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Aegilops tauschii

アセンブルされた配列

Aegilops tauschii subsp. strangulata , Tausch's goatgrass (ssp. Strangulata) , タルホコムギ (Strangulata亜種) , Aegilops tauschii subsp. strangulata , Tausch's goatgrass (ssp. Strangulata) , タルホコムギ (Strangulata亜種) , GenBank , EMBL , DDBJ

ゲノム配列名 Bio Sample アセンブリレベル アノテーション
(gff / gff3)
遺伝子
(cds / gene)
Hayai
Annotation
ZEN
トランスクリプト
(cDNA / mRNA)
タンパク
(pep / aa)
ダウンロード JBrowse コメント

Aet v4.0

subsp. strangulata, AL8/78

Chromosome

NA

Aet v5.0

subsp. strangulata,, cv. AL8/78

Chromosome

Mis-assemblies in version Aet v4.0 (line95) were corrected with optical maps and gaps were closed using contigs (10.1101/gr.213405.116) assembled from whole-genome-shotgun (WGS) PacBio reads. Assembly revision: BioNano optical maps; Gap closing: PacBio.

SRA配列

配列の種類

Bio Sample 配列名 Accession JBrowse コメント

Aet v4.0

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA026538

SRX037088

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA026538

SRX037891

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA030526

SRX047400

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA030526

SRX047401

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA030526

SRX047402

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA030526

SRX047403

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA030526

SRX047404

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA030526

SRX047405

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA026538

SRX116546

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA026538

SRX124436

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA026538

SRX129979

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA526731

SRX2486775

subsp. strangulata

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748126

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748127

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748133

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748134

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748136

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748137

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

AL8/78

SRA555492

SRX2748140

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

SRA097144

SRX333116

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

not collected

SRA724477

SRX4347760

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

not collected

SRA724477

SRX4347761

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

not collected

SRA724477

SRX4347762

全ゲノムシーケンス (ショートリード)

not collected

SRA724477

SRX4347763