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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium hirsutum , Upland cotton , ワタ (hirsutum種), キヌワタ

Gossypium hirsutum

Genome Assembly ID:t3635.G001

配列名:TM-1_V2.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TM-1_V2.1 系統名 Texas Marker-1, TM-1
配列数 12,098 染色体数 2n = 4x = 52
配列長 (bp) 2,298,437,019 N50長 (bp) 107,588,319
遺伝子の数 72,761 遺伝子数由来ファイル TM-1_V2.1.gene.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 72,761 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC3, BioNano, Hi-C, and POPSEQ 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,340
シーケンシングの方法のコメント NA コメント An inbred line
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tianzhen Zhang (Zhejiang University) データソース名 COTTON GEN
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0371-5 データソースURL https://www.cottongen.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:6.9%,D:92.5%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.7%[S:7.2%,D:90.5%],F:0.1%,M:2.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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