配列名:Capsicum.annuum.L_Zunla-1_Release_2.0
ゲノム配列名 | Capsicum.annuum.L_Zunla-1_Release_2.0 | 系統名 | var. annuum, cv. Zunla-1 |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 3,363,962,270 | N50長 (bp) | 229,934,170 |
遺伝子の数 | 35,336 | 遺伝子数由来ファイル | Capsicum.annuum.L_Zunla-1_v2.0_PEP.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 35,336 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 99x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1.06 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,260 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Luis Herrera-Estrella (Centro de Investigacion y de Estudios Avanzados del Instituto Politecnico Nacional), Ye Yin (Beijing Genomics Institute-Shenzhen), Jiping Yu (Zunyi Academy of Agricultural Sciences), Kailin Hu (South China Agricultural University), Z | データソース名 | Pepper Genome Database website |
論文 (DOIコード) | 10.1073/pnas.1400975111 | データソースURL | http://peppersequence.genomics.cn |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.4%[S:95.2%,D:2.2%],F:1.6%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:84.1%[S:82.0%,D:2.1%],F:10.5%,M:5.4%,n:1614 |