配列名:TM-1_V2.1
ゲノム配列名 | TM-1_V2.1 | 系統名 | Texas Marker-1, TM-1 |
配列数 | 12,098 | 染色体数 | 2n = 4x = 52 |
配列長 (bp) | 2,298,437,019 | N50長 (bp) | 107,588,319 |
遺伝子の数 | 72,761 | 遺伝子数由来ファイル | TM-1_V2.1.gene.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 72,761 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | DeNovoMAGIC3, BioNano, Hi-C, and POPSEQ | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,340 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | An inbred line |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Tianzhen Zhang (Zhejiang University) | データソース名 | COTTON GEN |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-019-0371-5 | データソースURL | https://www.cottongen.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:6.9%,D:92.5%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.7%[S:7.2%,D:90.5%],F:0.1%,M:2.2%,n:1614 |