Capsicum annuum| ID | 集団名 | 解析個体 リスト |
変異の 種類 |
参照配列 | 配列の種類 | SNP数 | データ作成者 | コメント | ダウンロード | TASUKE+ | JBrowse | |
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| 表 | Vcf file |
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t4072.SNP000001 |
Capsicum_annuum_SRA_24_lines_20191227 |
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SNPs, In/dels |
WGS |
7,427,806 | Plant GARDEN |
Bwa/bcftools 1.9, (QUAL≥200, 10≤DP≤200, max-missing=0.7) |
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t4072.SNP000002 |
13 Capsicum lines |
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SNPs |
WGS |
103,558,059 | Shirasawa et al. 2022 |
Bowtie2/bcftools 1.9, (QUAL≥20, 8≤DP≤25, max-missing=0.5, maf≥0.05) |
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