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Cucumis sativus

アセンブルされた配列

Cucumis sativus var. sativus , Cucumber (var. sativus) , キュウリ (sativus変種) , Cucumis sativus var. sativus , Cucumber (var. sativus) , キュウリ (sativus変種) , Cucumis sativus var. hardwickii , Wild cucumber (var. hardwickii) , キュウリ野生種 (hardwickii変種) , GenBank , EMBL , DDBJ

ゲノム配列名 Bio Sample アセンブリレベル アノテーション
(gff / gff3)
遺伝子
(cds / gene)
Hayai
Annotation
ZEN
トランスクリプト
(cDNA / mRNA)
タンパク
(pep / aa)
ダウンロード JBrowse コメント

ASM407v2

var. sativus, cv. Chinese Long, inbred line 9930

Chromosome

9930 is a highly inbred line.

ChineseLong_genome_v3

var. sativus, cv. Chinese Long, inbred line 9930

Chromosome

9930 is a highly inbred line.

PI183967_genome

var. hardwickii, accession PI 183967

Chromosome

NA

SRA配列

配列の種類

Bio Sample 配列名 Accession JBrowse コメント

ASM407v2

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

PI401734

SRA276655

SRX1091390

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Cs harwickii

SRA276655

SRX1091575

var. hardwickii

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Straight 8

SRA276655

SRX1091587

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

TMG1

SRA276655

SRX1091638

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174840

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174841

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174843

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174844

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174845

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174846

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174847

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174848

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174849

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174850

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174851

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174853

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174854

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174856

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174857

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174858

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174860

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174861

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174862

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174863

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174864

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174867

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174868

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174869

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174872

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174873

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174874

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174875

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174876

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174877

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174878

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174881

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174882

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174883

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174892

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174893

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174894

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174895

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174896

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174898

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174899

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174900

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174901

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174906

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174907

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174910

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174919

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174922

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174923

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174924

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174925

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174927

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174929

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174932

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174933

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174934

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174936

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174937

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174942

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174943

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174945

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174946

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174948

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174949

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174950

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174952

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174953

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA056480

SRX174954

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

TH118FLM

SRA461784

SRX2134463

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

WMEJ

SRA461784

SRX2134464

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

9930

SRA552008

SRX2712077

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

9930

SRA552589

SRX2720214

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

9930

SRA552636

SRX2720785

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

9930

SRA552661

SRX2721166

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

LOSUAS

SRA642585

SRX3520824

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

BMB

SRA642585

SRX3520825

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

NCG121_NCG121

SRA649277

SRX3580352

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

NCG121_NCG121

SRA649277

SRX3580353

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

mutant vyl

SRA664484

SRX3768383

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

9930 inbred line

SRA685686

SRX3918396

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

cultivated cucumber

SRA721946

SRX4218981

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Xishuangbanna cucumber

SRA721946

SRX4218982

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

early flowering pool

SRA721946

SRX4218983

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

late flowering pool

SRA721946

SRX4218984

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

the pool of 18 susceptible RILs

SRA802628

SRX4969594

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

the pool of 18 resistant RILs

SRA802628

SRX4969595

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

inbred line CCMC

SRA802628

SRX4969596

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

inbred line IL52

SRA802628

SRX4969597

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

wild

SRA172328

SRX626847

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

wild

SRA172328

SRX638324

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

cultivated cucumber

SRA943592

SRX6732042

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

cultivated cucumber

SRA943592

SRX6732043

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

cultivated cucumber

SRA943592

SRX6732044

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

cultivated cucumber

SRA943592

SRX6732045

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Xishuangbanna cucumber

SRA943592

SRX6732046

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Xishuangbanna cucumber

SRA943592

SRX6732047