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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Vitis labruscana x Vitis vinifera , Hybrid grape , ブドウ欧米雑種

Vitis labruscana x Vitis vinifera

Genome Assembly ID:t2599122.G003

配列名:VSMuph_r2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 VSMuph_r2.0 系統名 cv. Shine Muscat
配列数 4,595 染色体数 2n = 2x = 38
配列長 (bp) 488,971,633 N50長 (bp) 23,937,529
遺伝子の数 32,827 遺伝子数由来ファイル VSMuph_r2.0.1_HC.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 32,827 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 IlluminaPE, MP, 10XGenomics, Hi-C 取得した配列量 529x
アセンブリ方法 Denovo MAGIC, Proximo 推定ゲノムサイズ (Mb) 493
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsac040 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 3.0.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.3%[S:93.6%,D:1.7%],F:1.4%,M:3.3%,n:1375 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:88.9%[S:86.1%,D:2.8%],F:5.6%,M:5.5%,n:1375

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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