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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Musa acuminata subsp. malaccensis , Wild banana (acuminata, ssp. Malaccensis)) , バナナ野生種 (acuminata種, malaccensis亜種)

Musa acuminata

Genome Assembly ID:t4641.G001

配列名:musa_acuminata_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 musa_acuminata_v2 系統名 subsp. malaccensis, DH-Pahang
配列数 24 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 450,848,473 N50長 (bp) 37,593,364
遺伝子の数 45,856 遺伝子数由来ファイル musa_acuminata_v2_prot.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 45,856 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454, Sanger 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Newbler 推定ゲノムサイズ (Mb) 523
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A doubled-haploid genotype, obtained from the Musa acuminata subspecies malaccensis accession 'Pahang'
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Gaetan Droc (Centre de cooperation internationale en recherche agronomique pour le developpement (CIRAD)) データソース名 Banana Genome Hub
論文 (DOIコード) 10.1093/database/bat035 データソースURL https://banana-genome-hub.southgreen.fr/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:93.9%,D:4.6%],F:0.6%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.4%[S:68.8%,D:29.6%],F:1.1%,M:0.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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