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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium hirsutum var. CRI-12 , Upland cotton (var. CRI-12) , ワタ (hirsutum種), キヌワタ (CRI-12変種)

Gossypium hirsutum

Genome Assembly ID:t3635.G006

配列名:Zhong12

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Zhong12 系統名 variety CRI-12, Zhong12
配列数 542 染色体数 2n = 4x = 52
配列長 (bp) 2,306,151,588 N50長 (bp) 108,016,167
遺伝子の数 72,293 遺伝子数由来ファイル pasa2.longest.filter.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 110.94x
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,380
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wuwei Ye (Zhengzhou University) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giac019 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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