Arachis hypogaea配列名：Tifrunner.gnm2.J5K5
| 配列名 | Tifrunner.gnm2.J5K5 | 系統名 | cv. Tifrunner |
| 配列数 | 442 | 染色体数 | 2n = 4x = 40 |
| 配列長 (bp) | 2,557,413,415 | N50長 (bp) | 135,027,066 |
| 遺伝子の数 | 67,150 | 遺伝子数由来ファイル | arahy.Tifrunner.gnm2.ann1.4K0L.protein_primaryTranscript.faa |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 67,002 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 48.25x |
| アセンブリ方法 | MECAT v. 2017-07, Arrow v. 2017-07, | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
| シーケンシングの方法のコメント | コメント | The detail of the changes from version 1 to version 2 is described in README.J5K5.yml file and https://peanutbase.org/peanut_genome_v1_v2. Arachis hypogaea cv. Tifrunner is a runner-type peanut (registration number CV-93, PI 644011) with resistance to several peanut diseases like the leaf spot and TSWV/spotted wilt. | |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-019-0405-z | 責任著者 | David J. Bertioli (University of Georgia), Scott A. Jackson (ditto), Jeremy Schmutz (HudsonAlpha Institute of Biotechnology) |
| データソース名 | PeanutBase | データソースURL | https://peanutbase.org/ |
| BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:99.1%[S:13.4%,D:85.7%],F:0.4%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.9%[S:10.4%,D:85.5%],F:0.9%,M:3.2%,n:1614 |
