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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cucumis sativus var. hardwickii , Wild cucumber (var. hardwickii) , キュウリ野生種 (hardwickii変種)

Cucumis sativus

Genome Assembly ID:t3659.G003

配列名:PI183967_genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 PI183967_genome 系統名 var. hardwickii, accession PI 183967
配列数 10,966 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 204,803,225 N50長 (bp) 29,059,649
遺伝子の数 27,425 遺伝子数由来ファイル PI183967_pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 27,425 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 20.9 x
アセンブリ方法 SOAPdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sanwen Huang (Sino-Dutch Joint Laboratory of Horticultural Genomic), Zhonghua Zhang(ditto) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.2801 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:97.9%,D:0.6%],F:0.6%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.6%[S:79.4%,D:15.2%],F:3.7%,M:1.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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