配列名:Aet v5.0
ゲノム配列名 | Aet v5.0 | 系統名 | subsp. strangulata,, cv. AL8/78 |
配列数 | 109,197 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 4,218,179,011 | N50長 (bp) | 576,238,907 |
遺伝子の数 | 58,655 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_002575655.2_Aet_v5.0_protein.faa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | BioNano optical maps | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Bionano Assembler | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Mis-assemblies in version Aet v4.0 (line95) were corrected with optical maps and gaps were closed using contigs (10.1101/gr.213405.116) assembled from whole-genome-shotgun (WGS) PacBio reads. Assembly revision: BioNano optical maps; Gap closing: PacBio. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jan Dvorak (University of California Davis) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1093/g3journal/jkab325 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |