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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Zea mays , Maize, Corn , トウモロコシ

Zea mays

Genome Assembly ID:t4577.G005

配列名:ZmaysLH145_682_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ZmaysLH145_682_v1.0 系統名 inbred line LH145
配列数 1,584 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 2,181,862,048 N50長 (bp) 219,344,081
遺伝子の数 35,475 遺伝子数由来ファイル ZmaysLH145_682_v1.2.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel I 取得した配列量 112.3x
アセンブリ方法 MECAT v1.2 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 C. Robin Buell (Michigan State University) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1002/tpg2.20114 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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相補鎖を出力する
fasta
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