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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Zea mays , Maize, Corn , トウモロコシ

Zea mays

Genome Assembly ID:t4577.G001

配列名:B73 RefGen_v4

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 B73 RefGen_v4 系統名 B73
配列数 267 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 2,135,083,061 N50長 (bp) 223,902,240
遺伝子の数 131,585 遺伝子数由来ファイル Zea_mays.B73_RefGen_v4.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 131,585 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 65x
アセンブリ方法 Celera Assembler v. CA 8.3rc2 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,665
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Doreen Ware (Cold Spring Harbor Laboratory) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/nature22971 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.9%[S:88.9%,D:9.0%],F:1.1%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.0%[S:41.0%,D:54.0%],F:3.3%,M:1.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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