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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vitis labruscana x Vitis vinifera , Hybrid grape , ブドウ欧米雑種

Vitis labruscana x Vitis vinifera

Genome Assembly ID:t2599122.G002

配列名:VSMuph_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 VSMuph_r1.0 系統名 cv. Shine Muscat
配列数 8,696 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 490,143,216 N50長 (bp) 13,153,933
遺伝子の数 26,199 遺伝子数由来ファイル VSMuph_r1.0.transcript1.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 260x
アセンブリ方法 DenovoMAGIC3 推定ゲノムサイズ (Mb) 493
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Unphased sequence representing 'haploid' genome
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/730762 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.5%[S:94.7%,D:1.8%],F:1.5%,M:2.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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