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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Zea mays subsp. mays , Maize, Corn (ssp. mays) , トウモロコシ (mays変種)

Zea mays

Genome Assembly ID:t4577.G009

配列名:D340

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 D340 系統名 ssp. mays, cv. Dan340
配列数 2,223 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 2,345,812,519 N50長 (bp) 222,765,871
遺伝子の数 39,718 遺伝子数由来ファイル D340_PEP.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio sequel II, Illumina, Hi-C 取得した配列量 27x (PacBio), 34x (Illumina), 130x (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm, BWA v0.7.8, ALLHiC v0.8.12 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Fengge Wang (Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences (BAAFS)) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.46471/gigabyte.63 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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