配列名:CAN_r1.2.pmol
ゲノム配列名 | CAN_r1.2.pmol | 系統名 | cv. Takanotsume |
配列数 | 12 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 3,058,489,554 | N50長 (bp) | 262,665,162 |
遺伝子の数 | 105,249 | 遺伝子数由来ファイル | CAN_r1.2.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 105,249 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, BioNano, Genetic mapping | 取得した配列量 | 20.8x |
アセンブリ方法 | Hifiasm, BioNano Solve, ALLMAPS | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,168 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | 3.0.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.5%[S:94.8%,D:1.7%],F:0.7%,M:2.8%,n:1375 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.2%[S:88.3%,D:7.9%],F:2.2%,M:1.6%,n:1375 |