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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Capsicum annuum var. annuum , Chilli pepper (annuum) , トウガラシ (annuum変種)

Capsicum annuum

Genome Assembly ID:t4072.G002

配列名:Capsicum.annuum.L_Zunla-1_Release_2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Capsicum.annuum.L_Zunla-1_Release_2.0 系統名 var. annuum, cv. Zunla-1
配列数 13 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 3,363,962,270 N50長 (bp) 229,934,170
遺伝子の数 35,336 遺伝子数由来ファイル Capsicum.annuum.L_Zunla-1_v2.0_PEP.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,336 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 99x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 1.06 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,260
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Luis Herrera-Estrella (Centro de Investigacion y de Estudios Avanzados del Instituto Politecnico Nacional), Ye Yin (Beijing Genomics Institute-Shenzhen), Jiping Yu (Zunyi Academy of Agricultural Sciences), Kailin Hu (South China Agricultural University), Z データソース名 Pepper Genome Database website
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1400975111 データソースURL http://peppersequence.genomics.cn
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.4%[S:95.2%,D:2.2%],F:1.6%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:84.1%[S:82.0%,D:2.1%],F:10.5%,M:5.4%,n:1614

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染色体 /
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fasta
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