配列名:VSMuph_r1.0
ゲノム配列名 | VSMuph_r1.0 | 系統名 | cv. Shine Muscat |
配列数 | 8,696 | 染色体数 | 2n = 2x = 38 |
配列長 (bp) | 490,143,216 | N50長 (bp) | 13,153,933 |
遺伝子の数 | 26,199 | 遺伝子数由来ファイル | VSMuph_r1.0.transcript1.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 260x |
アセンブリ方法 | DenovoMAGIC3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 493 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Unphased sequence representing 'haploid' genome |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/730762 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.5%[S:94.7%,D:1.8%],F:1.5%,M:2.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |