Gossypium hirsutum| ゲノム配列名 | Bio Sample | アセンブリレベル | アノテーション (gff / gff3) |
遺伝子 (cds / gene) |
Hayai Annotation ZEN |
トランスクリプト (cDNA / mRNA) |
タンパク (pep / aa) |
ダウンロード | JBrowse | コメント |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Texas Marker-1, TM-1 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
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An inbred line |
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acc. TM-1, isolate 1008001.06 |
Chromosome |
● |
● |
● |
● |
|
NA |
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variety CRI-12, Zhong12 |
Chromosome |
● |
● |
● |
|
NA |
配列の種類 |
Bio Sample | 配列名 | Accession | JBrowse | コメント | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TM-1_V2.1 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
MCBL |
|
phenotype: brown fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
MCWL |
|
phenotype: white fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PD3 |
|
phenotype: brown fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PD93002 |
|
phenotype: white fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X56 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X5 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Acala Maxxa |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X56 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIR 7# |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Simian 3# |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Simian 2# |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Xinluzao 42# |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
86-1.2 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Deltapine 15 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Stoneville 2B |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Shiyuan 321 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Junmian 1# |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIR 12# |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
S1 |
|
P1_fiber_long |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
S2 |
|
P2_fiber_short |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
S3 |
|
pool_fiber_long |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
S4 |
|
pool_fiber_short |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample10 |
|
phenotype: brown fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample15 |
|
phenotype: brown fiber |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample39 |
|
phenotype: brown fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample54 |
|
phenotype: brown fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample74 |
|
phenotype: brown fiber |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample5 |
|
phenotype: brown fiber |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample45 |
|
phenotype: brown fiber |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sample9 |
|
phenotype: brown fiber |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11031 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11026 |
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||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11027 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11029 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11014 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11016 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11018 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11011 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
BYU11034 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Deltapine 15 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace CCRI 2 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace 9053 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Xuzhou 209 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Shanmian 7 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Ekangmian 9 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Zhong 053 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Guannong 1 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Ejing 1 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Chuan 57-681 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace AntongSP 21 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace 52-128 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jingmian 4 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jin 3-34-3 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Lone star |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace MO-3 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jinmian 2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Xuzhou 1818 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Zhong 7263 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace MO-3 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Lone star |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jinyu 3 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jinmian 2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Zhong 7263 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Xuzhou 1818 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Zhong 053 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Ekangmian 9 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Shanmian 3 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Shanmian 7 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Xuzhou 209 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace 9053 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace CCRI 2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Deltapine 15 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jin 3-34-3 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Jingmian 4 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Ejing 1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Guannong 1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace AntongSP 21 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace Chuan 57-681 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Landrace 52-128 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
sGK9708 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X1 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X2 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X3 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X4 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X5 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X4 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
latifolium_13 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Texas Marker-1, TM-1, TM1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Punctatum_25 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Yucatanense_6 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
CIR_12 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
X1 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
paymaster HS26 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
M-240 RNR |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
SureGrow747 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KK1543 |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
611bo |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
108fu |
|
||||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
C1470 |
|
||||||
