配列名:B73 RefGen_v4
ゲノム配列名 | B73 RefGen_v4 | 系統名 | B73 |
配列数 | 267 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 2,135,083,061 | N50長 (bp) | 223,902,240 |
遺伝子の数 | 131,585 | 遺伝子数由来ファイル | Zea_mays.B73_RefGen_v4.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 131,585 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 65x |
アセンブリ方法 | Celera Assembler v. CA 8.3rc2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,665 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Doreen Ware (Cold Spring Harbor Laboratory) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature22971 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:88.9%,D:9.0%],F:1.1%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.0%[S:41.0%,D:54.0%],F:3.3%,M:1.7%,n:1614 |