配列名:Tifrunner.gnm2.J5K5
配列名 | Tifrunner.gnm2.J5K5 | 系統名 | cv. Tifrunner |
配列数 | 442 | 染色体数 | 2n=40 |
配列長 (bp) | 2,557,413,415 | N50長 (bp) | 135,027,066 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | arahy.Tifrunner.gnm2.ann1.4K0L.protein_primaryTranscript.faa |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, Hi-C | 取得した配列量 | 48.25x |
アセンブリ方法 | MECAT v. 2017-07, Arrow v. 2017-07, | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 0 |
シーケンシングの方法のコメント | コメント | The detail of the changes from version 1 to version 2 is described in README.J5K5.yml file and https://peanutbase.org/peanut_genome_v1_v2. Arachis hypogaea cv. Tifrunner is a runner-type peanut (registration number CV-93, PI 644011) with resistance to several peanut diseases like the leaf spot and TSWV/spotted wilt. | |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-019-0405-z | 責任著者 | David J. Bertioli (University of Georgia), Scott A. Jackson (ditto), Jeremy Schmutz (HudsonAlpha Institute of Biotechnology) |
データソース名 | PeanutBase | データソースURL | https://peanutbase.org/ |