アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Peanut, Groundnut , ラッカセイ

Arachis hypogaea

Genome Assembly ID:t3818.G002

配列名:Tifrunner.gnm2.J5K5

ゲノム配列の詳細

配列名 Tifrunner.gnm2.J5K5 系統名 cv. Tifrunner
配列数 442 染色体数 2n=40
配列長 (bp) 2,557,413,415 N50長 (bp) 135,027,066
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル arahy.Tifrunner.gnm2.ann1.4K0L.protein_primaryTranscript.faa
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 48.25x
アセンブリ方法 MECAT v. 2017-07, Arrow v. 2017-07, 推定ゲノムサイズ (Mb) 0
シーケンシングの方法のコメント コメント The detail of the changes from version 1 to version 2 is described in README.J5K5.yml file and https://peanutbase.org/peanut_genome_v1_v2. Arachis hypogaea cv. Tifrunner is a runner-type peanut (registration number CV-93, PI 644011) with resistance to several peanut diseases like the leaf spot and TSWV/spotted wilt.
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0405-z 責任著者 David J. Bertioli (University of Georgia), Scott A. Jackson (ditto), Jeremy Schmutz (HudsonAlpha Institute of Biotechnology)
データソース名 PeanutBase データソースURL https://peanutbase.org/

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