配列名:VSMuph_r2.0
ゲノム配列名 | VSMuph_r2.0 | 系統名 | cv. Shine Muscat |
配列数 | 4,595 | 染色体数 | 2n = 2x = 38 |
配列長 (bp) | 488,971,633 | N50長 (bp) | 23,937,529 |
遺伝子の数 | 32,827 | 遺伝子数由来ファイル | VSMuph_r2.0.1_HC.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 32,827 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | IlluminaPE, MP, 10XGenomics, Hi-C | 取得した配列量 | 529x |
アセンブリ方法 | Denovo MAGIC, Proximo | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 493 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsac040 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 3.0.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.3%[S:93.6%,D:1.7%],F:1.4%,M:3.3%,n:1375 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:88.9%[S:86.1%,D:2.8%],F:5.6%,M:5.5%,n:1375 |