配列名:D340
ゲノム配列名 | D340 | 系統名 | ssp. mays, cv. Dan340 |
配列数 | 2,223 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 2,345,812,519 | N50長 (bp) | 222,765,871 |
遺伝子の数 | 39,718 | 遺伝子数由来ファイル | D340_PEP.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio sequel II, Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 27x (PacBio), 34x (Illumina), 130x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | Hifiasm, BWA v0.7.8, ALLHiC v0.8.12 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Fengge Wang (Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences (BAAFS)) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.46471/gigabyte.63 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |