCAAGTCAAGCTATAAGTTTGGCACACAGGTCGCTAAA
CAGCTAAGAGATGTCAAGAAATTAATGGATGGAGGAGATTTTGAACGGGTAGCTGAGAAG
ATACCACAGCCTGTGGTAGATGAGAGACCTACCGAGCCAACAGTGGTAGGCCAGCAATCA
CAACTTGAACAAGTTTGGAAATGTCTTGTAGAAGGATCAGCGGGAATCATTGGCCTTTAT
GGCATGGGCGGTGTCGGTAAAACTACACTATTGACTCATATCAACAATAAATTTCTTCAG
AGTTCAACCGATTTTGATTTTGTGATATGGGTCGTAGTGTCAAAAGATCTGCAAATTGAA
AAAATCCAAGAATCTATCGGGGAGAAGATAGGTTTGTTGAATGACACATGGAAAAATAGA
AGAATTGAACAGAAAGCTCTAGACATCTTCAGGATTTTGAAGAAGAAGAAGTTTGTTCTG
TTGCTAGATGACATATGGCAGCGAGTTGATTTAGTAAAAGTGGGTGTCCCTCTTCCTAGT
CCACAAAAAAGCAGTGAATCCAAAGTAAAAGTGGGTGACCCTCTTCCTAGTCCAGAAAAA
AGTAGTGAATCCAAAGTGGTATTCACAACCCGTTCCGAAGAAGTTTGTGGTTGGATGGAA
GCTCACCAGAACTTTAAAGTGGCATGCTTATCACACAACGACGCTTGGGAATTGTTTCAA
CAGAAAGTTGGGGAAGAAACATTGAATTGTCATCCTGAAATACTTGAGCTGGCCCGAACA
GTAGCAAAGGAATGTGGGGGTTTGCCACTAGCACTTATTACCATTGGCCGAGCTATGGCT
TGTAAGAAAAGACCTGAAGAATGGAAATATGCAATTGAGGTGTTAAGAACATCAAGTTCT
CAGTTTGCAGGTTTGGGAAACGAGGTTTATCCTCTTTTGAAATTCAGTTATGATAATTTG
CCAAATGACACAATTAAATCTTGTCTCTTATATTGTAGTTTATATCCAGAAGATTGTCTT
ATTTCTAAAGAGAATTTGATAGATTGTTGGATTGGAGAGGGTCTTTTGAATGAAAGTGTC
AAGTTTGGAGTTCAAAAGGAAGGATACCACATCGTGGGCATTCTTGTTCGTGCATGTTTG
TTAGAAGAGGTAGGAGATGATGATGTAAAATTGCACGATGTAATTCGTGATATGGCTTTA
TGGATAGCATGCGACATTGAGAAGGAGAAAGAGAACTATTTGGTTTATGCAGGTGCTGGA
TTAACTGAGGTGCAAGATGTCAGAGAATGGGAAAAGGTAAGGAGATTGTCGTTGATGGAA
AATCAAATTAAAGTTATACTAGGGATGCCTCGATGCCCTCACCTCCTTACTTTATTTCTC
AACAATAATGTTAAGTTGAGGATCTCTGATGGCTTCCTTCAGTATATGTCTTCTCTCAAA
GTTTTAAGCCTGTCACACAATGAGGTACTATTCGAGTTACCTTCAGATATTTCAAGGTTG
GTTTCACTTGAACTACTTGATCTTTCAAACTCACGAATAAGAGAGTTGCCAGAAGAGTTA
GCGGCGTTGGTAAATCTTAAATGTTTGAATTTGGAATATACATTTGATTTAGCTAAGATT
CCTTGGAATCTGATATCTAATTTTTCAAGGTTACATGTGCTGAGAATGTTTGGTAATGCA
ATAAGAAGCGGTTCATTTGATGGGGATGAACTCATGGTAAAGGAATTGCTTGGTTTGAAA
CATTTAGAGGTATTGAGCTTCACCTTGCGAAGTTCTCATGCCCTCAAAAGTTTTTTGACC
TCGCATCAGTTAAGAAGTTGTACACAAGCTCTGCTCCTCCATTGCTTCAAGGATTCATCG
CTTGATGTTTCAGGTTTAGCAGACCTGAAGCAGCTCAACAGACTACGGATTGCAGACTGT
CCTGAATTGGTAGAATTGAAGATTGATTATAAAGGGGAAGCACAACAGTTTTGTTTCCAA
AGCCTTCGCGTGGTTGTAATAGACCTTTGCATAGGATTGAAGGACTTGACATTCCTTGTT
TTTGCTTCGAACCTCAAGTCTATTGAAGTAAGAAGTTGTTTTGCCATGGAAGACATCATA
AGTGTGGGAAAATTTGCTGATTTTCCAGAAGTGATGGCAAATCTAAACCCTTTTGCAAAA
CTCCAATATCTTCAATTAGCTGGTCTGCCAAATCTGAAGAGCATTTACTGGAAGCCCCTG
CCCTTCTCACATTTGAAAGAAATGAGTGTATTTAATTGCGATAAGCTTAAAAAGCTTCCA
CTTGACTCCAATACTGCGAAGGAGTGTAAACTTGTTATTTGTGGAGAACCAGACTGGTGG
AAAGAGCTTCGATGGGAGGACAAACCAACTCAAGATGCTTTTCTTCCCTGTTTCAAATCT
TTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Cs1g11320.1
PEP Infomation
Sequence

MGNVLQITCDGAIFNRCLDCFLGKVAYIRNLEDNVVALEKDLALLIAKRNDLMTRVVDAE
RQQMRRLDQVQVWLSSVEAVEAEAGELIRRRSQEIEKLCLGGYCSKNCKSSYKFGTQVAK
QLRDVKKLMDGGDFERVAEKIPQPVVDERPTEPTVVGQQSQLEQVWKCLVEGSAGIIGLY
GMGGVGKTTLLTHINNKFLQSSTDFDFVIWVVVSKDLQIEKIQESIGEKIGLLNDTWKNR
RIEQKALDIFRILKKKKFVLLLDDIWQRVDLVKVGVPLPSPQKSSESKVKVGDPLPSPEK
SSESKVVFTTRSEEVCGWMEAHQNFKVACLSHNDAWELFQQKVGEETLNCHPEILELART
VAKECGGLPLALITIGRAMACKKRPEEWKYAIEVLRTSSSQFAGLGNEVYPLLKFSYDNL
PNDTIKSCLLYCSLYPEDCLISKENLIDCWIGEGLLNESVKFGVQKEGYHIVGILVRACL
LEEVGDDDVKLHDVIRDMALWIACDIEKEKENYLVYAGAGLTEVQDVREWEKVRRLSLME
NQIKVILGMPRCPHLLTLFLNNNVKLRISDGFLQYMSSLKVLSLSHNEVLFELPSDISRL
VSLELLDLSNSRIRELPEELAALVNLKCLNLEYTFDLAKIPWNLISNFSRLHVLRMFGNA
IRSGSFDGDELMVKELLGLKHLEVLSFTLRSSHALKSFLTSHQLRSCTQALLLHCFKDSS
LDVSGLADLKQLNRLRIADCPELVELKIDYKGEAQQFCFQSLRVVVIDLCIGLKDLTFLV
FASNLKSIEVRSCFAMEDIISVGKFADFPEVMANLNPFAKLQYLQLAGLPNLKSIYWKPL
PFSHLKEMSVFNCDKLKKLPLDSNTAKECKLVICGEPDWWKELRWEDKPTQDAFLPCFKS
F*

Transcript Sequence

Transcript ID

Cs1g11320.1
Transcript Infomation

gene=Cs1g11320 CDS=100-2805
Sequence

TTTTAATTTAAATTTTGATATACACTTCCGCAGCAGATCCTGTTCATCGATATAGTTGAA
AATTTTCTTGATTTATCTTGTTGAATTCTTGTCCTAAGAATGGGCAACGTTTTGCAAATC
ACATGCGATGGCGCTATTTTCAATCGTTGCCTGGATTGCTTTCTTGGCAAAGTAGCATAC
ATAAGAAACCTCGAAGATAATGTCGTTGCCTTGGAGAAGGACTTAGCATTACTAATCGCT
AAAAGGAACGATTTGATGACGAGGGTTGTCGATGCTGAACGGCAACAAATGAGAAGGCTG
GATCAAGTGCAAGTGTGGCTTTCGAGTGTGGAAGCTGTTGAAGCTGAAGCTGGTGAATTG
ATAAGACGTCGCTCTCAAGAAATTGAGAAACTATGTCTTGGGGGCTACTGTTCCAAGAAC
TGCAAGTCAAGCTATAAGTTTGGCACACAGGTCGCTAAACAGCTAAGAGATGTCAAGAAA
TTAATGGATGGAGGAGATTTTGAACGGGTAGCTGAGAAGATACCACAGCCTGTGGTAGAT
GAGAGACCTACCGAGCCAACAGTGGTAGGCCAGCAATCACAACTTGAACAAGTTTGGAAA
TGTCTTGTAGAAGGATCAGCGGGAATCATTGGCCTTTATGGCATGGGCGGTGTCGGTAAA
ACTACACTATTGACTCATATCAACAATAAATTTCTTCAGAGTTCAACCGATTTTGATTTT
GTGATATGGGTCGTAGTGTCAAAAGATCTGCAAATTGAAAAAATCCAAGAATCTATCGGG
GAGAAGATAGGTTTGTTGAATGACACATGGAAAAATAGAAGAATTGAACAGAAAGCTCTA
GACATCTTCAGGATTTTGAAGAAGAAGAAGTTTGTTCTGTTGCTAGATGACATATGGCAG
CGAGTTGATTTAGTAAAAGTGGGTGTCCCTCTTCCTAGTCCACAAAAAAGCAGTGAATCC
AAAGTAAAAGTGGGTGACCCTCTTCCTAGTCCAGAAAAAAGTAGTGAATCCAAAGTGGTA
TTCACAACCCGTTCCGAAGAAGTTTGTGGTTGGATGGAAGCTCACCAGAACTTTAAAGTG
GCATGCTTATCACACAACGACGCTTGGGAATTGTTTCAACAGAAAGTTGGGGAAGAAACA
TTGAATTGTCATCCTGAAATACTTGAGCTGGCCCGAACAGTAGCAAAGGAATGTGGGGGT
TTGCCACTAGCACTTATTACCATTGGCCGAGCTATGGCTTGTAAGAAAAGACCTGAAGAA
TGGAAATATGCAATTGAGGTGTTAAGAACATCAAGTTCTCAGTTTGCAGGTTTGGGAAAC
GAGGTTTATCCTCTTTTGAAATTCAGTTATGATAATTTGCCAAATGACACAATTAAATCT
TGTCTCTTATATTGTAGTTTATATCCAGAAGATTGTCTTATTTCTAAAGAGAATTTGATA
GATTGTTGGATTGGAGAGGGTCTTTTGAATGAAAGTGTCAAGTTTGGAGTTCAAAAGGAA
GGATACCACATCGTGGGCATTCTTGTTCGTGCATGTTTGTTAGAAGAGGTAGGAGATGAT
GATGTAAAATTGCACGATGTAATTCGTGATATGGCTTTATGGATAGCATGCGACATTGAG
AAGGAGAAAGAGAACTATTTGGTTTATGCAGGTGCTGGATTAACTGAGGTGCAAGATGTC
AGAGAATGGGAAAAGGTAAGGAGATTGTCGTTGATGGAAAATCAAATTAAAGTTATACTA
GGGATGCCTCGATGCCCTCACCTCCTTACTTTATTTCTCAACAATAATGTTAAGTTGAGG
ATCTCTGATGGCTTCCTTCAGTATATGTCTTCTCTCAAAGTTTTAAGCCTGTCACACAAT
GAGGTACTATTCGAGTTACCTTCAGATATTTCAAGGTTGGTTTCACTTGAACTACTTGAT
CTTTCAAACTCACGAATAAGAGAGTTGCCAGAAGAGTTAGCGGCGTTGGTAAATCTTAAA
TGTTTGAATTTGGAATATACATTTGATTTAGCTAAGATTCCTTGGAATCTGATATCTAAT
TTTTCAAGGTTACATGTGCTGAGAATGTTTGGTAATGCAATAAGAAGCGGTTCATTTGAT
GGGGATGAACTCATGGTAAAGGAATTGCTTGGTTTGAAACATTTAGAGGTATTGAGCTTC
ACCTTGCGAAGTTCTCATGCCCTCAAAAGTTTTTTGACCTCGCATCAGTTAAGAAGTTGT
ACACAAGCTCTGCTCCTCCATTGCTTCAAGGATTCATCGCTTGATGTTTCAGGTTTAGCA
GACCTGAAGCAGCTCAACAGACTACGGATTGCAGACTGTCCTGAATTGGTAGAATTGAAG
ATTGATTATAAAGGGGAAGCACAACAGTTTTGTTTCCAAAGCCTTCGCGTGGTTGTAATA
GACCTTTGCATAGGATTGAAGGACTTGACATTCCTTGTTTTTGCTTCGAACCTCAAGTCT
ATTGAAGTAAGAAGTTGTTTTGCCATGGAAGACATCATAAGTGTGGGAAAATTTGCTGAT
TTTCCAGAAGTGATGGCAAATCTAAACCCTTTTGCAAAACTCCAATATCTTCAATTAGCT
GGTCTGCCAAATCTGAAGAGCATTTACTGGAAGCCCCTGCCCTTCTCACATTTGAAAGAA
ATGAGTGTATTTAATTGCGATAAGCTTAAAAAGCTTCCACTTGACTCCAATACTGCGAAG
GAGTGTAAACTTGTTATTTGTGGAGAACCAGACTGGTGGAAAGAGCTTCGATGGGAGGAC
AAACCAACTCAAGATGCTTTTCTTCCCTGTTTCAAATCTTTTTGAGTGGAGTTTTTTAAT
TCCTGAGCAGTGAATATTGTATTTGATTTCTGGTGTGATGCCTGCTTTTCCTTGCATTCT
TCTTGTTAATTCCTTTCATGTGAAAAAGGTTCTGTTTCTTACATGCCCATTTTCTTGTTC
TATTTGCTGAAAATAATTTTATGACGACAAAATGTATGAAAATTAATTACTAGCATTTTT
AAGAAGCACAAGTAGAGGGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGGTACTTCAATCC