配列名:PI183967_genome
ゲノム配列名 | PI183967_genome | 系統名 | var. hardwickii, accession PI 183967 |
配列数 | 10,966 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 204,803,225 | N50長 (bp) | 29,059,649 |
遺伝子の数 | 27,425 | 遺伝子数由来ファイル | PI183967_pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 27,425 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 20.9 x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sanwen Huang (Sino-Dutch Joint Laboratory of Horticultural Genomic), Zhonghua Zhang(ditto) | データソース名 | CuGenDB |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.2801 | データソースURL | http://cucurbitgenomics.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:97.9%,D:0.6%],F:0.6%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.6%[S:79.4%,D:15.2%],F:3.7%,M:1.7%,n:1614 |