Theobroma cacao| ゲノム配列名 | Bio Sample | アセンブリレベル | アノテーション (gff / gff3) |
遺伝子 (cds / gene) |
Hayai Annotation ZEN |
トランスクリプト (cDNA / mRNA) |
タンパク (pep / aa) |
ダウンロード | JBrowse | コメント |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Belizean Criollo, genotype B97-61/B2 |
Chromosome |
● |
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Belizean Criollo is a group of relic landraces. |
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Matina 1-6 |
Chromosome |
● |
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● |
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● |
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Matina 1-6 belongs to the most cultivated cacao type. |
配列の種類 |
Bio Sample | 配列名 | Accession | JBrowse | コメント | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Theobroma_cacao_criollo_chr.v2.0 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
fya_162 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
fya_49 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
fya_131 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
fya_130 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
fya_23 |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
fya_150 |
|
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KER-6 |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-246 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-195V |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-195V |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-195V |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-16 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-31 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-31 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-57 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-57 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-257E |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-57 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-257E |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-257E |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
OYA-2B |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
OYA-2B |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pina |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pina |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
OYA-2B |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pina |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KER-1L |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-123V |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KER-1L |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KER-1L |
|
population:Guiana; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-123V |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
GU-123V |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-246 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-81 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-81 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-246 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-70 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-70 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-33 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-33 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-34 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-33 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-34 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-34 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-807 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-807 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-16 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-16 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-13 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-13 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-13 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Amaz-15/15 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Amaz-15/15 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
SPEC-54/1 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
SPEC-54/1 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
SPEC-54/1 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-70 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Amaz-15/15 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
COCA-3370-5 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
COCA-3370-5 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
COCA-3370-5 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Amaz-12 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Amaz-12 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-105 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-105 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-60 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-60 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-60 |
|
population:Iquitos; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Amaz-12 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-105 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
IMC-31 |
|
population:Iquitos; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
ELP-37A |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
ELP-37A |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
ELP-37A |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KER-6 |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
KER-6 |
|
population:Guiana; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-299 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-299 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-107 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-299 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-71 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-279 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-71 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-710 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-807 |
|
population:Nanay; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-916 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-916 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-710 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-710 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pound-7 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pound-7 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
Pound-7 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
NA-916 |
|
population:Nanay; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-107 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-107 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-279 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
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全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-279 |
|
population:Maranon; phenotype:Resistant |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-71 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
|||||
全ゲノムシーケンス (ショートリード) |
PA-81 |
|
population:Maranon; phenotype:Susceptible |
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