配列名:Tifrunner.gnm1.KYV3
ゲノム配列名 | Tifrunner.gnm1.KYV3 | 系統名 | cv. Tifrunner |
配列数 | 384 | 染色体数 | 2n = 4x = 40 |
配列長 (bp) | 2,556,916,893 | N50長 (bp) | 135,150,084 |
遺伝子の数 | 84,714 | 遺伝子数由来ファイル | arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 84,714 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 48.25x |
アセンブリ方法 | MECAT v. 2017-07, Arrow v. 2017-07 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,807 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Arachis hypogaea cv. Tifrunner is a runner-type peanut (registration number CV-93, PI 644011) with resistance to several peanut diseases like the leaf spot and TSWV/spotted wilt. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | David J. Bertioli (University of Georgia), Scott A. Jackson (ditto), Jeremy Schmutz (HudsonAlpha Institute of Biotechnology) | データソース名 | PeanutBase |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-019-0405-z | データソースURL | https://peanutbase.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.2%[S:13.5%,D:85.7%],F:0.4%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.9%[S:10.4%,D:85.5%],F:0.9%,M:3.2%,n:1614 |