配列名:musa_acuminata_v2
ゲノム配列名 | musa_acuminata_v2 | 系統名 | subsp. malaccensis, DH-Pahang |
配列数 | 24 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 450,848,473 | N50長 (bp) | 37,593,364 |
遺伝子の数 | 45,856 | 遺伝子数由来ファイル | musa_acuminata_v2_prot.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 45,856 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454, Sanger | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Newbler | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 523 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A doubled-haploid genotype, obtained from the Musa acuminata subspecies malaccensis accession 'Pahang' |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Gaetan Droc (Centre de cooperation internationale en recherche agronomique pour le developpement (CIRAD)) | データソース名 | Banana Genome Hub |
論文 (DOIコード) | 10.1093/database/bat035 | データソースURL | https://banana-genome-hub.southgreen.fr/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:93.9%,D:4.6%],F:0.6%,M:0.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.4%[S:68.8%,D:29.6%],F:1.1%,M:0.5%,n:1614 |