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Vitis labruscana x Vitis vinifera

アセンブルされた配列

Vitis labruscana x Vitis vinifera , Hybrid grape , ブドウ欧米雑種 , Vitis labruscana x Vitis vinifera , Hybrid grape , ブドウ欧米雑種 , Vitis labruscana x Vitis vinifera , Hybrid grape , ブドウ欧米雑種 , GenBank , EMBL , DDBJ

ゲノム配列名 Bio Sample アセンブリレベル アノテーション
(gff / gff3)
遺伝子
(cds / gene)
Hayai
Annotation
ZEN
トランスクリプト
(cDNA / mRNA)
タンパク
(pep / aa)
ダウンロード JBrowse コメント

VSMph_r1.0

cv. Shine Muscat

Scaffold

Haplotype phased sequenece of the highly heterozygous genomes

VSMuph_r1.0

cv. Shine Muscat

Scaffold

Unphased sequence representing 'haploid' genome

VSMuph_r2.0

cv. Shine Muscat

Chromosome

NA

SRA配列

配列の種類

Bio Sample 配列名 Accession JBrowse コメント

VSMuph_r2.0

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Aki_Queen

t2599122_SNP000001_0001

t2599122_SNP000001_0001

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Black_Beat

t2599122_SNP000001_0002

t2599122_SNP000001_0002

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Delaware

t2599122_SNP000001_0003

t2599122_SNP000001_0003

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Fujiminori

t2599122_SNP000001_0004

t2599122_SNP000001_0004

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Grape_Accession1

t2599122_SNP000001_0005

t2599122_SNP000001_0005

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Grape_Accession2

t2599122_SNP000001_0006

t2599122_SNP000001_0006

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Grape_Accession3

t2599122_SNP000001_0007

t2599122_SNP000001_0007

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Grape_Accession4

t2599122_SNP000001_0008

t2599122_SNP000001_0008

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Koshu

t2599122_SNP000001_0009

t2599122_SNP000001_0009

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Muscat_Bailey_A

t2599122_SNP000001_0010

t2599122_SNP000001_0010

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Nagano_Purple

t2599122_SNP000001_0011

t2599122_SNP000001_0011

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Niagara

t2599122_SNP000001_0012

t2599122_SNP000001_0012

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Portland

t2599122_SNP000001_0013

t2599122_SNP000001_0013

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Rosario_Bianco

t2599122_SNP000001_0014

t2599122_SNP000001_0014

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Sekirei

t2599122_SNP000001_0015

t2599122_SNP000001_0015

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Suiho

t2599122_SNP000001_0016

t2599122_SNP000001_0016

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

Takao

t2599122_SNP000001_0017

t2599122_SNP000001_0017