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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Capsicum annuum , Chilli pepper (annuum) , トウガラシ

Capsicum annuum

Genome Assembly ID:t4072.G003

配列名:CAN_r1.2.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CAN_r1.2.pmol 系統名 cv. Takanotsume
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 3,058,489,554 N50長 (bp) 262,665,162
遺伝子の数 105,249 遺伝子数由来ファイル CAN_r1.2.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 105,249 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, BioNano, Genetic mapping 取得した配列量 20.8x
アセンブリ方法 Hifiasm, BioNano Solve, ALLMAPS 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,168
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 3.0.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.5%[S:94.8%,D:1.7%],F:0.7%,M:2.8%,n:1375 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.2%[S:88.3%,D:7.9%],F:2.2%,M:1.6%,n:1375

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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