配列名:Aet v5.0
| ゲノム配列名 | Aet v5.0 | 系統名 | subsp. strangulata,, cv. AL8/78 |
| 配列数 | 109,197 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
| 配列長 (bp) | 4,218,179,011 | N50長 (bp) | 576,238,907 |
| 遺伝子の数 | 58,655 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_002575655.2_Aet_v5.0_protein.faa.gz |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 58,655 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | BioNano optical maps | 取得した配列量 | NA |
| アセンブリ方法 | Bionano Assembler | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Mis-assemblies in version Aet v4.0 (line95) were corrected with optical maps and gaps were closed using contigs (10.1101/gr.213405.116) assembled from whole-genome-shotgun (WGS) PacBio reads. Assembly revision: BioNano optical maps; Gap closing: PacBio. |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | Jan Dvorak (University of California Davis) | データソース名 | NCBI |
| 論文 (DOIコード) | 10.1093/g3journal/jkab325 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
| BUSCO バージョン | 5.8.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:94.6%,D:4.7%],F:0.4%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.3%[S:73.7%,D:25.7%],F:0.2%,M:0.5%,n:1614 |