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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Aegilops tauschii subsp. strangulata , Tausch's goatgrass (ssp. Strangulata) , タルホコムギ (Strangulata亜種)

Aegilops tauschii

Genome Assembly ID:t37682.G001

配列名:Aet v4.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Aet v4.0 系統名 subsp. strangulata, AL8/78
配列数 109,583 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 4,224,915,394 N50長 (bp) 577,375,663
遺伝子の数 258,680 遺伝子数由来ファイル Aegilops_tauschii.Aet_v4.0.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 258,680 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 200x
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC v. OCT-2015, SOAPdenovo v. 2.r240 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,360
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jan Dvorak (University of California), Steven L. Salzberg (Johns Hopkins University School of Medicine), Katrien M. Devos (University of Georgia) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/nature24486 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.0%[S:94.5%,D:3.5%],F:1.0%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.8%[S:20.4%,D:76.4%],F:1.6%,M:1.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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