アセンブルされた配列

Peanut, Groundnut , ラッカセイ , Peanut, Groundnut , ラッカセイ , GenBank , EMBL , DDBJ

ゲノム配列名 Bio Sample アセンブリレベル アノテーション
(gff / gff3)
遺伝子
(cds / gene)
Hayai
Annotation
ZEN
トランスクリプト
(cDNA / mRNA)
タンパク
(pep / aa)
ダウンロード JBrowse コメント

Tifrunner.gnm1.KYV3

cv. Tifrunner

Pseudomolecules

Arachis hypogaea cv. Tifrunner is a runner-type peanut (registration number CV-93, PI 644011) with resistance to several peanut diseases like the leaf spot and TSWV/spotted wilt.

Tifrunner.gnm2.J5K5

cv. Tifrunner

Pseudomolecule

The detail of the changes from version 1 to version 2 is described in README.J5K5.yml file and https://peanutbase.org/peanut_genome_v1_v2. Arachis hypogaea cv. Tifrunner is a runner-type peanut (registration number CV-93, PI 644011) with resistance to several peanut diseases like the leaf spot and TSWV/spotted wilt.

SRA配列

配列の種類

Bio Sample 配列名 Accession JBrowse コメント

Tifrunner.gnm1.KYV3

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

DER

DRA005803

DRX086338

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

VL 1

DRA005803

DRX086339

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

110

DRA005805

DRX086353

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

110(S)

DRA005805

DRX086354

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICGV 86855

DRA006239

DRX099905

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

VG 9514

DRA006239

DRX099906

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

WGS-HIFNIL-bulkR

DRA006500

DRX114954

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

WGS-HIFNIL-bulkS

DRA006500

DRX114955

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

zhonghua16

SRA345359

SRX1556882

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

zhonghua16

SRA345359

SRX1556883

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

zhonghua16

SRA345359

SRX1556885

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

zhonghua16

SRA345359

SRX1556886

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105333

var. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Virginia

SRA459965

SRX2105334

subsp. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105335

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Virginia

SRA459965

SRX2105336

subsp. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105337

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105338

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Uncertain

SRA459965

SRX2105339

var. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105340

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Exotic

SRA459965

SRX2105341

var. peruviana

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Exotic

SRA459965

SRX2105342

var. hirsuta

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Virginia

SRA459965

SRX2105343

subsp. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Virginia

SRA459965

SRX2105344

subsp. Hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105345

var. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105346

subsp. hypogaea

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Exotic

SRA459965

SRX2105347

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Exotic

SRA459965

SRX2105348

var. hirsuta

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Valencia

SRA459965

SRX2105349

subsp. fastigiata

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Spanish

SRA459965

SRX2105350

var. vulgaris

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105351

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Runner

SRA459965

SRX2105352

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

GP-NCWS-17

SRA634146

SRX3429945

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Florida07

SRA634146

SRX3429946

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SAMN08477750

SRA656758

SRX3659176

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG11515

SRA838493

SRX5286200

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG15232

SRA838493

SRX5286201

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG11651

SRA838493

SRX5286202

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG4998

SRA838493

SRX5286203

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG14985

SRA838493

SRX5286204

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG4729

SRA838493

SRX5286205

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG334

SRA838493

SRX5286206

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG5662

SRA838493

SRX5286207

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG10701

SRA838493

SRX5286208

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

ICG5663

SRA838493

SRX5286209

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Tifrunner PI 644011

SRA865748

SRX5574049