Zea mays| ゲノム配列名 | Bio Sample | アセンブリレベル | アノテーション (gff / gff3) |
遺伝子 (cds / gene) |
Hayai Annotation ZEN |
トランスクリプト (cDNA / mRNA) |
タンパク (pep / aa) |
ダウンロード | JBrowse | コメント |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
B73 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
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NA |
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inbred line Mo17 |
Chromosome |
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● |
● |
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NA |
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inbred line B84 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
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NA |
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inbred line LH145 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
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inbred line NKH8431 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
|||
inbred line PHB47 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
|||
inbred line PHJ40 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
|||
ssp. mays, cv. Dan340 |
Chromosome |
● |
● |
● |
|
NA |
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ssp. mays, inbred line SK |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
配列の種類 |
Bio Sample | 配列名 | Accession | JBrowse | コメント | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
B73 RefGen_v4 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
FV2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B73 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B73 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
inbred line Mo17 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
TIL11 |
|
subsp. parviglumis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Golden Glow cycle 30 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Golden Glow cycle 0 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pools of 44 maize inbred lines, rep2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pools of 37 maize inbred lines, rep2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PHG35 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PH207 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
LH123HT |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
LH1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Four-row Wax |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
inbred line Mo17 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B73 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PHJ89 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B96 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B75 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
LH146Ht |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
A188 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
landraces |
|
subsp. parviglumis |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B73 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Hi II bombardment event 4 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
SK |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GY386B |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B111 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
TY4 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
DH3732 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML423 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL132 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML290 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL11 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
S37 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML134 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL53 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ry713 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Shen5003 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ry737 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GEMS30 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BK |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BT1 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL111 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
JH96C |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
HB |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
TY3 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Sy1039 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL119 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML285 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Nan21-3 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML325 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Lv28 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gy220 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Ye107 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Mo17 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
D047 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GEMS6 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Zheng22 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Q1261 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL22 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML479 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL89 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Dan599 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL116 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML471 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL144 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL50 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML226 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
P178 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL83 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Gy1032 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL20 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL95 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL40 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL44 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Si446 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
R15X1141 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
TY8 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
4F1 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
975-12 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Dan340 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
HYS |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
384-2 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
303WX |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL115 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL35 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL100 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
K22 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML228 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIMBL49 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CML169 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
EP1 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
B49 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PH207 |
|
subsp. mays |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
DK105 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
EP1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
F7 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PH207 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
MinimaizeA |
|
subsp. mays |
|||||
