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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vitis labruscana x Vitis vinifera , Hybrid grape , ブドウ欧米雑種

Vitis labruscana x Vitis vinifera

Genome Assembly ID:t2599122.G001

配列名:VSMph_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 VSMph_r1.0 系統名 cv. Shine Muscat
配列数 15,650 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 1,004,717,561 N50長 (bp) 4,205,710
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 260x
アセンブリ方法 DenovoMAGIC3 推定ゲノムサイズ (Mb) 999
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Haplotype phased sequenece of the highly heterozygous genomes
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/730762 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.3%[S:36.6%,D:60.7%],F:1.5%,M:1.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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