Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Citrus sinensis ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Citrus sinensis

CDS Sequence

CDS ID	Cs1g06620.1
CDS Infomation	gene=Cs1g06620
Sequence	ATGAAAACCCCGGTGTCTGATGGTGATGGTTCTGTCTCAAAGAGGACGTTGAGGAAGAAA GTGGGTCTGCGGAATTATGATGAGAATTTGATGGATGAGTTGATAGAGGGGCATTTAGGT GGCTCTTTCAAAAAAAGGAATAGAACTAGAGAGGCTTTGGAGAAAGAGACTGAAACTGAG GCTATGATTGCATTTTCATTGGGGTTTCCGATTGATGCACTGCTTGAGGAGGAAATTCGA GCAGGGGTGGTGGGGGTATTGGGTGGGAAAGAGCAGAATGACTACATTGTTGTGCGGAAT CATATTCTTGCTAGGTGGAGAGGCAATGTGAGGGTGTGGCTAACGAAAGGGCAGATTAAA GAGACTGTGAGTAGCGAGTATGAACATTTGATGAATTCGGCTTATGATTTTCTTTTGTAT AATGGGTATATCAATTTCGGCGTTGCGCCATCTTTTACTGCTAATATGCCAGAGGAGGCA AATGAAGGTTCTGTGATAATTGTTGGTGCTGGACTTGCTGGGCTAGCAGCAGCAAAGCAG CTCATGTCATTTGGTTTCAAGGTTGTTGTTTTAGAAGGCAGGAGTCGACCTGGGGGTAGA GTTTATACTCAAAAGATGGGTAAGAAGGGTGAATTTGCAGCTGTGGATCTCGGTGGGAGT GTTATTACTGGAATTCATGCCAATCCTCTTGGAGTTTTGGCGAGGCAACTCTCTATTCCG CTTCATAAAGTCAGAGATAATTGCCCTTTGTACAAGCCAGACGGGGCACCTGTCAATAAA GAAATTGATTCCAAGGTTGAATTCATCTTCAATAAGTTGCTTGACAAAGTCATGGAGTTG AGAAAAATAAAGGGCGGATTTGCAAATGATGTTTCTCTTGGTTCAGTTTTGGAGACACTT AGACAATTGTATGCTGTGGCTAGAAGTACTGAGGAAAGGGAACTTCTTGATTGGCATCTT GCTAACTTGGAATATGCAAATGCAGGATGTCTTTCAGATCTCTCAGCTACCTATTGGGAT CAGGATGATCCTTATGAAATGGGTGGGGATCATTGTTTTCTTGCTGGAGGGAATTGGAGA TTGATAAAAGCATTGTGTGAAGGAGTTCCTATATTCTATGAGAAGACTGTGAATACTATA AAGTATGGAAATGAAGGGGTTGAGGTGATTGCTGGCGACCAAATGTTTCAAGCAGATATG GTACTTTGCACCGTGCCACTTGGAGTTCTGAAGGAAAAGACAATCAAATTTGAACCAGAG TTACCTCAGAGAAAGGTTGCAGCAATTGATAGATTGGGTTTCGGGCTCCTTAATAAAGTT GCGATGGTTTTCCCATATGTGTTTTGGGGTGAAGAACTGGACACATTTGGTTGTCTCAAT GAACAGAGCAGTAAGCGTGGAGAATTTTTTTTGTTCTATGGTTACCATACCGTTTCTGGA GGTCCTGTGCTAAATGCACTGGTGGCTGGAGAAGCTGCAAAAACTTTTGAATCCATGGAT CCATCCTTTTTGCTCCATCGTGTTTTAAATGTCCTTAGAGGTATATATAATCCAAAAGGT ATTGATGTGCCAGATCCCTTACAAACAATATGTACAAGGTGGGGCAGTGACCCCTTTACC CATGGTTCATACTCTCATGTTAGGGTGCGCTCATCTGGTAGTGATTATGATATACTTGCG GAAAGTGTAGGAAGCCGGCTGTTCTTTGCTGGTGAGGCCACAACGAGGCAATATCCAGCC ACCATGCATGGAGCCTATTTGAGTGGCTTGAGAGAAGCTTCACGCATTCTTCGAGCTACA AGAGTTCAGAAATATAATTCAAGGAGGTCTCTTCTGAGAAATGTTGGATCAAGCAATGAC ATACTGCTGGATCTATTCAGGAGACCTGATATGGAATTTGGAAAGTTTTTGTTTGTATTC AATCCTTTAACAGAAGATCCAAAGTCATTGGGGCTTTTGAGAGTTATGTTTGAGAATTGT GAAGATGATTTGAGAAAGGCTTCAGCTAACAGCTGTCAGAACCCCTTGAACCTTCCACTC TACACTCTGATATCTCGTGAGCAGGCGAATGAGCTACAACAGGTGATCGGAGGGAATGAA AGTAAGTTGTCCTATTTGACTAAAAATCTTGGGTTGAAGCTAATGGGATCTAGTGCTTTA GGAACTGTAGGTAGTTCTTTGATTGCTAATATTGCTAATGCACGAAGAGGAAGGGGTAGG AACCGCATTGCTGCCGGGCAACGACAAATTACCATGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Cs1g06620.1
PEP Infomation
Sequence	MKTPVSDGDGSVSKRTLRKKVGLRNYDENLMDELIEGHLGGSFKKRNRTREALEKETETE AMIAFSLGFPIDALLEEEIRAGVVGVLGGKEQNDYIVVRNHILARWRGNVRVWLTKGQIK ETVSSEYEHLMNSAYDFLLYNGYINFGVAPSFTANMPEEANEGSVIIVGAGLAGLAAAKQ LMSFGFKVVVLEGRSRPGGRVYTQKMGKKGEFAAVDLGGSVITGIHANPLGVLARQLSIP LHKVRDNCPLYKPDGAPVNKEIDSKVEFIFNKLLDKVMELRKIKGGFANDVSLGSVLETL RQLYAVARSTEERELLDWHLANLEYANAGCLSDLSATYWDQDDPYEMGGDHCFLAGGNWR LIKALCEGVPIFYEKTVNTIKYGNEGVEVIAGDQMFQADMVLCTVPLGVLKEKTIKFEPE LPQRKVAAIDRLGFGLLNKVAMVFPYVFWGEELDTFGCLNEQSSKRGEFFLFYGYHTVSG GPVLNALVAGEAAKTFESMDPSFLLHRVLNVLRGIYNPKGIDVPDPLQTICTRWGSDPFT HGSYSHVRVRSSGSDYDILAESVGSRLFFAGEATTRQYPATMHGAYLSGLREASRILRAT RVQKYNSRRSLLRNVGSSNDILLDLFRRPDMEFGKFLFVFNPLTEDPKSLGLLRVMFENC EDDLRKASANSCQNPLNLPLYTLISREQANELQQVIGGNESKLSYLTKNLGLKLMGSSAL GTVGSSLIANIANARRGRGRNRIAAGQRQITM*

Transcript Sequence

Transcript ID	Cs1g06620.1
Transcript Infomation	gene=Cs1g06620 CDS=386-2644
Sequence	CTAAATCACAATGCCTCCGAAGCATAACAGCTTCTAACTAATCTTTATTCTCAAATTCGA ACCCCAAGAAGGTCAGTTGACTCTTCCTACTTCAATTCTTTGCATAATTCATATTTTTTT AATTCAACTTCGATTCCAAATTCATAAGTGCTTTGATGTTTGTTTTAGCCAAACTTGTTA GTTAAATTCTTTTGTGTTGATTATGGTTATTGATTCACAAGAATATTTGTATATTCGTCG TGGGATTAAGTGAAAATGGAAGGAAATGATACCCATTTGCCAATATTTTGTGTTACGAGT AAATGTTAGTGTGGCTTGCAAGACTGATGCTTCTATAGAAACAATTTGATAATTCTTGCT GAGAGAATTTTAGGTATATGTAATAATGAAAACCCCGGTGTCTGATGGTGATGGTTCTGT CTCAAAGAGGACGTTGAGGAAGAAAGTGGGTCTGCGGAATTATGATGAGAATTTGATGGA TGAGTTGATAGAGGGGCATTTAGGTGGCTCTTTCAAAAAAAGGAATAGAACTAGAGAGGC TTTGGAGAAAGAGACTGAAACTGAGGCTATGATTGCATTTTCATTGGGGTTTCCGATTGA TGCACTGCTTGAGGAGGAAATTCGAGCAGGGGTGGTGGGGGTATTGGGTGGGAAAGAGCA GAATGACTACATTGTTGTGCGGAATCATATTCTTGCTAGGTGGAGAGGCAATGTGAGGGT GTGGCTAACGAAAGGGCAGATTAAAGAGACTGTGAGTAGCGAGTATGAACATTTGATGAA TTCGGCTTATGATTTTCTTTTGTATAATGGGTATATCAATTTCGGCGTTGCGCCATCTTT TACTGCTAATATGCCAGAGGAGGCAAATGAAGGTTCTGTGATAATTGTTGGTGCTGGACT TGCTGGGCTAGCAGCAGCAAAGCAGCTCATGTCATTTGGTTTCAAGGTTGTTGTTTTAGA AGGCAGGAGTCGACCTGGGGGTAGAGTTTATACTCAAAAGATGGGTAAGAAGGGTGAATT TGCAGCTGTGGATCTCGGTGGGAGTGTTATTACTGGAATTCATGCCAATCCTCTTGGAGT TTTGGCGAGGCAACTCTCTATTCCGCTTCATAAAGTCAGAGATAATTGCCCTTTGTACAA GCCAGACGGGGCACCTGTCAATAAAGAAATTGATTCCAAGGTTGAATTCATCTTCAATAA GTTGCTTGACAAAGTCATGGAGTTGAGAAAAATAAAGGGCGGATTTGCAAATGATGTTTC TCTTGGTTCAGTTTTGGAGACACTTAGACAATTGTATGCTGTGGCTAGAAGTACTGAGGA AAGGGAACTTCTTGATTGGCATCTTGCTAACTTGGAATATGCAAATGCAGGATGTCTTTC AGATCTCTCAGCTACCTATTGGGATCAGGATGATCCTTATGAAATGGGTGGGGATCATTG TTTTCTTGCTGGAGGGAATTGGAGATTGATAAAAGCATTGTGTGAAGGAGTTCCTATATT CTATGAGAAGACTGTGAATACTATAAAGTATGGAAATGAAGGGGTTGAGGTGATTGCTGG CGACCAAATGTTTCAAGCAGATATGGTACTTTGCACCGTGCCACTTGGAGTTCTGAAGGA AAAGACAATCAAATTTGAACCAGAGTTACCTCAGAGAAAGGTTGCAGCAATTGATAGATT GGGTTTCGGGCTCCTTAATAAAGTTGCGATGGTTTTCCCATATGTGTTTTGGGGTGAAGA ACTGGACACATTTGGTTGTCTCAATGAACAGAGCAGTAAGCGTGGAGAATTTTTTTTGTT CTATGGTTACCATACCGTTTCTGGAGGTCCTGTGCTAAATGCACTGGTGGCTGGAGAAGC TGCAAAAACTTTTGAATCCATGGATCCATCCTTTTTGCTCCATCGTGTTTTAAATGTCCT TAGAGGTATATATAATCCAAAAGGTATTGATGTGCCAGATCCCTTACAAACAATATGTAC AAGGTGGGGCAGTGACCCCTTTACCCATGGTTCATACTCTCATGTTAGGGTGCGCTCATC TGGTAGTGATTATGATATACTTGCGGAAAGTGTAGGAAGCCGGCTGTTCTTTGCTGGTGA GGCCACAACGAGGCAATATCCAGCCACCATGCATGGAGCCTATTTGAGTGGCTTGAGAGA AGCTTCACGCATTCTTCGAGCTACAAGAGTTCAGAAATATAATTCAAGGAGGTCTCTTCT GAGAAATGTTGGATCAAGCAATGACATACTGCTGGATCTATTCAGGAGACCTGATATGGA ATTTGGAAAGTTTTTGTTTGTATTCAATCCTTTAACAGAAGATCCAAAGTCATTGGGGCT TTTGAGAGTTATGTTTGAGAATTGTGAAGATGATTTGAGAAAGGCTTCAGCTAACAGCTG TCAGAACCCCTTGAACCTTCCACTCTACACTCTGATATCTCGTGAGCAGGCGAATGAGCT ACAACAGGTGATCGGAGGGAATGAAAGTAAGTTGTCCTATTTGACTAAAAATCTTGGGTT GAAGCTAATGGGATCTAGTGCTTTAGGAACTGTAGGTAGTTCTTTGATTGCTAATATTGC TAATGCACGAAGAGGAAGGGGTAGGAACCGCATTGCTGCCGGGCAACGACAAATTACCAT GTAGACATGCTATCAGTAAATTCTAGTACTTTTTTCCCTTCTCAGTTGCAAATTCTTGTA CATAACATGATAGATCTCTAGGTTATTCATTAACTCCAAGAGAAATAAGTTTCTTGGAGT TTGACTGGGAAAGCTCATTTGTTTGTTGTAGAGGACGTTTTAGTTTTGTCAGTGACCAAC ATGGTAGTGCTTCATCCATAATGTAGCCTTGTAGGTCAAAGACTGCTTTCTGGAAACAGT TTGTAGCTTGTAGATTCCATTGTAGAGAATTCATTGGAATTTTGGCTGCCTTTTGTCCCT GCAAATGGATATCATATTCGAACATTTCATTTTTATTGTACAACATCTTTCACATCTTTT ACATCAGTTGCATGATACGTTGATACTCAATTTGGCCGAGTTCGCTTTTTACTAGTCTGA AAATGTGCTGGTGATTTTTCACACTGATTGATAGGGATTGATTTTTCCAACCTATTAACT CTTTCCTCCTAGTTGGTTCAACTGTTAAAATTTGAGGGTGCTAGTTGCTAGTTGGTTCAA TTAGTGAAATAGTAAATGAGGTTTGAAAATTCATATTTTGCTTGCATTATGATTGAGGGA TGGGTTACATCTATGTAATGATTATTTAAAAAATAAAAAGTAACCCATCAACCTATCAAA TATATGACACTCAAGTTCAACCAACAATAAAAAGTTGTGCACTTATATTATAGCCCTGTT TCATATTATTTATTGTATACTAGTTATGTCGCTTAAAATTATGATTTGGAAATTAAAATG ATTTTAGTTCGTAGATGTTTGGTGGAAATACACATTTATTAACACTTAACAACCTTAAAA ACTCAATTCAATCATATTTATCAAACATCAATTT