配列名:ChineseLong_genome_v3
ゲノム配列名 | ChineseLong_genome_v3 | 系統名 | var. sativus, cv. Chinese Long, inbred line 9930 |
配列数 | 85 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 226,211,662 | N50長 (bp) | 31,125,843 |
遺伝子の数 | 24,317 | 遺伝子数由来ファイル | ChineseLong_pep_v3.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 24,317 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, 10X, Hi-C | 取得した配列量 | 195.5x |
アセンブリ方法 | CANU 1.7, Pilon, FALCON | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | 9930 is a highly inbred line. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Zhonghua Zhang ( Chinese Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | CuGenDB |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giz072 | データソースURL | http://cucurbitgenomics.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:97.1%,D:1.5%],F:0.5%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.4%[S:93.9%,D:1.5%],F:2.5%,M:2.1%,n:1614 |