配列名:Aet v4.0
ゲノム配列名 | Aet v4.0 | 系統名 | subsp. strangulata, AL8/78 |
配列数 | 109,583 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 4,224,915,394 | N50長 (bp) | 577,375,663 |
遺伝子の数 | 258,680 | 遺伝子数由来ファイル | Aegilops_tauschii.Aet_v4.0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 258,680 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 200x |
アセンブリ方法 | DeNovoMAGIC v. OCT-2015, SOAPdenovo v. 2.r240 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4,360 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jan Dvorak (University of California), Steven L. Salzberg (Johns Hopkins University School of Medicine), Katrien M. Devos (University of Georgia) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature24486 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:94.5%,D:3.5%],F:1.0%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.8%[S:20.4%,D:76.4%],F:1.6%,M:1.6%,n:1614 |