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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arachis hypogaea , Cultivated Peanut , ラッカセイ, ナンキンマメ

Arachis hypogaea

Genome Assembly ID:t3818.G003

配列名:GCF_003086295.2_arahy.Tifrunner.gnm1.KYV3_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCF_003086295.2_arahy.Tifrunner.gnm1.KYV3_genomic 系統名 Fuhuasheng
配列数 385 染色体数 2n = 4x = 40
配列長 (bp) 2,557,073,284 N50長 (bp) 135,150,084
遺伝子の数 100,775 遺伝子数由来ファイル GCF_003086295.2_arahy.Tifrunner.gnm1.KYV3_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 100,775 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 260x(Illumina)
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC2 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,640
シーケンシングの方法のコメント NA コメント They used BioNano map and linkage map
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xuanqiang Liang (Guangdong Academy of Agricultural Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2019.03.005 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.8%[S:2.3%,D:97.5%],F:0.2%,M:0.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.8%[S:1.5%,D:98.3%],F:0.0%,M:0.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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